Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships

Geschlossene Gewichtungen University of Florida September 2024

Keine Schätzung

Keine Hardwareanforderungen für dieses Modell

Die Gewichte für dieses Modell wurden nicht veröffentlicht, daher kann es nicht heruntergeladen oder auf Ihrer eigenen Hardware in beliebiger Größe betrieben werden. Es ist nur über seinen Anbieter erreichbar, und keine Grafikkarte ändert das..

Aufgezeichnet

Volle Spezifikation

Alles, was in unserer Datenbank für dieses Modell aufgezeichnet ist. Der Großteil beschreibt, wie es trainiert wurde, anstatt wie es läuft — nützlicher Kontext zur Beurteilung, wie viel Arbeit darin steckt und wie es sich mit Modellen vergleicht, die in einem anderen Maßstab erstellt wurden..

Ursprung

Wer hat dieses Modell gebaut, wo und wann es veröffentlicht wurde.

Organisation
University of Florida
Organisationsart
Academia
Land
United States of America
Veröffentlicht
24 September 2024
Autoren
Palash Sethi a, Juannan Zhou

Was es tut

Die Problemfelder, für die das Modell entwickelt wurde. Ein Modell kann mehrere davon tragen.

Domain
Biology
Aufgabe
Protein function prediction

Größe

Wie groß das Modell ist und wie viele Daten damit trainiert wurden. Parameter sind die Zahl, die entscheidet, ob es auf einer bestimmten GPU-Karte passt.

Trainingsdaten
165,428 tokens

Initial calculations by dataset: 1. GRB-1: 129,320 * 0.8 * 33 = 3,414,048 2. GRB-3-abundance: 31,936 * 0.8 * 15 = 383,235 3. GRB-3-binding: 25,967 * 0.8 * 15 = 311,610 4. AAV2-Capsid: 42,328 * 0.8 * 28 = 948,136 5. CreiLOV: 165,428 * 0.8 * 15 = 1,985,130 6. cgreGFP: 26,165 * 0.8 * 234 = 4,898,088 7. ppluGFP: 32,260 * 0.8 * 221 = 5,703,568 8. His3-S2: 116,935 * 0.8 * 28 = 2,619,344 9. His3-S5: 92,408 * 0.8 * 31 = 2,291,706 10. His3-S12: 62,305 * 0.8 * 19 = 947,036 Final sum: 3,414,048 + 383,235 …

Der Trainingslauf

Was es physisch gekostet hat, um zu trainieren: welche Chips, wie viele, wie lange und was das aus der Wand gezogen hat.

Trainingshardware
NVIDIA A100
Verwendete Chips
1
Stromverbrauch
433 W

Wie es klassifiziert ist

Labels, die das Quell-Datenset anwendet, wenn bemerkenswerte Modelle verfolgt werden, und wie zuversichtlich es in den Eintrag ist.

Aufzeichnungsgenauigkeit
Confident

Quellen

Woher dieser Datensatz stammt und wann er zuletzt überprüft wurde.

Referenz
Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships
Zuletzt aktualisiert
28 November 2025

Was die Zahlen bedeuten

Woher es kam

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships wurde veröffentlicht von University of Florida, im Land aufgezeichnet als United States of America, während September 2024. Die veröffentlichende Organisation ist als academia.

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als die Aufgabe von aufgezeichnet protein function prediction.

Dies ist ein geschlossenes Modell: die trainierten Werte blieben bei demjenigen, der sie erzeugt hat, und es gibt keine lokale Version zum Ausführen.

Was in den Aufbau geflossen ist

Training verbrauchte ein Korpus von etwa 165,428 Text-Tokens

Antworten

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships — Häufige Fragen

01

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships— Wofür wird es verwendet?

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als Bewältigung der Aufgabe von protein function prediction. Modelle tragen häufig mehr als eines von jeder, und die Tags beschreiben den Zweck anstelle von Fähigkeitsgrenzen.

02

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships— Welche GPU benötige ich, um es auszuführen?

Dieses ist ein geschlossenes Modell — seine Gewichte wurden nie veröffentlicht, sodass es zu keinem Preis heruntergeladen oder auf Ihrer eigenen Hardware ausgeführt werden kann. Es ist nur über seinen Anbieter erreichbar.

03

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships— Ist es Open-Source?

Die Lizenzierung wurde nie in unseren Quelldaten aufgezeichnet. Wir behandeln nicht angegebene Lizenzen als geschlossen, da eine nicht aufgezeichnete Lizenz keine ist, auf die man sich verlassen kann.

04

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships— Wie viele Parameter hat es?

Es wurden keine Parameteranzahlen veröffentlicht, weshalb keine Speicher- oder Geschwindigkeitsangaben auf dieser Seite erscheinen.

05

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships— Wer hat es erstellt?

Es wurde veröffentlicht von University of Florida, basiert auf United States of America, eine als kategorisierte Organisation academia.

06

Importance of higher-order epistasis in large protein sequence-function relationships— Wann wurde es veröffentlicht?

Es wurde veröffentlicht in September 2024. Die Fähigkeit pro Parameter hat sich erheblich verbessert, sodass ein neueres Modell derselben Größe oft die bessere Nutzung derselben Hardware darstellt.

Quelle

Originalveröffentlichung

Letzte Aktualisierung des Protokolls 28 November 2025

Die andere Richtung

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