DiffBindFR

Offene Gewichte Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences April 2024

Keine Schätzung

Keine Hardwareanforderungen für dieses Modell

Die Gewichte dieses Modells sind OPEN, aber es wurde keine Parameteranzahl veröffentlicht. Jede MEMORY- und Geschwindigkeitszahl basiert auf dieser Zahl, daher zeigen wir lieber nichts als eine erfundene Schätzung..

Aufgezeichnet

Volle Spezifikation

Alles, was in unserer Datenbank für dieses Modell aufgezeichnet ist. Der Großteil beschreibt, wie es trainiert wurde, anstatt wie es läuft — nützlicher Kontext zur Beurteilung, wie viel Arbeit darin steckt und wie es sich mit Modellen vergleicht, die in einem anderen Maßstab erstellt wurden..

Ursprung

Wer hat dieses Modell gebaut, wo und wann es veröffentlicht wurde.

Organisation
Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences
Organisationsart
Academia,Research collective
Land
China
Veröffentlicht
9 April 2024
Autoren
Jintao Zhu, Zhonghui Gu, Jianfeng Pei, Luhua Lai

Was es tut

Die Problemfelder, für die das Modell entwickelt wurde. Ein Modell kann mehrere davon tragen.

Domain
Biology
Aufgabe
Protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction

Größe

Wie groß das Modell ist und wie viele Daten damit trainiert wurden. Parameter sind die Zahl, die entscheidet, ob es auf einer bestimmten GPU-Karte passt.

Trainingsdaten
tokens

Data points = 16,739 training structures Note: Epochs (1000) not counted as we only consider unique data points 16,739 = 1.674e4

Training-Compute

Die Berechnung, die durchgeführt wird, um das Modell zu trainieren, gemessen in Gleitpunktoperationen. Es ist ein Maß dafür, was der Trainingslauf gekostet hat, nicht dafür, wie schnell das fertige Modell Ihnen antwortet.

Training-Compute
4 × 10²⁰ FLOP

1. Hardware setup: - Main model: 8× NVIDIA A800 GPUs (7.80×10¹³ FLOP/s per GPU) - MDN model: 4× NVIDIA Tesla V100-SXM2 GPUs (1.25×10¹⁴ FLOP/s per GPU) 2. Training duration (estimated from steps and step time): - Main model: 262,000 steps × 5s = 1.31×10⁶ seconds (~15 days) - MDN model: 65,000 steps × 5s = 3.25×10⁵ seconds (~3.76 days) 3. Utilization rate: 40% 4. Final calculation: Main: 8 GPUs × 7.80×10¹³ FLOP/s × 1.31×10⁶ s × 0.4 = 3.31×10²⁰ FLOPs MDN: 4 GPUs × 1.25×10¹⁴ FLOP/s × 3.25×10⁵ s ×…

Wie es etabliert wurde
Hardware

Verfügbarkeit

Ob Sie das Modell beziehen und es auf Ihrer eigenen Hardware ausführen können, bestimmt, ob eine der Grafikkarten-Zahlen auf dieser Seite zutrifft.

Gewichte
Open — downloadable
Modellzugang
Open weights (unrestricted)
Training-Code
Unreleased

BSD-3-Clause-Clear license https://github.com/HBioquant/DiffBindFR

Wie es klassifiziert ist

Labels, die das Quell-Datenset anwendet, wenn bemerkenswerte Modelle verfolgt werden, und wie zuversichtlich es in den Eintrag ist.

Aufzeichnungsgenauigkeit
Confident
Zitationen
16

Quellen

Woher dieser Datensatz stammt und wann er zuletzt überprüft wurde.

Referenz
DiffBindFR: an SE(3) equivariant network for flexible protein–ligand docking
Zuletzt aktualisiert
1 December 2025

Was die Zahlen bedeuten

Woher es kam

DiffBindFR wurde veröffentlicht von Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences, im Land aufgezeichnet als China, während April 2024. Die Kategorie, in die der Herausgeber fällt, ist academia,Research collective.

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als die Aufgabe von aufgezeichnet protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction.

Veröffentlichte Gewichte bedeuten, dass das Modell auf deinem Rechner läuft und nicht auf dem eines anderen, was die Hardwarefrage unten überhaupt beantwortbar macht.

Was in den Aufbau geflossen ist

Das Training benötigte ein Rechenbudget von ungefähr 4 × 10²⁰ FLOP. Diese Zahl misst die Kosten für die Produktion des MODELLS und hat keinen Einfluss darauf, wie schnell es antwortet.

Antworten

DiffBindFR — Häufige Fragen

01

DiffBindFR— Wofür wird es verwendet?

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als Bewältigung der Aufgabe von protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction. Dies sind die Bereiche, um die es entworfen wurde; sie beschreiben die Absicht und nicht eine harte Grenze.

02

DiffBindFR— Wo kann ich es herunterladen?

Die Gewichte sind veröffentlicht, obwohl wir keinen Repository-Link dafür haben. Diese Seite berechnet die Hardware-Anforderungen, anstatt Modell-Dateien zu hosten.

03

DiffBindFR— Wie viel Rechenleistung wurde verwendet, um es zu trainieren?

Training verbrauchte etwa 4 × 10²⁰ FLOP. Das misst, was die Produktion des Modells gekostet hat, und sagt nichts darüber aus, wie schnell es einmal trainiert antwortet — die Inferenzgeschwindigkeit kommt von der MEMORY-BANDWIDTH, nicht vom TRAINING-BUDGET.

04

DiffBindFR— Welche GPU benötige ich, um es auszuführen?

Wir können nichts sagen. Es hat offene Gewichte, aber es wurde keine Parameteranzahl veröffentlicht, und jede Berechnung von Speicher und Geschwindigkeit basiert auf dieser Zahl. Wir würden lieber nichts zeigen als eine erfundene Schätzung.

05

DiffBindFR— Ist es Open-Source?

Die Gewichte sind veröffentlicht, sodass sie heruntergeladen und auf Ihrer eigenen Hardware ausgeführt werden können. Beachten Sie, dass OPEN WEIGHTS nicht dasselbe wie OPEN SOURCE im vollen Sinne ist — es sagt nichts über die Trainingsdaten, den Trainingscode oder die damit verbundenen kommerziellen Bedingungen aus.

06

DiffBindFR— Wie viele Parameter hat es?

Es wurden keine Parameteranzahlen veröffentlicht, weshalb keine Speicher- oder Geschwindigkeitsangaben auf dieser Seite erscheinen.

07

DiffBindFR— Wer hat es erstellt?

Es wurde veröffentlicht von Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences, basiert auf China, eine als kategorisierte Organisation academia,Research collective.

08

DiffBindFR— Wann wurde es veröffentlicht?

Es wurde veröffentlicht in April 2024. Die Fähigkeit pro Parameter hat sich erheblich verbessert, sodass ein neueres Modell derselben Größe oft die bessere Nutzung derselben Hardware darstellt.

Quelle

Originalveröffentlichung

Letzte Aktualisierung des Protokolls 1 December 2025

Die andere Richtung

Von der anderen Seite aus betrachten?

Diese Seite beginnt mit dem Modell. Wenn Sie bereits eine Karte besitzen und alles wissen möchten, was sie ausführen wird, Starte stattdessen von der Hardware.