PTM-Mamba

Ouvrir les poids Duke University February 2024

Aucune estimation

Aucune exigence matérielle pour ce modèle

Les poids de ce modèle sont open, mais aucun compte de paramètres n'a été publié pour celui-ci. Chaque chiffre de mémoire et de vitesse commence à partir de ce nombre, donc nous préférerions ne rien montrer plutôt qu'une estimation fabriquée..

Enregistrement

Spécifications complètes

Tout est enregistré pour ce modèle. La plupart décrit comment il a été entraîné plutôt que comment il fonctionne — un contexte utile pour juger combien de travail a été investi, et comment il se compare avec des modèles construits à une échelle différente..

Origine

Qui a construit ce modèle, où, et quand il a été publié.

Organisation
Duke University
Type d'organisation
Academia
Pays
United States of America
Publié
29 February 2024
Auteurs
Zhangzhi Peng, Benjamin Schussheim, Pranam Chatterjee

Ce qu'il fait

Les domaines problématiques pour lesquels le modèle a été conçu. Un modèle peut contenir plusieurs de chacun.

Domaine
Biology
Tâche
Protein or nucleotide language model (pLM/nLM)
Modèle de base
ESM2-650M

Taille

Quelle est la taille du modèle et combien de données il a été formé. Les paramètres sont le chiffre qui décide s'il convient à une carte graphique donnée.

Données d'entraînement
tokens

79,707 sequences × 400 tokens/sequence = 31,882,800 tokens ≈ 3.2 × 10⁷ tokens

Calcul de formation

L'arithmétique effectuée pour entraîner le modèle, mesurée en opérations en virgule flottante. C'est une mesure du coût de l'exécution de l'entraînement, pas de la rapidité avec laquelle le modèle fini vous répond.

Comment cela a été établi
Hardware

L'exécution de formation

Ce qu'il a physiquement fallu pour entraîner : quels chips, combien, pendant combien de temps, et ce que cela a tiré du secteur.

Matériel d'entraînement
NVIDIA A100
Chips utilisés
8
Consommation d'énergie
6.3 kW

Disponibilité

Que vous puissiez obtenir le modèle et l'exécuter sur votre propre matériel, ce qui détermine si l'un des chiffres de la carte graphique sur cette page s'applique.

Poids
Open — downloadable
Accès au modèle
Open weights (non-commercial)
Code d'entraînement
Open source

CC-BY-NC-ND-4.0 for weights https://huggingface.co/ChatterjeeLab/PTM-Mamba Apache 2.0 for inference and training code https://github.com/programmablebio/ptm-mamba?tab=readme-ov-file

Hugging Face
ChatterjeeLab

Comment il est classé

Étiquettes que le ensemble de données source applique lors du suivi de modèles notables, et à quel point il est confiant dans l'entrée.

Confiance d'enregistrement
Likely
Citations
45

Sources

D'où vient cet enregistrement et quand a-t-il été vérifié pour la dernière fois.

Référence
PTM-Mamba: A PTM-Aware Protein Language Model with Bidirectional Gated Mamba Blocks
Dernière mise à jour
1 January 2026

Ce que les chiffres signifient

Contexte

PTM-Mamba a été publié par Duke University, dans le pays enregistré comme United States of America, durant February 2024. La catégorie à laquelle appartient l'éditeur est academia.

Il fonctionne dans le domaine de Biology, et est enregistré comme exécutant la tâche de protein or nucleotide language model (pLM/nLM).

Plutôt que d'être entraîné depuis le début, il est dérivé de ESM2-650M. C'est la façon habituelle de produire un modèle spécialisé.

Les poids sont publiés, donc il peut être téléchargé et exécuté sur votre propre matériel indéfiniment, hors ligne, sans compte associé. Sur Hugging Face, il est publié sous l'organisation ChatterjeeLab.

Réponses

PTM-Mamba — questions courantes

01

PTM-Mamba— quand a-t-il été publié ?

Il a été publié dans February 2024. La capacité par paramètre s'est considérablement améliorée depuis, donc un modèle plus récent de la même taille est souvent le meilleur usage du même matériel.

02

PTM-Mamba— à quoi ça sert ?

Il fonctionne dans le domaine de Biology, et est enregistré comme gérant la tâche de protein or nucleotide language model (pLM/nLM). Ce sont les domaines autour desquels il a été conçu ; ils décrivent l'intention plutôt qu'une limite stricte.

03

PTM-Mamba— où puis-je le télécharger ?

Ses poids sont publiés sur Hugging Face, sous l'organisation ChatterjeeLab. Nous n'hébergeons pas de fichiers de modèle — ce site calcule le matériel nécessaire pour les faire fonctionner.

04

PTM-Mamba— Quelle GPU ai-je besoin pour l'exécuter ?

Nous ne pouvons pas dire. Il a des poids ouverts, mais aucun compte de paramètres n'a été publié pour cela, et chaque calcul de mémoire et de vitesse part de ce nombre. Nous préférerions ne rien montrer plutôt qu'une estimation fabriquée.

05

PTM-Mamba— est-ce que c'est open source ?

Ses poids sont publiés, donc il peut être téléchargé et exécuté sur votre propre matériel. Notez que les poids ouverts ne sont pas la même chose que l'open source au sens plein — cela ne dit rien sur les données d'entraînement, le code d'entraînement ou les conditions commerciales attachées.

06

PTM-Mamba— combien de paramètres cela a-t-il ?

Aucun nombre de paramètres n'a été publié pour cela, c'est pourquoi aucun chiffre de mémoire ou de vitesse n'apparaît sur cette page.

07

PTM-Mamba— qui l'a créé ?

Il a été publié par Duke University, basé sur United States of America, une organisation catégorisée comme academia.

Source

Publication originale

Dernière mise à jour enregistrée 1 January 2026

L'autre direction

Regardez-le de l'autre côté ?

Cette page commence par le modèle. Si vous possédez déjà une carte et souhaitez savoir tout ce qu'elle exécutera., commencez par le matériel à la place.