BERT-RBP calculadora TPS

Abre pesos Waseda University 110M parámetros April 2022

Cada tarjeta a continuación se evalúa en función de este modelo en la longitud de contexto y calidad mínima que elijas. La velocidad es una estimación para una sola solicitud, calculada a partir del ancho de banda de memoria de la tarjeta y el tamaño del modelo una vez comprimido..

Calculado para este modelo

818 tarjetas que pueden ejecutarlo

818 tarjetas que tenemos especificaciones para

Tarjeta más pequeña que cabe

Tesla C1080

4 GB · Q8_0 · 335 tok/s

Tarjeta más rápida

B200

30,802 tok/s · 180 GB

¿Qué GPU pueden ejecutar? BERT-RBP?

Establecer las entradas, leer la respuesta

Una conversación más larga necesita más VRAM, lo que puede expulsar este modelo de tarjetas más pequeñas..

Oculta tarjetas que solo se ajustarían al modelo comprimiéndolo por debajo de este punto..

818 las tarjetas coinciden

Calculando
Necesita Cuantización Ajustar
30,802 tok/s

18,481–49,283 · baja confianza

B200 NVIDIA 180 GB 8,000 GB/s Jan 2024 0.8 GB Q8_0 Cómodo
30,802 tok/s

18,481–49,283 · baja confianza

B300 NVIDIA 288 GB 8,000 GB/s Sep 2025 0.8 GB Q8_0 Cómodo
24,596 tok/s

14,758–39,354 · baja confianza

Radeon Instinct MI350X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.8 GB Q8_0 Cómodo
24,596 tok/s

14,758–39,354 · baja confianza

Radeon Instinct MI355X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.8 GB Q8_0 Cómodo
19,671 tok/s

11,803–31,474 · baja confianza

Radeon Instinct MI300 AMD 128 GB 6,550 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
18,828 tok/s

11,297–30,124 · baja confianza

H200 NVL NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.8 GB Q8_0 Cómodo
18,828 tok/s

11,297–30,124 · baja confianza

H200 SXM 141 GB NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.8 GB Q8_0 Cómodo
18,019 tok/s

10,812–28,831 · baja confianza

Radeon Instinct MI325X AMD 256 GB 6,000 GB/s Oct 2024 0.8 GB Q8_0 Cómodo
15,992 tok/s

9,595–25,587 · baja confianza

Radeon Instinct MI300A AMD 128 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
15,992 tok/s

9,595–25,587 · baja confianza

Radeon Instinct MI300X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
15,992 tok/s

9,595–25,587 · baja confianza

Radeon Instinct MI308X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
15,170 tok/s

9,102–24,272 · baja confianza

H100 NVL 94 GB NVIDIA 94 GB 3,940 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
12,937 tok/s

7,762–20,699 · baja confianza

H100 PCIe 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
12,937 tok/s

7,762–20,699 · baja confianza

H100 SXM5 80 GB NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Oct 2022 0.8 GB Q8_0 Cómodo
12,937 tok/s

7,762–20,699 · baja confianza

H100 SXM5 94 GB NVIDIA 94 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
12,937 tok/s

7,762–20,699 · baja confianza

H100 SXM5 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
12,937 tok/s

7,762–20,699 · baja confianza

H800 SXM5 NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
9,851 tok/s

5,910–15,761 · baja confianza

Radeon Instinct MI250 AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.8 GB Q8_0 Cómodo
9,851 tok/s

5,910–15,761 · baja confianza

Radeon Instinct MI250X AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.8 GB Q8_0 Cómodo
8,209 tok/s

4,925–13,134 · baja confianza

Data Center GPU Max 1550 Intel 128 GB 3,280 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
8,034 tok/s

4,820–12,854 · baja confianza

Data Center GPU Max Subsystem Intel 128 GB 3,210 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo
7,855 tok/s

4,713–12,567 · baja confianza

A100 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Nov 2020 0.8 GB Q8_0 Cómodo
7,855 tok/s

4,713–12,567 · baja confianza

A100X NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Jun 2021 0.8 GB Q8_0 Cómodo
7,855 tok/s

4,713–12,567 · baja confianza

A800 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Aug 2022 0.8 GB Q8_0 Cómodo
7,855 tok/s

4,713–12,567 · baja confianza

H100 CNX NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Cómodo

Las velocidades son estimaciones para una sola solicitud — una conversación a la vez — calculadas a partir del ancho de banda de memoria, el tamaño del modelo y la cuantificación. El rendimiento real varía con el tiempo de inferencia y su versión. Las cifras publicadas por los proveedores de hardware miden muchas solicitudes simultáneas y son mucho más altas..

En registro

especificación completa

Todo en archivo para este modelo. La mayor parte describe cómo fue entrenado en lugar de cómo se ejecuta — contexto útil para juzgar cuánto trabajo se invirtió en él y cómo se compara con modelos construidos a una escala diferente..

Origen

Quién construyó este modelo, dónde, y cuándo fue publicado.

Organización
Waseda University
Tipo de Organización
Academia
País
Japan
Publicado
7 April 2022
Autores
Keisuke Yamada, Michiaki Hamada

Lo que hace

Las áreas problemáticas para las que se construyó el modelo. Un modelo puede llevar varios de cada uno.

Dominio
Biology
Tarea
Proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction
Modelo base
DNABERT

Tamaño

Qué tan grande es el modelo y cuántos datos se usaron para su entrenamiento. Los parámetros son la cifra que decide si se ajusta en una tarjeta gráfica dada.

parámetros
110M

Base model is BERT base (110M parameters), pre-trained on human reference genome (DNABert: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/15/2112/6128680)

Datos de entrenamiento
tokens

RBPs: 154 Sequences per RBP: 15,000 Total sequences = 154 × 15,000 = 2,310,000 Tokens per sequence = 34 Total tokens = 2,310,000 × 34 = 78,540,000 Final estimate: 7.8 × 10⁷ tokens

Épocas
3

Cómputo de entrenamiento

La aritmética realizada para entrenar el modelo, medida en operaciones de punto flotante. Es una medida de lo que costó la ejecución del entrenamiento, no de qué tan rápido te responde el modelo terminado.

Cómputo de entrenamiento
1.4 × 10²⁰ FLOP

See DNABert entry: "Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)" Assuming FP16 and 30% utilization Calculation = (25 * 24 *3600) s * 2.7e13 FLOP/s per GPU * 8 GPUs * 0.3 utilization = 1.4e20 FLOP

Cómo se estableció
Hardware
Computación de ajuste fino
2.2 × 10¹⁶ FLOP

"The models were trained on four NVIDIA Tesla V100 GPUs (128 GB memory). The training of one RBP model using 19 200 samples took <10 min." Calculation assuming FP16 and 30% utlization and NVIDIA Tesla V100 SMX2 model: 10 min * 60 sec/min * 3.1e13 FLOP/s * 4 GPU * 0.3 utilization = 2.2e16

Disponibilidad

Si puedes obtener el modelo y ejecutarlo en tu propio hardware, lo que decide si alguna de las cifras de la GPU en esta página se aplica.

Pesos
Open — downloadable
Acceso al modelo
Open weights (non-commercial)
Código de entrenamiento
Open (non-commercial)

No clear license: https://github.com/kkyamada/bert-rbp train script: https://github.com/kkyamada/bert-rbp/blob/master/examples/run_finetune.py data also doesn't have a clear license: http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/RBPsuite/dataset_new.html

Cómo está clasificado

Etiquetas que el conjunto de datos fuente aplica al rastrear modelos notables y cuán confiable es en la entrada.

Por qué se rastrea
SOTA improvement

"Our model outperformed state-of-the-art prediction models using the eCLIP-seq data of 154 RBPs" [Abstract] - SOTA improvement on a very specific task "Using the eCLIP-seq data of 154 different RBPs, our model outperformed state-of-the-art methods and the baseline BERT model."

Confianza de registro
Confident
Citas
68

Fuentes

De dónde proviene este registro y cuándo fue comprobado por última vez.

Referencia
Prediction of RNA–protein interactions using a nucleotide language model
Última actualización
1 January 2026

Los extremos

Qué significan los números

El lado de hardware

Mínima tarjeta

Tesla C1080

Memoria necesaria

0.8 GB

Más rápido

30,802 tok/s

BERT-RBP llega a un recuento de parámetros de 110M. Eso es lo suficientemente pequeño como para que el hardware rara vez sea el obstáculo, incluso en tarjetas de varios años. El número de tarjetas que rastreamos que pueden ejecutarlo: 818.

En el extremo bajo, se maneja por Tesla C1080, con una capacidad de memoria de 4 GB, ejecutándolo a una compresión de Q8_0 y produciendo alrededor 335 tokens por segundo

El resultado más rápido proviene de B200, generando aproximadamente 30,802 tokens por segundo en la fuerza de un ancho de banda de memoria de 8,000 GB/s.

Qué es este modelo

BERT-RBP fue publicado por Waseda University, en el país registrado como Japan, durante April 2022. Sale de una organización categorizada como academia.

Funciona en el dominio de Biology, y se registra como realizando la tarea de proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction.

Su punto de partida fue un modelo base existente, DNABERT. La mayoría de los modelos a esta escala están adaptados de una base existente en lugar de construidos desde cero.

El hecho de que los pesos sean abiertos es lo que coloca esta página en la calculadora en lugar de solo en el catálogo: es un modelo que puedes sostener.

Qué decide la velocidad

La mitad de las tarjetas que lo sostienen gestionan más de 864.9 tokens por segundo. Produciendo texto más rápido de lo que la mayoría de las personas lo leen. 818 de ellos.

Es un modelo denso, por lo que cada parámetro se lee para cada token producido. Eso hace que la velocidad rastree el ancho de banda de la memoria casi exactamente: una tarjeta con el doble de ancho de banda genera aproximadamente el doble de rápido.

La memoria aquí se estima a partir del tamaño en lugar de calcularse a partir de la arquitectura, que no se registra para este modelo — los números son indicativos en lugar de exactos.

Qué se necesitó para construirlo

Producirlo requirió una aritmética que totaliza alrededor de 1.4 × 10²⁰ FLOP. Esa cifra mide lo que costó producir el modelo, y no tiene relación con qué tan rápido responde.

Se rastrea en el conjunto de datos subyacente por una razón en particular: sOTA improvement.

Paso a paso

Cómo elegir una GPU para BERT-RBP

La tabla de arriba ya ha evaluado cada tarjeta para la que tenemos especificaciones en contra de este modelo. Llegar a tu respuesta toma seis pasos..

  1. 01

    Lee la cifra de MEMORIA primero

    Cada tarjeta aquí ha sido verificada contra BERT-RBP, necesitando alrededor 0.8 GB a una compresión de Q8_0. Ninguna cantidad de potencia de procesamiento compensa una CARD que no puede sostenerla.

  2. 02

    Decide cuánto duran tus conversaciones.

    La conversación ocupa memoria también, y crece a medida que avanza. Ajusta el controlador a la longitud que esperas, porque en un contexto largo una CARD que maneja preguntas cortas fácilmente puede no encajar. BERT-RBP.

  3. 03

    Decide cuánto compresión aceptarás

    La compresión es lo que hace que un modelo quepa en tarjetas más pequeñas, a costa de cierta precisión., alcanzando una compresión de Q8_0 en la tarjeta más pequeña que cabe. Establecer una calidad mínima elimina las tarjetas que solo la manejan apretando más de lo que desearías, y mantiene la comparación en un nivel.

  4. 04

    Ordenar por velocidad

    La velocidad de ordenación es efectivamente un ordenamiento por ancho de banda de GPU. BERT-RBP. No se ajustará a un pedido de gaming, porque la generación está limitada por el ancho de banda de memoria. La tarjeta que encabeza la lista es B200, en 30,802 tok/s

  5. 05

    Lee la columna de ajuste al final

    La columna de ajuste separa las TARJETAS que apenas lo gestionan de aquellas con espacio de sobra, en el caso de BERT-RBP. Cómodo significa que puedes aumentar el contexto más adelante. Esa diferencia importa más que unos pocos tokens por segundo, así que compra por cómodo si esperas hacerlo.

  6. 06

    Mira qué más ejecuta esa tarjeta

    Cada página de tarjeta repite este barrido para cada modelo que tenemos, respondiendo a qué más es bueno el hardware más allá de BERT-RBP.

Respuestas

BERT-RBP — preguntas comunes

01

BERT-RBP— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 24 GB?

Sí. La tarjeta GeForce RTX 5090 D V2, sosteniendo 24 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.8 GB y generando aproximadamente 5,159 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

02

BERT-RBP— ¿Es de código abierto?

Sus pesos están publicados, por lo que se pueden descargar y ejecutar en su propio hardware. Tenga en cuenta que OPEN WEIGHTS no es lo mismo que OPEN SOURCE en el sentido completo: no dice nada sobre los datos de entrenamiento, el código de entrenamiento o los términos comerciales adjuntos.

03

BERT-RBP— ¿cuántos parámetros tiene?

Tiene un recuento de parámetros de 110M. Base model is BERT base (110M parameters), pre-trained on human reference genome (DNABert: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/15/2112/6128680). Esa cifra es el total, y es lo que decide cuánta MEMORIA necesita el modelo — aproximadamente medio gigabyte por mil millones en la compresión que la mayoría de las personas usa.

04

BERT-RBP— ¿Quién lo creó?

Fue publicado por Waseda University, basado en Japan, una organización categorizada como academia.

05

BERT-RBP— ¿cuándo fue lanzado?

Se publicó en April 2022. La capacidad por parámetro ha mejorado considerablemente desde entonces, por lo que un modelo más reciente del mismo tamaño suele ser el mejor uso del mismo hardware.

06

BERT-RBP— ¿Para qué se utiliza?

Funciona en el dominio de Biology, y se registra como manejando la tarea de proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction. Un modelo puede manejar varios de cada uno, así que estas son las áreas para las que fue construido en lugar de un límite en lo que intentará.

07

BERT-RBP— ¿Dónde puedo descargarlo?

Los pesos están publicados, aunque no tenemos un enlace de repositorio para ello. Este sitio calcula los requisitos de hardware en lugar de alojar archivos de modelo.

08

BERT-RBP— cuánto compute se utilizó para entrenarlo?

El entrenamiento consumió alrededor 1.4 × 10²⁰ FLOP. Eso mide cuánto costó producir el modelo y no dice nada sobre cuán rápido responde una vez entrenado — la velocidad de inferencia proviene del ancho de banda de memoria, no del presupuesto de entrenamiento.

09

BERT-RBP— ¿Puedo ejecutarlo si no cabe en mi GPU?

Solo al descargar, lo cual suele ser una falsa economía: la parte mantenida en la memoria del sistema arrastra todo. Cada cifra aquí asume que todo el modelo está residente en la tarjeta.

10

BERT-RBP— ¿Correrían dos GPUS más rápido?

Una segunda tarjeta duplica aproximadamente la memoria disponible, pero no la tasa de generación. El número ya capaz de ejecutarlo solo: 818. Así que una segunda tarjeta rara vez es la respuesta aquí.

11

BERT-RBP— ¿Por qué difiere la cuantificación entre tarjetas?

Una tarjeta más grande sostiene una copia más precisa. El número de niveles de compresión utilizados en las tarjetas que la ejecutan: 1. Las tarjetas más grandes obtienen la versión más precisa, y el nivel de calidad por encima establece la comparación a un nivel.

12

BERT-RBP— ¿Qué tan precisas son estas estimaciones de velocidad?

Se calculan a partir de especificaciones en lugar de ser medidas, y cada una tiene un rango. Un ejemplo: 18,481–49,283 tok/s en B200. El mismo modelo y tarjeta varían entre el treinta y el cincuenta por ciento dependiendo del software de inferencia y su versión.

13

BERT-RBP— ¿Qué GPU necesito para ejecutarlo?

La tarjeta más pequeña en nuestro catálogo que lo sostiene es Tesla C1080, con una capacidad de memoria de 4 GB. Funciona el modelo a una compresión de Q8_0 usando alrededor 0.8 GB, y produce aproximadamente 335 tokens por segundo. El número de tarjetas capaces de ejecutarlo en total: 818.

14

BERT-RBP— ¿qué tan rápido es en una GPU?

Depende de la tarjeta. Lo más rápido que calculamos es B200, a aproximadamente 30,802 tokens por segundo; el más lento que aún lo ejecuta consigue considerablemente menos. La velocidad de lectura es de alrededor de diez tokens por segundo, y el número de cards que logran eso: 818.

15

BERT-RBP— ¿Cuánta VRAM necesita?

Necesita aproximadamente 0.8 GB a una compresión de Q8_0, cuál es la tarjeta más pequeña que lo ejecuta. Menos compresión necesita más: las cifras en la columna de memoria anterior se recalculan para cada tarjeta, porque cada una sostiene la versión menos comprimida que puede.

16

BERT-RBP— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 8 GB?

Sí. La tarjeta CMP 170HX 8 GB, sosteniendo 8 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.8 GB y generando aproximadamente 5,737 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

17

BERT-RBP— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 12 GB?

Sí. La tarjeta GeForce RTX 3080 Ti, sosteniendo 12 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.8 GB y generando aproximadamente 3,513 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

18

BERT-RBP— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 16 GB?

Sí. La tarjeta Tesla V100 SXM2 16 GB, sosteniendo 16 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.8 GB y generando aproximadamente 4,351 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

Origen

Publicación original

Última actualización registrada 1 January 2026

La otra dirección

¿Mirándolo desde el otro lado?

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