PocketGen

Geschlossene Gewichtungen University of Science and Technology of China (USTC),Hefei Comprehensive National Science Center,Harvard University,Broad Institute,Harvard Data Science Initiative 7.9M Parameter September 2024

Keine Schätzung

Keine Hardwareanforderungen für dieses Modell

Die Gewichte für dieses Modell wurden nicht veröffentlicht, daher kann es nicht heruntergeladen oder auf Ihrer eigenen Hardware in beliebiger Größe betrieben werden. Es ist nur über seinen Anbieter erreichbar, und keine Grafikkarte ändert das..

Aufgezeichnet

Volle Spezifikation

Alles, was in unserer Datenbank für dieses Modell aufgezeichnet ist. Der Großteil beschreibt, wie es trainiert wurde, anstatt wie es läuft — nützlicher Kontext zur Beurteilung, wie viel Arbeit darin steckt und wie es sich mit Modellen vergleicht, die in einem anderen Maßstab erstellt wurden..

Ursprung

Wer hat dieses Modell gebaut, wo und wann es veröffentlicht wurde.

Organisation
University of Science and Technology of China (USTC),Hefei Comprehensive National Science Center,Harvard University,Broad Institute,Harvard Data Science Initiative
Organisationsart
Academia,Research collective,Academia,Research collective,Academia
Land
China, United States of America
Veröffentlicht
23 September 2024
Autoren
Zaixi Zhang, Wan Xiang Shen, Qi Liu, Marinka Zitnik

Was es tut

Die Problemfelder, für die das Modell entwickelt wurde. Ein Modell kann mehrere davon tragen.

Domain
Biology
Aufgabe
Protein-ligand contact prediction

Größe

Wie groß das Modell ist und wie viele Daten damit trainiert wurden. Parameter sind die Zahl, die entscheidet, ob es auf einer bestimmten GPU-Karte passt.

Parameter
7.9M

"As a result, PocketGen requires significantly fewer trainable parameters than RFDiffusionAA [16] (7.9M versus 82.9M trainable parameters)."

Trainingsdaten
tokens

"Finally, we have 40k protein-ligand pairs for training, 100 pairs for validation, and 100 pairs for testing." 40000*300 (assumed length) = 12000000

Training-Compute

Die Berechnung, die durchgeführt wird, um das Modell zu trainieren, gemessen in Gleitpunktoperationen. Es ist ein Maß dafür, was der Trainingslauf gekostet hat, nicht dafür, wie schnell das fertige Modell Ihnen antwortet.

Training-Compute
2.1 × 10¹⁹ FLOP

"It takes around 48 hours to finish training on 1 Tesla A100 GPU from scratch." Assume 40% utilization, FP16 tensor precision.

Wie es etabliert wurde
Hardware

Der Trainingslauf

Was es physisch gekostet hat, um zu trainieren: welche Chips, wie viele, wie lange und was das aus der Wand gezogen hat.

Trainingshardware
NVIDIA A100
Verwendete Chips
1
Wand-Uhrzeit
48 hours
Stromverbrauch
433 W

Wie es klassifiziert ist

Labels, die das Quell-Datenset anwendet, wenn bemerkenswerte Modelle verfolgt werden, und wie zuversichtlich es in den Eintrag ist.

Aufzeichnungsgenauigkeit
Confident
Zitationen
15

Quellen

Woher dieser Datensatz stammt und wann er zuletzt überprüft wurde.

Referenz
Efficient Generation of Protein Pockets with PocketGen
Zuletzt aktualisiert
28 November 2025

Was die Zahlen bedeuten

Was dieses Modell ist

PocketGen wurde veröffentlicht von University of Science and Technology of China (USTC),Hefei Comprehensive National Science Center,Harvard University,Broad Institute,Harvard Data Science Initiative, im Land aufgezeichnet als China, während September 2024. Die veröffentlichende Organisation ist als academia,Research collective,Academia,Research collective,Academia.

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als die Aufgabe von aufgezeichnet protein-ligand contact prediction.

Seine Gewichte wurden niemals veröffentlicht, daher kann es nur über seinen Anbieter erreicht werden. Keine Grafikkarten ändern das.

Wie es trainiert wurde

Die Herstellung erforderte eine Arithmetik, die insgesamt etwa 2.1 × 10¹⁹ FLOP, auf Hardware erfasst als NVIDIA A100. Diese Zahl misst die Kosten für die Produktion des MODELLS und hat keinen Einfluss darauf, wie schnell es antwortet.

Antworten

PocketGen — Häufige Fragen

01

PocketGen— Ist es Open-Source?

Die Lizenzierung wurde nie in unseren Quelldaten aufgezeichnet. Wir behandeln nicht angegebene Lizenzen als geschlossen, da eine nicht aufgezeichnete Lizenz keine ist, auf die man sich verlassen kann.

02

PocketGen— Wie viele Parameter hat es?

Es hat eine Parameteranzahl von 7.9M. "As a result, PocketGen requires significantly fewer trainable parameters than RFDiffusionAA [16] (7.9M versus 82.9M trainable parameters).". Diese Zahl ist die Gesamtsumme, und sie bestimmt, wie viel MEMORY das MODEL benötigt – ungefähr ein halbes Gigabyte pro Milliarde bei der Kompression, die die meisten Menschen verwenden.

03

PocketGen— Wer hat es erstellt?

Es wurde veröffentlicht von University of Science and Technology of China (USTC),Hefei Comprehensive National Science Center,Harvard University,Broad Institute,Harvard Data Science Initiative, basiert auf China, eine als kategorisierte Organisation academia,Research collective,Academia,Research collective,Academia.

04

PocketGen— Wann wurde es veröffentlicht?

Es wurde veröffentlicht in September 2024. Die Fähigkeit pro Parameter hat sich erheblich verbessert, sodass ein neueres Modell derselben Größe oft die bessere Nutzung derselben Hardware darstellt.

05

PocketGen— Wofür wird es verwendet?

Es funktioniert im Bereich von Biology, und wird als Bewältigung der Aufgabe von protein-ligand contact prediction. Dies sind die Bereiche, um die es entworfen wurde; sie beschreiben die Absicht und nicht eine harte Grenze.

06

PocketGen— Wie viel Rechenleistung wurde verwendet, um es zu trainieren?

Training verbrauchte etwa 2.1 × 10¹⁹ FLOP, auf Hardware erfasst als NVIDIA A100. Das misst, was die Produktion des Modells gekostet hat, und sagt nichts darüber aus, wie schnell es einmal trainiert antwortet — die Inferenzgeschwindigkeit kommt von der MEMORY-BANDWIDTH, nicht vom TRAINING-BUDGET.

07

PocketGen— Welche GPU benötige ich, um es auszuführen?

Dieses ist ein geschlossenes Modell — seine Gewichte wurden nie veröffentlicht, sodass es zu keinem Preis heruntergeladen oder auf Ihrer eigenen Hardware ausgeführt werden kann. Es ist nur über seinen Anbieter erreichbar.

Quelle

Originalveröffentlichung

Letzte Aktualisierung des Protokolls 28 November 2025

Die andere Richtung

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