DeepFRI

Ανοιχτά βάρη Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT) May 2021

Καμία εκτίμηση

Δεν υπάρχουν απαιτήσεις υλικού για αυτό το μοντέλο

Τα βάρη αυτού του μοντέλου είναι OPEN, αλλά κανένας αριθμός παραμέτρων δεν έχει δημοσιευθεί γι' αυτό. Κάθε FIGURE μνήμης και ταχύτητας ξεκινά από αυτόν τον αριθμό, οπότε θα προτιμούσαμε να μην δείξουμε τίποτα παρά μια κατασκευασμένη εκτίμηση..

Σε καταγραφή

Πλήρης προδιαγραφή

Όλα τα καταγεγραμμένα για αυτό το μοντέλο. Τα περισσότερα από αυτά περιγράφουν το πώς εκπαιδεύτηκε παρά το πώς τρέχει — χρήσιμο πλαίσιο για την εκτίμηση του πόση εργασία έχει επενδυθεί σε αυτό, και πώς συγκρίνεται με μοντέλα που έχουν κατασκευαστεί σε διαφορετική κλίμακα..

Προέλευση

Ποιος κατασκεύασε αυτό το μοντέλο, πού και πότε δημοσιεύθηκε.

Οργάνωση
Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT)
Τύπος οργανισμού
Academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia
Χώρα
United States of America, Poland, New Zealand
Δημοσιευμένο
26 May 2021
Συγγραφείς
Vladimir Gligorijević, P. Douglas Renfrew, Tomasz Kosciolek, Julia Koehler Leman, Daniel Berenberg, Tommi Vatanen, Chris Chandler, Bryn C. Taylor, Ian M. Fisk, Hera Vlamakis, Ramnik J. Xavier, Rob Knight, Kyunghyun Cho & Richard Bonneau

Τι κάνει

Οι προβληματικές περιοχές για τις οποίες σχεδιάστηκε το μοντέλο. Ένα μοντέλο μπορεί να διαθέτει αρκετές από κάθε μία.

τομέας
Biology
Εργασία
Protein function prediction

Μέγεθος

Πόσο μεγάλο είναι το μοντέλο και πόσα δεδομένα έχει εκπαιδευτεί. Οι παράμετροι είναι ο αριθμός που αποφασίζει αν χωράει σε μια δεδομένη κάρτα γραφικών.

Δεδομένα εκπαίδευσης
tokens

30k PDB + 220k SWISS-MODEL = 250k 250k * 0.8 = 200k

Διαθεσιμότητα

Εάν μπορείτε να αποκτήσετε το μοντέλο και να το τρέξετε στο δικό σας υλικό, το οποίο αποφασίζει αν οποιαδήποτε από τις αριθμούς της κάρτας γραφικών σε αυτή τη σελίδα ισχύει.

Βάρη
Open — downloadable
Πρόσβαση μοντέλου
Open weights (unrestricted)
Κωδικός εκπαίδευσης
Open source

The source code for training the DeepFRI model, together with neural network weights are available for research and non-commercial use at https://github.com/flatironinstitute/DeepFRI (BSD-3-Clause license) and it can be cited by using https://doi.org/10.5281/zenodo.4650027. A web service of our method is available at https://beta.deepfri.flatironinstitute.org/

Πώς ταξινομείται

Ετικέτες το πηγαίο σύνολο δεδομένων εφαρμόζει όταν παρακολουθεί σημαντικά μοντέλα, και πόσο βέβαιο είναι στην είσοδο.

Εγγραφή εμπιστοσύνης
Confident
Παραπομπές
786

Πηγές

Από πού προήλθε αυτή η καταγραφή και πότε ελέγχθηκε τελευταία φορά.

Αναφορά
Structure-based protein function prediction using graph convolutional networks
Τελευταία ενημέρωση
1 January 2026

Τι σημαίνουν οι αριθμοί

Από πού προήλθε

DeepFRI δημοσιεύθηκε από Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT), στην χώρα καταγεγραμμένη ως United States of America, κατά τη διάρκεια May 2021. Η κατηγορία στην οποία υπάγεται ο εκδότης είναι academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia.

Λειτουργεί στον τομέα της Biology, και καταγράφεται ότι εκτελεί την εργασία του protein function prediction.

Επειδή τα βάρη του απελευθερώθηκαν, τίποτα σχετικά με την εκτέλεσή του δεν εξαρτάται από το να παραμείνει διαθέσιμος ένας προμηθευτής - είναι δικό σας μόλις το κατεβάσετε.

Απαντήσεις

DeepFRI — κοινές ερωτήσεις

01

DeepFRI— για τί χρησιμοποιείται;

Λειτουργεί στον τομέα της Biology, και καταγράφεται ως διαχείριση της εργασίας του protein function prediction. Αυτές είναι οι περιοχές γύρω από τις οποίες σχεδιάστηκε; Περιγράφουν την πρόθεση παρά ένα αυστηρό όριο.

02

DeepFRI— πού μπορώ να το κατεβάσω;

Οι παράμετροι είναι δημοσιευμένες, αν και δεν κρατάμε σύνδεσμο αποθετηρίου γι' αυτό. Αυτή η ιστοσελίδα υπολογίζει τις απαιτήσεις υλικού αντί να φιλοξενεί αρχεία μοντέλων.

03

DeepFRI— ποια GPU χρειάζομαι για να το τρέξω;

Δεν μπορούμε να πούμε. Έχει OPEN WEIGHTS, αλλά δεν έχει δημοσιευτεί καμία μέτρηση παραμέτρων για αυτό, και όλοι οι υπολογισμοί ΜΝΗΜΗΣ και ταχύτητας ξεκινούν από αυτόν τον αριθμό. Θα προτιμούσαμε να μην δείξουμε τίποτα από το να δώσουμε μια κατασκευασμένη εκτίμηση.

04

DeepFRI— είναι ανοιχτού κώδικα;

Οι βάσεις του είναι δημοσιευμένες, οπότε μπορεί να κατέβει και να τρέξει σε δικό σας υλικό. Σημειώστε ότι τα open weights δεν είναι το ίδιο με το open source με την πλήρη έννοια — δεν λέει τίποτα για τα δεδομένα εκπαίδευσης, τον κώδικα εκπαίδευσης ή τους εμπορικούς όρους που συσχετίζονται.

05

DeepFRI— πόσες παραμέτρους έχει;

Δεν έχει δημοσιευθεί αριθμός παραμέτρων γι' αυτό, γι' αυτό και δεν εμφανίζεται καμία τιμή μνήμης ή ταχύτητας σε αυτή τη σελίδα.

06

DeepFRI— ποιος το δημιούργησε;

Δημοσιεύθηκε από Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT), βασισμένο σε United States of America, μία οργάνωση κατηγοριοποιημένη ως academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia.

07

DeepFRI— πότε κυκλοφόρησε;

Δημοσιεύθηκε σε May 2021. Η ικανότητα ανά παράμετρο έχει βελτιωθεί σημαντικά από τότε, οπότε ένα νέο ΜΟΝΤΕΛ του ίδιου μεγέθους είναι συχνά η καλύτερη χρήση του ίδιου υλικού.

Πηγή

Αρχική δημοσίευση

Η καταγραφή ενημερώθηκε τελευταία φορά 1 January 2026

Η άλλη κατεύθυνση

Κοιτάζοντας το από την άλλη πλευρά;

Αυτή η σελίδα ξεκινά από το μοντέλο. Αν έχετε ήδη μια κάρτα και θέλετε να μάθετε τα πάντα για το τι θα τρέξει., ξεκινήστε από το υλικό αντ' αυτού.