DeepFRI

Nyitott súlyok Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT) May 2021

Nincs becslés

Nincs hardver követelmény ennek a modellnek

Ez a modell súlyai nyilvánosak, de a paraméterszámokat nem tették közzé. Minden memória- és sebességszám ebből a számból indul, ezért inkább nem mutatunk semmit, mint egy hamisított becslést..

Nyilvántartásban

Teljes specifikáció

Minden feljegyzett ezzel a modellel kapcsolatban. A legtöbbje azt írja le, hogyan képezték ki, nem pedig azt, hogyan fut — hasznos kontextus annak megítéléséhez, hogy mennyi munka ment bele, és hogyan viszonyul a más méretben épített modellekhez..

Eredet

Ki építette ezt a modellt, hol, és mikor publikálták.

Szervezet
Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT)
Szervezet típusa
Academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia
Ország
United States of America, Poland, New Zealand
Közölt
26 May 2021
Szerzők
Vladimir Gligorijević, P. Douglas Renfrew, Tomasz Kosciolek, Julia Koehler Leman, Daniel Berenberg, Tommi Vatanen, Chris Chandler, Bryn C. Taylor, Ian M. Fisk, Hera Vlamakis, Ramnik J. Xavier, Rob Knight, Kyunghyun Cho & Richard Bonneau

Mit csinál

A probléma területek, amelyekre a modell készült. Egy modell több mindegyikből hordozhat.

Tartomány
Biology
Feladat
Protein function prediction

Méret

Mekkora a modell, és mennyi adatot használtak a betanításához. A paraméterek azok a számok, amelyek eldöntik, hogy az adott grafikus kártyára illeszkedik-e.

Képzési adatok
tokens

30k PDB + 220k SWISS-MODEL = 250k 250k * 0.8 = 200k

Elérhetőség

Hogy meg tudja-e szerezni a modellt és futtatni a saját hardverén, ez dönt arról, hogy alkalmazhatóak-e a lap ezen oldalán feltüntetett grafikus kártya adatok.

Súlyok
Open — downloadable
Modell hozzáférés
Open weights (unrestricted)
Képzés kód
Open source

The source code for training the DeepFRI model, together with neural network weights are available for research and non-commercial use at https://github.com/flatironinstitute/DeepFRI (BSD-3-Clause license) and it can be cited by using https://doi.org/10.5281/zenodo.4650027. A web service of our method is available at https://beta.deepfri.flatironinstitute.org/

Hogyan van besorolva

Címkék a forráshalmazra, amelyeket a figyelemre méltó modellek nyomon követésekor alkalmaznak, és hogy mennyire biztos az adatbevitelben.

Nyilvántartási bizalom
Confident
Hivatkozások
786

Források

Honnan származik ez a felvétel és mikor ellenőrizték utoljára.

Referencia
Structure-based protein function prediction using graph convolutional networks
Utoljára frissítve
1 January 2026

Mit jelentenek a számok

Honnan jött

DeepFRI ki lett adva által Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT), az országban rögzítve mint United States of America, alatt May 2021. A kiadó kategóriája alá tartozik academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia.

Működik a területen a Biology, és úgy van rögzítve, mint a feladat végrehajtása protein function prediction.

Mivel a súlyai ki lettek adva, semmi sem függ attól, hogy egy szolgáltató elérhető marad-e - a tiéd, amint letöltötted.

Válaszok

DeepFRI — gyakori kérdések

01

DeepFRI— Mire használják?

Működik a területen a Biology, és rögzítve van, hogy kezeli a feladatot protein function prediction. Ezek azok a területek, amelyek köré tervezték; ezek a szándékot írják le, nem pedig egy szigorú határt.

02

DeepFRI— Hol tudom letölteni?

A súlyok közzététele megtörtént, bár nem rendelkezünk tárolólinkkel erre. Ez az oldal a hardverkövetelményeket számítja ki, nem pedig modellfájlokat tárol.

03

DeepFRI— Milyen GPU-ra van szükségem, hogy futtathassam?

Nem tudjuk megmondani. Nyílt súlyai vannak, de a paraméterek számát nem tették közzé, és minden memória- és sebességszámítás ebből a számból indul. Inkább nem mutatunk semmit, mint egy hamisított becslést.

04

DeepFRI— Nyílt forráskódú?

Súlyai közzétételre kerültek, így letölthető és futtatható a saját hardvereden. Ne feledd, hogy az open weight nem azonos az open source teljes értelmében — nem mond semmit a tanulási adatokkal, a tanulási kóddal vagy a kereskedelmi feltételekkel kapcsolatban.

05

DeepFRI— Hány paramétere van?

Nincs közzétéve paraméterszám, ezért ez az oldal nem tartalmaz memóriával vagy sebességgel kapcsolatos adatokat.

06

DeepFRI— Ki készítette ezt?

Kiadta Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT), alapján United States of America, egy szervezet, amelyet kategorizáltak mint academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia.

07

DeepFRI— Mikor adták ki?

Kibocsátották a May 2021. A paraméterenkénti képesség lényegesen javult azóta, így egy újabb, azonos méretű modell gyakran jobb felhasználása a same hardvernek.

Forrás

Eredeti kiadvány

Az utolsó frissítés időpontja 1 January 2026

A másik irány

Másik oldalról nézve?

Ez az oldal a modellel kezdődik. Ha már van kártyád, és szeretnéd tudni, hogy mindent futtat-e, Kezdj a hardverből..