ProteinSetTransformer

Geschlossene Gewichtungen University of Wisconsin Madison September 2024

Keine Schätzung

Keine Hardwareanforderungen für dieses Modell

Die Gewichte für dieses Modell wurden nicht veröffentlicht, daher kann es nicht heruntergeladen oder auf Ihrer eigenen Hardware in beliebiger Größe betrieben werden. Es ist nur über seinen Anbieter erreichbar, und keine Grafikkarte ändert das..

Aufgezeichnet

Volle Spezifikation

Alles, was in unserer Datenbank für dieses Modell aufgezeichnet ist. Der Großteil beschreibt, wie es trainiert wurde, anstatt wie es läuft — nützlicher Kontext zur Beurteilung, wie viel Arbeit darin steckt und wie es sich mit Modellen vergleicht, die in einem anderen Maßstab erstellt wurden..

Ursprung

Wer hat dieses Modell gebaut, wo und wann es veröffentlicht wurde.

Organisation
University of Wisconsin Madison
Organisationsart
Academia
Land
United States of America
Veröffentlicht
23 September 2024
Autoren
Karthik Anantharaman, Cody Martin, Anthony Gitter

Was es tut

Die Problemfelder, für die das Modell entwickelt wurde. Ein Modell kann mehrere davon tragen.

Domain
Biology
Aufgabe
Protein or nucleotide language model (pLM/nLM)

Größe

Wie groß das Modell ist und wie viele Daten damit trainiert wurden. Parameter sind die Zahl, die entscheidet, ob es auf einer bestimmten GPU-Karte passt.

Trainingsdaten
tokens

datapoints = 6,391,562 proteins * 1 pass = 6.391562e6 This was from training the viral Protein Set Transformer (vPST) model on a dataset of 103,589 viruses containing 6,391,562 proteins total, with each protein counting as one datapoint.

Training-Compute

Die Berechnung, die durchgeführt wird, um das Modell zu trainieren, gemessen in Gleitpunktoperationen. Es ist ein Maß dafür, was der Trainingslauf gekostet hat, nicht dafür, wie schnell das fertige Modell Ihnen antwortet.

Training-Compute
1.7 × 10¹⁹ FLOP

1. Hardware setup: 1x NVIDIA A100 80GB (3.12 x 10^14 FLOP/s) 2. Training duration: - pst-large: 33.7 hours (directly provided) - pst-small: 3.15 hours (estimated based on parameter ratio 178M/5M) 3. Utilization rate: 40% 4. Calculation: pst-large: 3.12 x 10^14 × 121,320 × 0.40 = 1.51 x 10^19 FLOPs pst-small: 3.12 x 10^14 × 11,340 × 0.40 = 1.42 x 10^18 FLOPs Total: 1.65 x 10^19 FLOPs

Wie es etabliert wurde
Hardware

Der Trainingslauf

Was es physisch gekostet hat, um zu trainieren: welche Chips, wie viele, wie lange und was das aus der Wand gezogen hat.

Trainingshardware
NVIDIA A100

Wie es klassifiziert ist

Labels, die das Quell-Datenset anwendet, wenn bemerkenswerte Modelle verfolgt werden, und wie zuversichtlich es in den Eintrag ist.

Aufzeichnungsgenauigkeit
Confident

Quellen

Woher dieser Datensatz stammt und wann er zuletzt überprüft wurde.

Referenz
Protein Set Transformer: A protein-based genome language model to power high diversity viromics
Zuletzt aktualisiert
28 November 2025

Was die Zahlen bedeuten

Hintergrund

ProteinSetTransformer wurde veröffentlicht von University of Wisconsin Madison, im Land aufgezeichnet als United States of America, während September 2024. Die Kategorie, in die der Herausgeber fällt, ist academia.

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als die Aufgabe von aufgezeichnet protein or nucleotide language model (pLM/nLM).

Seine Gewichte wurden niemals veröffentlicht, daher kann es nur über seinen Anbieter erreicht werden. Keine Grafikkarten ändern das.

Training und Herkunft

Das Training benötigte ein Rechenbudget von ungefähr 1.7 × 10¹⁹ FLOP, auf Hardware erfasst als NVIDIA A100. Diese Zahl misst die Kosten für die Produktion des MODELLS und hat keinen Einfluss darauf, wie schnell es antwortet.

Antworten

ProteinSetTransformer — Häufige Fragen

01

ProteinSetTransformer— Wann wurde es veröffentlicht?

Es wurde veröffentlicht in September 2024. Die Fähigkeit pro Parameter hat sich erheblich verbessert, sodass ein neueres Modell derselben Größe oft die bessere Nutzung derselben Hardware darstellt.

02

ProteinSetTransformer— Wofür wird es verwendet?

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als Bewältigung der Aufgabe von protein or nucleotide language model (pLM/nLM). Ein Modell kann mehrere von jedem tragen, daher sind dies die Bereiche, für die es gebaut wurde, anstatt eine Begrenzung dafür, was es versuchen wird.

03

ProteinSetTransformer— Wie viel Rechenleistung wurde verwendet, um es zu trainieren?

Training verbrauchte etwa 1.7 × 10¹⁹ FLOP, auf Hardware erfasst als NVIDIA A100. Das misst, was die Produktion des Modells gekostet hat, und sagt nichts darüber aus, wie schnell es einmal trainiert antwortet — die Inferenzgeschwindigkeit kommt von der MEMORY-BANDWIDTH, nicht vom TRAINING-BUDGET.

04

ProteinSetTransformer— Welche GPU benötige ich, um es auszuführen?

Dieses ist ein geschlossenes Modell — seine Gewichte wurden nie veröffentlicht, sodass es zu keinem Preis heruntergeladen oder auf Ihrer eigenen Hardware ausgeführt werden kann. Es ist nur über seinen Anbieter erreichbar.

05

ProteinSetTransformer— Ist es Open-Source?

Die Lizenzierung wurde nie in unseren Quelldaten aufgezeichnet. Wir behandeln nicht angegebene Lizenzen als geschlossen, da eine nicht aufgezeichnete Lizenz keine ist, auf die man sich verlassen kann.

06

ProteinSetTransformer— Wie viele Parameter hat es?

Es wurden keine Parameteranzahlen veröffentlicht, weshalb keine Speicher- oder Geschwindigkeitsangaben auf dieser Seite erscheinen.

07

ProteinSetTransformer— Wer hat es erstellt?

Es wurde veröffentlicht von University of Wisconsin Madison, basiert auf United States of America, eine als kategorisierte Organisation academia.

Quelle

Originalveröffentlichung

Letzte Aktualisierung des Protokolls 28 November 2025

Die andere Richtung

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