GGNN

Κλειστές βαρύτητες Westlake University,Tsinghua University,Toyota Technological Institute at Chicago August 2023

Καμία εκτίμηση

Δεν υπάρχουν απαιτήσεις υλικού για αυτό το μοντέλο

Δεν έχει δημοσιευτεί το βάρος για αυτό το μοντέλο, επομένως δεν μπορεί να κατέβει ή να τρέξει σε δικό σας υλικό σε οποιοδήποτε μέγεθος. Είναι προσβάσιμο μόνο μέσω του προμηθευτή του, και καμία κάρτα γραφικών δεν το αλλάζει αυτό..

Σε καταγραφή

Πλήρης προδιαγραφή

Όλα τα καταγεγραμμένα για αυτό το μοντέλο. Τα περισσότερα από αυτά περιγράφουν το πώς εκπαιδεύτηκε παρά το πώς τρέχει — χρήσιμο πλαίσιο για την εκτίμηση του πόση εργασία έχει επενδυθεί σε αυτό, και πώς συγκρίνεται με μοντέλα που έχουν κατασκευαστεί σε διαφορετική κλίμακα..

Προέλευση

Ποιος κατασκεύασε αυτό το μοντέλο, πού και πότε δημοσιεύθηκε.

Οργάνωση
Westlake University,Tsinghua University,Toyota Technological Institute at Chicago
Τύπος οργανισμού
Academia,Academia,Academia
Χώρα
China, United States of America
Δημοσιευμένο
5 August 2023
Συγγραφείς
Fang Wu, Lirong Wu, Dragomir Radev, Jinbo Xu and Stan Z. Li

Τι κάνει

Οι προβληματικές περιοχές για τις οποίες σχεδιάστηκε το μοντέλο. Ένα μοντέλο μπορεί να διαθέτει αρκετές από κάθε μία.

τομέας
Biology
Εργασία
Proteins, Protein interaction prediction, Protein protein binding affinity prediction, Protein representation learning
Βασικό μοντέλο
ESM2-650M

Μέγεθος

Πόσο μεγάλο είναι το μοντέλο και πόσα δεδομένα έχει εκπαιδευτεί. Οι παράμετροι είναι ο αριθμός που αποφασίζει αν χωράει σε μια δεδομένη κάρτα γραφικών.

Δεδομένα εκπαίδευσης
tokens

Εκπαίδευση υπολογιστών

Η αριθμητική που πραγματοποιήθηκε για την εκπαίδευση του μοντέλου, μετρημένη σε πράξεις κινητής υποδιαστολής. Είναι ένα μέτρο του κόστους της προπόνησης, όχι της ταχύτητας με την οποία το ολοκληρωμένο μοντέλο σας απαντά.

Εκπαίδευση υπολογιστών
7.6 × 10²¹ FLOP

ESM-2 650M is very likely the majority of FLOPs, since they only used 2 A100s (ESM-2 650M used 512 V100s for 8 days). As such I'm reporting the compute from ESM-2 650M here only.

Πώς ιδρύθηκε
Other

Η εκπαίδευση run

Τι απαιτήθηκε φυσικά για την εκπαίδευση: ποιες κάρτες, πόσες, για πόσο καιρό, και τι αυτό απαιτούσε από το ρεύμα.

Υλικό εκπαίδευσης
NVIDIA A100 SXM4 80 GB
χρησιμοποιούμενα τσιπ
2
Κατανάλωση ενέργειας
1.6 kW

Διαθεσιμότητα

Εάν μπορείτε να αποκτήσετε το μοντέλο και να το τρέξετε στο δικό σας υλικό, το οποίο αποφασίζει αν οποιαδήποτε από τις αριθμούς της κάρτας γραφικών σε αυτή τη σελίδα ισχύει.

Βάρη
Closed — provider access only
Πρόσβαση μοντέλου
Unreleased
Κωδικός εκπαίδευσης
Open source

MIT license https://github.com/smiles724/GNN-Bottleneck

Πώς ταξινομείται

Ετικέτες το πηγαίο σύνολο δεδομένων εφαρμόζει όταν παρακολουθεί σημαντικά μοντέλα, και πόσο βέβαιο είναι στην είσοδο.

Γιατί παρακολουθείται
SOTA improvement

"In this work, we integrate the knowledge learned by well-trained protein language models into several state-of-the-art geometric networks and evaluate a variety of protein representation learning benchmarks, including protein-protein interface prediction, model quality assessment, protein-protein rigid-body docking, and binding affinity prediction. Our findings show an overall improvement of 20% over baselines."

Εγγραφή εμπιστοσύνης
Confident
Παραπομπές
43

Πηγές

Από πού προήλθε αυτή η καταγραφή και πότε ελέγχθηκε τελευταία φορά.

Αναφορά
Integration of pre-trained protein language models into geometric deep learning networks
Τελευταία ενημέρωση
1 January 2026

Τι σημαίνουν οι αριθμοί

Υπόβαθρο

GGNN δημοσιεύθηκε από Westlake University,Tsinghua University,Toyota Technological Institute at Chicago, στην χώρα καταγεγραμμένη ως China, κατά τη διάρκεια August 2023. Προέρχεται από έναν οργανισμό που κατατάσσεται ως academia,Academia,Academia.

Λειτουργεί στον τομέα της Biology, και καταγράφεται ότι εκτελεί την εργασία του proteins, Protein interaction prediction, Protein protein binding affinity prediction, Protein representation learning.

Αντί να εκπαιδευτεί από την αρχή, προέρχεται από ESM2-650M. Γι' αυτό μοιράζεται τη γενική μορφή και μέγεθος του βασικού μοντέλου.

Αυτό είναι ένα κλειστό μοντέλο: οι εκπαιδευμένες τιμές παρέμειναν με όποιον τις παρήγαγε, και δεν υπάρχει τοπική έκδοση για να τρέξει.

Τι χρειάστηκε για την κατασκευή του

Η εκπαίδευση απαιτούσε έναν υπολογιστικό προϋπολογισμό περίπου 7.6 × 10²¹ FLOP, σε υλικό καταγεγραμμένο ως NVIDIA A100 SXM4 80 GB. Αυτή η τιμή μετράει το κόστος παραγωγής του μοντέλου και δεν έχει σχέση με το πόσο γρήγορα απαντά.

Αυτή παρακολουθείται στο υποκείμενο σύνολο δεδομένων για έναν συγκεκριμένο λόγο: sOTA improvement.

Απαντήσεις

GGNN — κοινές ερωτήσεις

01

GGNN— για τί χρησιμοποιείται;

Λειτουργεί στον τομέα της Biology, και καταγράφεται ως διαχείριση της εργασίας του proteins, Protein interaction prediction, Protein protein binding affinity prediction, Protein representation learning. Τα Μοντέλα συχνά φέρουν περισσότερα από ένα από το καθένα, και οι ετικέτες περιγράφουν τον σκοπό παρά τους περιορισμούς ικανότητας.

02

GGNN— πόσο υπολογιστική ισχύς χρησιμοποιήθηκε για την εκπαίδευσή του;

Η εκπαίδευση κατανάλωσε περίπου 7.6 × 10²¹ FLOP, σε υλικό καταγεγραμμένο ως NVIDIA A100 SXM4 80 GB. Αυτό μετράει το κόστος παραγωγής του μοντέλου και δεν λέει τίποτα για το πόσο γρήγορα απαντά μόλις εκπαιδευτεί — η ταχύτητα συμπερασμάτων προέρχεται από τον δίαυλο μνήμης, όχι από τον προϋπολογισμό εκπαίδευσης.

03

GGNN— ποια GPU χρειάζομαι για να το τρέξω;

Κανένα. Αυτό είναι ένα κλειστό μοντέλο - τα βάρη του δεν δημοσιεύθηκαν ποτέ, οπότε δεν μπορεί να κατέβει ή να εκτελεστεί σε δικό σας υλικό σε καμία τιμή. Είναι προσβάσιμο μόνο μέσω του προμηθευτή του.

04

GGNN— είναι ανοιχτού κώδικα;

Όχι. Τα βάρη του δεν έχουν δημοσιευθεί, οπότε υπάρχει μόνο ως υπηρεσία που ελέγχεται από τον ιδιοκτήτη του.

05

GGNN— πόσες παραμέτρους έχει;

Δεν έχει δημοσιευθεί αριθμός παραμέτρων γι' αυτό, γι' αυτό και δεν εμφανίζεται καμία τιμή μνήμης ή ταχύτητας σε αυτή τη σελίδα.

06

GGNN— ποιος το δημιούργησε;

Δημοσιεύθηκε από Westlake University,Tsinghua University,Toyota Technological Institute at Chicago, βασισμένο σε China, μία οργάνωση κατηγοριοποιημένη ως academia,Academia,Academia.

07

GGNN— πότε κυκλοφόρησε;

Δημοσιεύθηκε σε August 2023. Η ικανότητα ανά παράμετρο έχει βελτιωθεί σημαντικά από τότε, οπότε ένα νέο ΜΟΝΤΕΛ του ίδιου μεγέθους είναι συχνά η καλύτερη χρήση του ίδιου υλικού.

Πηγή

Αρχική δημοσίευση

Η καταγραφή ενημερώθηκε τελευταία φορά 1 January 2026

Η άλλη κατεύθυνση

Κοιτάζοντας το από την άλλη πλευρά;

Αυτή η σελίδα ξεκινά από το μοντέλο. Αν έχετε ήδη μια κάρτα και θέλετε να μάθετε τα πάντα για το τι θα τρέξει., ξεκινήστε από το υλικό αντ' αυτού.