LEP-AD

Κλειστές βαρύτητες King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute 3B παράμετροι March 2023

Καμία εκτίμηση

Δεν υπάρχουν απαιτήσεις υλικού για αυτό το μοντέλο

Δεν έχει δημοσιευτεί το βάρος για αυτό το μοντέλο, επομένως δεν μπορεί να κατέβει ή να τρέξει σε δικό σας υλικό σε οποιοδήποτε μέγεθος. Είναι προσβάσιμο μόνο μέσω του προμηθευτή του, και καμία κάρτα γραφικών δεν το αλλάζει αυτό..

Σε καταγραφή

Πλήρης προδιαγραφή

Όλα τα καταγεγραμμένα για αυτό το μοντέλο. Τα περισσότερα από αυτά περιγράφουν το πώς εκπαιδεύτηκε παρά το πώς τρέχει — χρήσιμο πλαίσιο για την εκτίμηση του πόση εργασία έχει επενδυθεί σε αυτό, και πώς συγκρίνεται με μοντέλα που έχουν κατασκευαστεί σε διαφορετική κλίμακα..

Προέλευση

Ποιος κατασκεύασε αυτό το μοντέλο, πού και πότε δημοσιεύθηκε.

Οργάνωση
King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute
Τύπος οργανισμού
Academia,Academia
Χώρα
Saudi Arabia, Sweden
Δημοσιευμένο
15 March 2023
Συγγραφείς
Anuj Daga, Sumeer Ahmad Khan, David Gomez Cabrero, Robert Hoehndorf, Narsis A. Kiani, Jesper Tegner

Τι κάνει

Οι προβληματικές περιοχές για τις οποίες σχεδιάστηκε το μοντέλο. Ένα μοντέλο μπορεί να διαθέτει αρκετές από κάθε μία.

τομέας
Biology
Εργασία
Proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction
Βασικό μοντέλο
ESM2-3B
Αριθμητική μορφή
FP16

Μέγεθος

Πόσο μεγάλο είναι το μοντέλο και πόσα δεδομένα έχει εκπαιδευτεί. Οι παράμετροι είναι ο αριθμός που αποφασίζει αν χωράει σε μια δεδομένη κάρτα γραφικών.

παράμετροι
3B

Uses ESM-2 3B. Table 2 gives details on the non-ESM layers. The GCN appears to have about 3.31M parameters and the linear layers should have 771k and 3.3M, respectively. So total is ~3.007B

Δεδομένα εκπαίδευσης
1,244,420 tokens

Largest dataset appears to be STITCH, at 1244420 drug-target pairs.

Διαθεσιμότητα

Εάν μπορείτε να αποκτήσετε το μοντέλο και να το τρέξετε στο δικό σας υλικό, το οποίο αποφασίζει αν οποιαδήποτε από τις αριθμούς της κάρτας γραφικών σε αυτή τη σελίδα ισχύει.

Βάρη
Closed — provider access only
Πρόσβαση μοντέλου
Unreleased
Κωδικός εκπαίδευσης
Open (non-commercial)

https://github.com/adaga06/LEP-AD unclear license

Πώς ταξινομείται

Ετικέτες το πηγαίο σύνολο δεδομένων εφαρμόζει όταν παρακολουθεί σημαντικά μοντέλα, και πόσο βέβαιο είναι στην είσοδο.

Γιατί παρακολουθείται
SOTA improvement

Tables 3-5 "We report new best-in-class state-of-the-art results compared to competing methods such as SimBoost, DeepCPI, Attention-DTA, GraphDTA, and more using multiple datasets, including Davis, KIBA, DTC, Metz, ToxCast, and STITCH. Finally, we find that a pre-trained model with embedding of proteins (the LED-AD) outperforms a model using an explicit alpha-fold 3D representation of proteins (e.g., LEP-AD supervised by Alphafold)"

Εγγραφή εμπιστοσύνης
Confident
Παραπομπές
1

Πηγές

Από πού προήλθε αυτή η καταγραφή και πότε ελέγχθηκε τελευταία φορά.

Αναφορά
LEP-AD: Language Embedding of Proteins and Attention to Drugs predicts Drug Target Interactions
Τελευταία ενημέρωση
28 November 2025

Τι σημαίνουν οι αριθμοί

Τι είναι αυτό το μοντέλο

LEP-AD δημοσιεύθηκε από King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute, στην χώρα καταγεγραμμένη ως Saudi Arabia, κατά τη διάρκεια March 2023. Ο εκδοτικός οργανισμός κατηγοριοποιείται ως academia,Academia.

Λειτουργεί στον τομέα της Biology, και καταγράφεται ότι εκτελεί την εργασία του proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction.

Αντί να εκπαιδευτεί από την αρχή, προέρχεται από ESM2-3B. Οι περισσότεροι μοντέλα σε αυτή την κλίμακα προσαρμόζονται από μια υπάρχουσα βάση παρά κατασκευάζονται από το μηδέν.

Επειδή τα WEIGHTS δεν είναι διαθέσιμα, κανένα από τα figures του HARDWARE αλλού σε αυτό το SITE δεν ισχύει γι' αυτό.

Τι χρειάστηκε για την κατασκευή του

Η εκπαίδευση κατανάλωσε ένα σύνολο περίπου 1,244,420 κωδικοί κειμένου

Ο λόγος που εμφανίζεται σε αυτόν τον κατάλογο είναι: sOTA improvement.

Απαντήσεις

LEP-AD — κοινές ερωτήσεις

01

LEP-AD— πόσες παραμέτρους έχει;

Έχει αριθμό παραμέτρων 3B. Uses ESM-2 3B. Table 2 gives details on the non-ESM layers. The GCN appears to have about 3.31M parameters and the linear layers should have 771k and 3.3M, respectively. So total is ~3.007B. Αυτή η φιγούρα είναι το σύνολο, και είναι αυτό που αποφασίζει πόση μνήμη χρειάζεται το μοντέλο - περίπου μισό γιγαμπάιτ ανά δισεκατομμύριο με τη συμπίεση που χρησιμοποιεί το πιο πολλοί άνθρωποι.

02

LEP-AD— ποιος το δημιούργησε;

Δημοσιεύθηκε από King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute, βασισμένο σε Saudi Arabia, μία οργάνωση κατηγοριοποιημένη ως academia,Academia.

03

LEP-AD— πότε κυκλοφόρησε;

Δημοσιεύθηκε σε March 2023. Η ικανότητα ανά παράμετρο έχει βελτιωθεί σημαντικά από τότε, οπότε ένα νέο ΜΟΝΤΕΛ του ίδιου μεγέθους είναι συχνά η καλύτερη χρήση του ίδιου υλικού.

04

LEP-AD— για τί χρησιμοποιείται;

Λειτουργεί στον τομέα της Biology, και καταγράφεται ως διαχείριση της εργασίας του proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction. Ένα ΜΟΝΤΕΛ μπορεί να φέρει πολλά από το καθένα, οπότε αυτές είναι οι περιοχές για τις οποίες κατασκευάστηκε παρά περιορισμός σε ό,τι θα προσπαθήσει.

05

LEP-AD— ποια GPU χρειάζομαι για να το τρέξω;

Κανένα. Αυτό είναι ένα κλειστό μοντέλο - τα βάρη του δεν δημοσιεύθηκαν ποτέ, οπότε δεν μπορεί να κατέβει ή να εκτελεστεί σε δικό σας υλικό σε καμία τιμή. Είναι προσβάσιμο μόνο μέσω του προμηθευτή του.

06

LEP-AD— είναι ανοιχτού κώδικα;

Όχι. Τα βάρη του δεν έχουν δημοσιευθεί, οπότε υπάρχει μόνο ως υπηρεσία που ελέγχεται από τον ιδιοκτήτη του.

Πηγή

Αρχική δημοσίευση

Η καταγραφή ενημερώθηκε τελευταία φορά 28 November 2025

Η άλλη κατεύθυνση

Κοιτάζοντας το από την άλλη πλευρά;

Αυτή η σελίδα ξεκινά από το μοντέλο. Αν έχετε ήδη μια κάρτα και θέλετε να μάθετε τα πάντα για το τι θα τρέξει., ξεκινήστε από το υλικό αντ' αυτού.