ProteinBERT calculadora TPS

Abre pesos Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading 16M parámetros February 2022

Cada tarjeta a continuación se evalúa en función de este modelo en la longitud de contexto y calidad mínima que elijas. La velocidad es una estimación para una sola solicitud, calculada a partir del ancho de banda de memoria de la tarjeta y el tamaño del modelo una vez comprimido..

Calculado para este modelo

818 tarjetas que pueden ejecutarlo

818 tarjetas que tenemos especificaciones para

Tarjeta más pequeña que cabe

Tesla C1080

4 GB · Q8_0 · 2,304 tok/s

Tarjeta más rápida

B200

211,765 tok/s · 180 GB

¿Qué GPU pueden ejecutar? ProteinBERT?

Establecer las entradas, leer la respuesta

Una conversación más larga necesita más VRAM, lo que puede expulsar este modelo de tarjetas más pequeñas..

Oculta tarjetas que solo se ajustarían al modelo comprimiéndolo por debajo de este punto..

818 las tarjetas coinciden

Calculando
Necesita Cuantización Ajustar
211,765 tok/s

127,059–338,824 · baja confianza

B200 NVIDIA 180 GB 8,000 GB/s Jan 2024 0.7 GB Q8_0 Cómodo
211,765 tok/s

127,059–338,824 · baja confianza

B300 NVIDIA 288 GB 8,000 GB/s Sep 2025 0.7 GB Q8_0 Cómodo
169,099 tok/s

101,460–270,559 · baja confianza

Radeon Instinct MI350X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.7 GB Q8_0 Cómodo
169,099 tok/s

101,460–270,559 · baja confianza

Radeon Instinct MI355X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.7 GB Q8_0 Cómodo
135,238 tok/s

81,143–216,381 · baja confianza

Radeon Instinct MI300 AMD 128 GB 6,550 GB/s Jan 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
129,441 tok/s

77,665–207,106 · baja confianza

H200 NVL NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.7 GB Q8_0 Cómodo
129,441 tok/s

77,665–207,106 · baja confianza

H200 SXM 141 GB NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.7 GB Q8_0 Cómodo
123,882 tok/s

74,329–198,212 · baja confianza

Radeon Instinct MI325X AMD 256 GB 6,000 GB/s Oct 2024 0.7 GB Q8_0 Cómodo
109,946 tok/s

65,967–175,913 · baja confianza

Radeon Instinct MI300A AMD 128 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
109,946 tok/s

65,967–175,913 · baja confianza

Radeon Instinct MI300X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
109,946 tok/s

65,967–175,913 · baja confianza

Radeon Instinct MI308X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
104,294 tok/s

62,576–166,871 · baja confianza

H100 NVL 94 GB NVIDIA 94 GB 3,940 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
88,941 tok/s

53,365–142,306 · baja confianza

H100 PCIe 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
88,941 tok/s

53,365–142,306 · baja confianza

H100 SXM5 80 GB NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Oct 2022 0.7 GB Q8_0 Cómodo
88,941 tok/s

53,365–142,306 · baja confianza

H100 SXM5 94 GB NVIDIA 94 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
88,941 tok/s

53,365–142,306 · baja confianza

H100 SXM5 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
88,941 tok/s

53,365–142,306 · baja confianza

H800 SXM5 NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
67,722 tok/s

40,633–108,356 · baja confianza

Radeon Instinct MI250 AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.7 GB Q8_0 Cómodo
67,722 tok/s

40,633–108,356 · baja confianza

Radeon Instinct MI250X AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.7 GB Q8_0 Cómodo
56,435 tok/s

33,861–90,296 · baja confianza

Data Center GPU Max 1550 Intel 128 GB 3,280 GB/s Jan 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
55,231 tok/s

33,139–88,369 · baja confianza

Data Center GPU Max Subsystem Intel 128 GB 3,210 GB/s Jan 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo
54,000 tok/s

32,400–86,400 · baja confianza

A100 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Nov 2020 0.7 GB Q8_0 Cómodo
54,000 tok/s

32,400–86,400 · baja confianza

A100X NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Jun 2021 0.7 GB Q8_0 Cómodo
54,000 tok/s

32,400–86,400 · baja confianza

A800 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Aug 2022 0.7 GB Q8_0 Cómodo
54,000 tok/s

32,400–86,400 · baja confianza

H100 CNX NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Cómodo

Las velocidades son estimaciones para una sola solicitud — una conversación a la vez — calculadas a partir del ancho de banda de memoria, el tamaño del modelo y la cuantificación. El rendimiento real varía con el tiempo de inferencia y su versión. Las cifras publicadas por los proveedores de hardware miden muchas solicitudes simultáneas y son mucho más altas..

En registro

especificación completa

Todo en archivo para este modelo. La mayor parte describe cómo fue entrenado en lugar de cómo se ejecuta — contexto útil para juzgar cuánto trabajo se invirtió en él y cómo se compara con modelos construidos a una escala diferente..

Origen

Quién construyó este modelo, dónde, y cuándo fue publicado.

Organización
Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading
Tipo de Organización
Academia,Academia,Industry
País
Israel, United States of America
Publicado
10 February 2022
Autores
Nadav Brandes, Dan Ofer, Yam Peleg, Nadav Rappoport, Michal Linial

Lo que hace

Las áreas problemáticas para las que se construyó el modelo. Un modelo puede llevar varios de cada uno.

Dominio
Biology
Tarea
Proteins, Protein generation, Protein representation learning
Enfoque
Self-supervised learning

Tamaño

Qué tan grande es el modelo y cuántos datos se usaron para su entrenamiento. Los parámetros son la cifra que decide si se ajusta en una tarjeta gráfica dada.

parámetros
16M

"Altogether, it includes ∼16M trainable parameters, making it substantially smaller than other protein language models"

Datos de entrenamiento
37,598,200,000 tokens

Number of proteins: 106,000,000 Average protein length: 300 amino acids Total unique tokens = 106,000,000 × 300 = 31,800,000,000 ≈ 3.2e10 tokens

Épocas
6.4
Tamaño de lote
26,008

Supplementary materials: "During pretraining we used batch sizes of 128, 64 or 32 for episodes of 128, 512 or 1,024 tokens, respectively" Since they seem to be used in equal parts, taking geometric mean: ((128*128)*(64*512)*(32*1024))**(1/3) = 26,008

Cómputo de entrenamiento

La aritmética realizada para entrenar el modelo, medida en operaciones de punto flotante. Es una medida de lo que costó la ejecución del entrenamiento, no de qué tan rápido te responde el modelo terminado.

Cómputo de entrenamiento
6.5 × 10¹⁹ FLOP

"Pretraining speed on a single GPU (Nvidia Quadro RTX 5000) was 280 protein records per second. We trained the model for 28 days over ∼670M records" 28 * 24 * 3600 * 89 TFLOP/s * 0.3 (assumed utilization) = 6.5e19 https://www.wolframalpha.com/input?i=28+days+*+89+TFLOP%2Fs+*+0.3

Cómo se estableció
Hardware

La ejecución de entrenamiento

Lo que costó físicamente entrenar: qué chips, cuántos, por cuánto tiempo y qué eso consumió de la pared.

Hardware de entrenamiento
NVIDIA Quadro RTX 5000
Chips utilizados
1
Tiempo de reloj
672 hours (28 days)

28 days

Consumo de energía
254 W

Disponibilidad

Si puedes obtener el modelo y ejecutarlo en tu propio hardware, lo que decide si alguna de las cifras de la GPU en esta página se aplica.

Pesos
Open — downloadable
Acceso al modelo
Open weights (unrestricted)
Código de entrenamiento
Open source

MIT license https://github.com/nadavbra/protein_bert

Cómo está clasificado

Etiquetas que el conjunto de datos fuente aplica al rastrear modelos notables y cuán confiable es en la entrada.

Por qué se rastrea
SOTA improvement

Table 2: evaluated on TAPE benchmark, not absolute SOTA on all of it, only on Stability (Spearman ρ = 0.76) "ProteinBERT obtains near state-of-the-art performance, and sometimes exceeds it, on multiple benchmarks covering diverse protein properties (including protein structure, post-translational modifications and biophysical attributes)"

Confianza de registro
Confident
Citas
775

Fuentes

De dónde proviene este registro y cuándo fue comprobado por última vez.

Referencia
ProteinBERT: a universal deep-learning model of protein sequence and function
Última actualización
1 January 2026

Los extremos

Qué significan los números

El lado de hardware

Mínima tarjeta

Tesla C1080

Memoria necesaria

0.7 GB

Más rápido

211,765 tok/s

ProteinBERT llega a un recuento de parámetros de 16M. Eso es lo suficientemente pequeño como para que el hardware rara vez sea el obstáculo, incluso en tarjetas de varios años. El número de tarjetas que rastreamos que pueden ejecutarlo: 818.

En el extremo bajo, se maneja por Tesla C1080, con una capacidad de memoria de 4 GB, ejecutándolo a una compresión de Q8_0 y produciendo alrededor 2,304 tokens por segundo

En el otro extremo se encuentra B200, generando aproximadamente 211,765 tokens por segundo en la fuerza de un ancho de banda de memoria de 8,000 GB/s.

Qué es este modelo

ProteinBERT fue publicado por Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading, en el país registrado como Israel, durante February 2022. La organización editora está clasificada como academia,Academia,Industry.

Funciona en el dominio de Biology, y se registra como realizando la tarea de proteins, Protein generation, Protein representation learning.

Los PESOS están publicados, por lo que se puede descargar y ejecutar en su propio HARDWARE indefinidamente, SIN CONEXIÓN, sin cuenta adjunta.

Qué decide la velocidad

La mitad de las tarjetas que lo sostienen gestionan más de 5,946.4 tokens por segundo. Excediendo velocidad de lectura directamente: 818 de ellos.

Es un modelo denso, por lo que cada parámetro se lee para cada token producido. Eso hace que la velocidad rastree el ancho de banda de la memoria casi exactamente: una tarjeta con el doble de ancho de banda genera aproximadamente el doble de rápido.

Su arquitectura interna no está en nuestra base de datos, por lo que la memoria se aproxima a partir del conteo de parámetros y se marca en consecuencia. Se espera que la cifra real difiera, más aún en contextos largos.

Entrenamiento y procedencia

Producirlo requirió una aritmética que totaliza alrededor de 6.5 × 10¹⁹ FLOP, en hardware registrado como NVIDIA Quadro RTX 5000. Esa cifra mide lo que costó producir el modelo, y no tiene relación con qué tan rápido responde.

El conjunto de entrenamiento se ejecutó a aproximadamente 37,598,200,000 tokens de texto

Su criterio de inclusión: sOTA improvement.

Paso a paso

Cómo elegir una GPU para ProteinBERT

La tabla de arriba ya ha evaluado cada tarjeta para la que tenemos especificaciones en contra de este modelo. Llegar a tu respuesta toma seis pasos..

  1. 01

    Lee la cifra de MEMORIA primero

    Cada tarjeta aquí ha sido verificada contra ProteinBERT, necesitando alrededor 0.7 GB a una compresión de Q8_0. Ninguna cantidad de potencia de procesamiento compensa una CARD que no puede sostenerla.

  2. 02

    Decide cuánto duran tus conversaciones.

    Establece el contexto a lo que realmente usarás. La caché crece con la conversación, y es la razón habitual por la que una card que parecía bien deja de fit. ProteinBERT.

  3. 03

    Decide cuánto compresión aceptarás

    La columna de cuantización varía por tarjeta, porque una tarjeta más grande sostiene una copia más precisa., alcanzando una compresión de Q8_0 en la tarjeta más pequeña que cabe. Establecer una calidad mínima elimina las tarjetas que solo la manejan apretando más de lo que desearías, y mantiene la comparación en un nivel.

  4. 04

    Clasifica por rendimiento en lugar de la hoja de especificaciones.

    La velocidad de ordenación es efectivamente un ordenamiento por ancho de banda de GPU. ProteinBERT. No se ajustará a un pedido de gaming, porque la generación está limitada por el ancho de banda de memoria. La tarjeta que encabeza la lista es B200, en 211,765 tok/s

  5. 05

    Lee la columna de ajuste al final

    Tight significa que se carga y funciona sin espacio para aumentar el contexto más tarde, en el caso de ProteinBERT. Cómodo significa que puedes aumentar el contexto más adelante. Esa diferencia importa más que unos pocos tokens por segundo, así que compra por cómodo si esperas hacerlo.

  6. 06

    Abre la tarjeta que has elegido.

    Cada nombre de tarjeta enlaza a su propia página, que ejecuta el mismo cálculo en todo el catálogo del modelo. Una tarjeta generalmente se compra para más de un modelo, por lo que vale la pena echar un vistazo antes de comprar para ProteinBERT.

Respuestas

ProteinBERT — preguntas comunes

01

ProteinBERT— ¿Por qué difiere la cuantificación entre tarjetas?

Cada tarjeta se muestra ejecutando la copia menos comprimida que puede contener. El número de niveles de compresión distintos entre las tarjetas que lo soportan: 1. Las tarjetas más grandes obtienen la versión más precisa, y el nivel de calidad por encima establece la comparación a un nivel.

02

ProteinBERT— ¿Qué tan precisas son estas estimaciones de velocidad?

Estas son estimaciones con barras de error reales, y cualquiera de ellas podría razonablemente situarse en cualquier parte de su rango publicado dependiendo del runtime que utilices. El resultado más rápido aquí: 127,059–338,824 tok/s en B200. El mismo modelo y tarjeta varían entre el treinta y el cincuenta por ciento dependiendo del software de inferencia y su versión.

03

ProteinBERT— ¿Qué GPU necesito para ejecutarlo?

La tarjeta más pequeña en nuestro catálogo que lo sostiene es Tesla C1080, con una capacidad de memoria de 4 GB. Funciona el modelo a una compresión de Q8_0 usando alrededor 0.7 GB, y produce aproximadamente 2,304 tokens por segundo. El número de tarjetas capaces de ejecutarlo en total: 818.

04

ProteinBERT— ¿qué tan rápido es en una GPU?

Depende de la tarjeta. Lo más rápido que calculamos es B200, a aproximadamente 211,765 tokens por segundo; el más lento que aún lo ejecuta consigue considerablemente menos. La velocidad de lectura es de alrededor de diez tokens por segundo, y el número de cards que logran eso: 818.

05

ProteinBERT— ¿Cuánta VRAM necesita?

Necesita aproximadamente 0.7 GB a una compresión de Q8_0, cuál es la tarjeta más pequeña que lo ejecuta. Menos compresión necesita más: las cifras en la columna de memoria anterior se recalculan para cada tarjeta, porque cada una sostiene la versión menos comprimida que puede.

06

ProteinBERT— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 8 GB?

Sí. La tarjeta CMP 170HX 8 GB, sosteniendo 8 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.7 GB y generando aproximadamente 39,441 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

07

ProteinBERT— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 12 GB?

Sí. La tarjeta GeForce RTX 3080 Ti, sosteniendo 12 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.7 GB y generando aproximadamente 24,152 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

08

ProteinBERT— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 16 GB?

Sí. La tarjeta Tesla V100 SXM2 16 GB, sosteniendo 16 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.7 GB y generando aproximadamente 29,912 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

09

ProteinBERT— ¿Puedo ejecutarlo en una GPU que tiene? 24 GB?

Sí. La tarjeta GeForce RTX 5090 D V2, sosteniendo 24 GB, lo ejecuta a una compresión de Q8_0, usando alrededor 0.7 GB y generando aproximadamente 35,471 tokens por segundo. El ajuste es cómodo.

10

ProteinBERT— ¿Es de código abierto?

Sus pesos están publicados, por lo que se pueden descargar y ejecutar en su propio hardware. Tenga en cuenta que OPEN WEIGHTS no es lo mismo que OPEN SOURCE en el sentido completo: no dice nada sobre los datos de entrenamiento, el código de entrenamiento o los términos comerciales adjuntos.

11

ProteinBERT— ¿cuántos parámetros tiene?

Tiene un recuento de parámetros de 16M. "Altogether, it includes ∼16M trainable parameters, making it substantially smaller than other protein language models". Esa cifra es el total, y es lo que decide cuánta MEMORIA necesita el modelo — aproximadamente medio gigabyte por mil millones en la compresión que la mayoría de las personas usa.

12

ProteinBERT— ¿Quién lo creó?

Fue publicado por Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading, basado en Israel, una organización categorizada como academia,Academia,Industry.

13

ProteinBERT— ¿cuándo fue lanzado?

Se publicó en February 2022. La capacidad por parámetro ha mejorado considerablemente desde entonces, por lo que un modelo más reciente del mismo tamaño suele ser el mejor uso del mismo hardware.

14

ProteinBERT— ¿Para qué se utiliza?

Funciona en el dominio de Biology, y se registra como manejando la tarea de proteins, Protein generation, Protein representation learning. Estas son las áreas en las que fue diseñado; describen la intención más que un límite estricto.

15

ProteinBERT— ¿Dónde puedo descargarlo?

Los pesos están publicados, aunque no tenemos un enlace de repositorio para ello. Este sitio calcula los requisitos de hardware en lugar de alojar archivos de modelo.

16

ProteinBERT— cuánto compute se utilizó para entrenarlo?

El entrenamiento consumió alrededor 6.5 × 10¹⁹ FLOP, en hardware registrado como NVIDIA Quadro RTX 5000. Eso mide cuánto costó producir el modelo y no dice nada sobre cuán rápido responde una vez entrenado — la velocidad de inferencia proviene del ancho de banda de memoria, no del presupuesto de entrenamiento.

17

ProteinBERT— ¿Puedo ejecutarlo si no cabe en mi GPU?

Se puede dividir entre la tarjeta y la memoria del sistema, pero se genera muy lentamente de esa manera. Cada cifra aquí asume que todo el modelo está residente en la tarjeta.

18

ProteinBERT— ¿Correrían dos GPUS más rápido?

Dos tarjetas compran memoria en lugar de velocidad, lo cual solo importa si una tarjeta no puede contenerlo. El número que puede: 818. Así que una segunda tarjeta rara vez es la respuesta aquí.

Origen

Publicación original

Última actualización registrada 1 January 2026

La otra dirección

¿Mirándolo desde el otro lado?

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