DiffBindFR

Nyitott súlyok Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences April 2024

Nincs becslés

Nincs hardver követelmény ennek a modellnek

Ez a modell súlyai nyilvánosak, de a paraméterszámokat nem tették közzé. Minden memória- és sebességszám ebből a számból indul, ezért inkább nem mutatunk semmit, mint egy hamisított becslést..

Nyilvántartásban

Teljes specifikáció

Minden feljegyzett ezzel a modellel kapcsolatban. A legtöbbje azt írja le, hogyan képezték ki, nem pedig azt, hogyan fut — hasznos kontextus annak megítéléséhez, hogy mennyi munka ment bele, és hogyan viszonyul a más méretben épített modellekhez..

Eredet

Ki építette ezt a modellt, hol, és mikor publikálták.

Szervezet
Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences
Szervezet típusa
Academia,Research collective
Ország
China
Közölt
9 April 2024
Szerzők
Jintao Zhu, Zhonghui Gu, Jianfeng Pei, Luhua Lai

Mit csinál

A probléma területek, amelyekre a modell készült. Egy modell több mindegyikből hordozhat.

Tartomány
Biology
Feladat
Protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction

Méret

Mekkora a modell, és mennyi adatot használtak a betanításához. A paraméterek azok a számok, amelyek eldöntik, hogy az adott grafikus kártyára illeszkedik-e.

Képzési adatok
tokens

Data points = 16,739 training structures Note: Epochs (1000) not counted as we only consider unique data points 16,739 = 1.674e4

Képzés számítás

A modell tanításához végrehajtott aritmetika, lebegőpontos műveletekben mérve. Ez a tanítási futás költségének mértéke, nem pedig annak, hogy mennyire gyorsan válaszol a kész modell.

Képzés számítás
4 × 10²⁰ FLOP

1. Hardware setup: - Main model: 8× NVIDIA A800 GPUs (7.80×10¹³ FLOP/s per GPU) - MDN model: 4× NVIDIA Tesla V100-SXM2 GPUs (1.25×10¹⁴ FLOP/s per GPU) 2. Training duration (estimated from steps and step time): - Main model: 262,000 steps × 5s = 1.31×10⁶ seconds (~15 days) - MDN model: 65,000 steps × 5s = 3.25×10⁵ seconds (~3.76 days) 3. Utilization rate: 40% 4. Final calculation: Main: 8 GPUs × 7.80×10¹³ FLOP/s × 1.31×10⁶ s × 0.4 = 3.31×10²⁰ FLOPs MDN: 4 GPUs × 1.25×10¹⁴ FLOP/s × 3.25×10⁵ s ×…

Hogyan jött létre
Hardware

Elérhetőség

Hogy meg tudja-e szerezni a modellt és futtatni a saját hardverén, ez dönt arról, hogy alkalmazhatóak-e a lap ezen oldalán feltüntetett grafikus kártya adatok.

Súlyok
Open — downloadable
Modell hozzáférés
Open weights (unrestricted)
Képzés kód
Unreleased

BSD-3-Clause-Clear license https://github.com/HBioquant/DiffBindFR

Hogyan van besorolva

Címkék a forráshalmazra, amelyeket a figyelemre méltó modellek nyomon követésekor alkalmaznak, és hogy mennyire biztos az adatbevitelben.

Nyilvántartási bizalom
Confident
Hivatkozások
16

Források

Honnan származik ez a felvétel és mikor ellenőrizték utoljára.

Referencia
DiffBindFR: an SE(3) equivariant network for flexible protein–ligand docking
Utoljára frissítve
1 December 2025

Mit jelentenek a számok

Honnan jött

DiffBindFR ki lett adva által Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences, az országban rögzítve mint China, alatt April 2024. A kiadó kategóriája alá tartozik academia,Research collective.

Működik a területen a Biology, és úgy van rögzítve, mint a feladat végrehajtása protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction.

A közzétett súlyok azt jelentik, hogy a modell a te gépeden fut, nem pedig valaki másén, ami lehetővé teszi az alábbi hardverkérdés megválaszolását.

Mi került a felépítésébe

A betanításhoz körülbelül egy számítási költségvetés kellett 4 × 10²⁰ FLOP. Ez a szám azt méri, hogy mennyibe került a modell előállítása, és nincs hatással arra, hogy milyen gyorsan válaszol.

Válaszok

DiffBindFR — gyakori kérdések

01

DiffBindFR— Mire használják?

Működik a területen a Biology, és rögzítve van, hogy kezeli a feladatot protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction. Ezek azok a területek, amelyek köré tervezték; ezek a szándékot írják le, nem pedig egy szigorú határt.

02

DiffBindFR— Hol tudom letölteni?

A súlyok közzététele megtörtént, bár nem rendelkezünk tárolólinkkel erre. Ez az oldal a hardverkövetelményeket számítja ki, nem pedig modellfájlokat tárol.

03

DiffBindFR— mennyi számítási kapacitást használtak annak a betanításához?

A képzés körülbelül elfogyasztott 4 × 10²⁰ FLOP. Ez azt méri, hogy mennyibe került a modell előállítása, és semmit nem mond arról, hogy milyen gyorsan válaszol, miután betanult — a következtetési sebesség a memória sávszélességéből származik, nem az edzési költségvetésből.

04

DiffBindFR— Milyen GPU-ra van szükségem, hogy futtathassam?

Nem tudjuk megmondani. Nyílt súlyai vannak, de a paraméterek számát nem tették közzé, és minden memória- és sebességszámítás ebből a számból indul. Inkább nem mutatunk semmit, mint egy hamisított becslést.

05

DiffBindFR— Nyílt forráskódú?

Súlyai közzétételre kerültek, így letölthető és futtatható a saját hardvereden. Ne feledd, hogy az open weight nem azonos az open source teljes értelmében — nem mond semmit a tanulási adatokkal, a tanulási kóddal vagy a kereskedelmi feltételekkel kapcsolatban.

06

DiffBindFR— Hány paramétere van?

Nincs közzétéve paraméterszám, ezért ez az oldal nem tartalmaz memóriával vagy sebességgel kapcsolatos adatokat.

07

DiffBindFR— Ki készítette ezt?

Kiadta Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences, alapján China, egy szervezet, amelyet kategorizáltak mint academia,Research collective.

08

DiffBindFR— Mikor adták ki?

Kibocsátották a April 2024. A paraméterenkénti képesség lényegesen javult azóta, így egy újabb, azonos méretű modell gyakran jobb felhasználása a same hardvernek.

Forrás

Eredeti kiadvány

Az utolsó frissítés időpontja 1 December 2025

A másik irány

Másik oldalról nézve?

Ez az oldal a modellel kezdődik. Ha már van kártyád, és szeretnéd tudni, hogy mindent futtat-e, Kezdj a hardverből..