LEP-AD

Pesi chiusi King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute 3B parametri March 2023

Nessuna stima

Nessun requisito hardware per questo modello

I pesi per questo modello non sono stati pubblicati, quindi non può essere scaricato o eseguito sul proprio hardware di qualsiasi dimensione. È accessibile solo attraverso il suo fornitore e nessun cambiamento della scheda grafica che.

In registrazione

specifiche complete

Tutto in archivio per questo modello. La maggior parte descrive come è stato addestrato piuttosto che come gira — contesto utile per giudicare quanto lavoro c'è stato dietro, e come si confronta con i modelli costruiti su una scala diversa..

Origine

Chi ha costruito questo modello, dove e quando è stato pubblicato.

Organizzazione
King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute
Tipo di organizzazione
Academia,Academia
Paese
Saudi Arabia, Sweden
Pubblicato
15 March 2023
Autori
Anuj Daga, Sumeer Ahmad Khan, David Gomez Cabrero, Robert Hoehndorf, Narsis A. Kiani, Jesper Tegner

Cosa fa

Le aree problematiche per cui è stato progettato il modello. Un modello può contenere diversi di ciascuno.

Dominio
Biology
Compito
Proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction
Modello di base
ESM2-3B
Formato numerico
FP16

Dimensione

Quanto è grande il modello e su quanti dati è stato addestrato. I parametri sono la cifra che decide se si adatta a una determinata scheda grafica.

parametri
3B

Uses ESM-2 3B. Table 2 gives details on the non-ESM layers. The GCN appears to have about 3.31M parameters and the linear layers should have 771k and 3.3M, respectively. So total is ~3.007B

Dati di addestramento
1,244,420 tokens

Largest dataset appears to be STITCH, at 1244420 drug-target pairs.

Disponibilità

Se puoi ottenere il modello e farlo funzionare sul tuo hardware, il che decide se alcune delle cifre della scheda grafica su questa pagina sono applicabili.

Pesi
Closed — provider access only
Accesso al modello
Unreleased
Codice di addestramento
Open (non-commercial)

https://github.com/adaga06/LEP-AD unclear license

Come è classificato

Etichette del dataset sorgente si applicano quando si tracciano modelli notevoli, e quanto è sicuro nell'entry.

Perché è monitorato
SOTA improvement

Tables 3-5 "We report new best-in-class state-of-the-art results compared to competing methods such as SimBoost, DeepCPI, Attention-DTA, GraphDTA, and more using multiple datasets, including Davis, KIBA, DTC, Metz, ToxCast, and STITCH. Finally, we find that a pre-trained model with embedding of proteins (the LED-AD) outperforms a model using an explicit alpha-fold 3D representation of proteins (e.g., LEP-AD supervised by Alphafold)"

Record fiducia
Confident
Citazioni
1

Fonti

Da dove proviene questo record e quando è stato controllato l'ultima volta.

Riferimento
LEP-AD: Language Embedding of Proteins and Attention to Drugs predicts Drug Target Interactions
Ultimo aggiornamento
28 November 2025

Cosa significano i numeri

Cosa è questo modello

LEP-AD è stato pubblicato da King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute, nel paese registrato come Saudi Arabia, durante March 2023. L'organizzazione di pubblicazione è classificata come academia,Academia.

Funziona nel dominio di Biology, ed è registrato come eseguire il compito di proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction.

Invece di essere addestrato da zero, è derivato da ESM2-3B. La maggior parte dei modelli di questa scala sono adattati da una base esistente piuttosto che costruiti da zero.

Poiché i pesi non sono disponibili, nessuna delle specifiche hardware presenti in questo sito si applica ad esso.

Cosa è stato necessario per costruirlo

L'addestramento ha consumato un corpus di circa 1,244,420 token di testo

Il motivo per cui appare in questo catalogo è: sOTA improvement.

Risposte

LEP-AD — domande comuni

01

LEP-AD— quanti parametri ha?

Ha un numero di parametri di 3B. Uses ESM-2 3B. Table 2 gives details on the non-ESM layers. The GCN appears to have about 3.31M parameters and the linear layers should have 771k and 3.3M, respectively. So total is ~3.007B. Quella cifra è il totale, ed è ciò che decide quanto memoria il modello ha bisogno — circa mezzo gigabyte per miliardo alla compressione che la maggior parte delle persone usa.

02

LEP-AD— chi l'ha creato?

È stato pubblicato da King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute, basato su Saudi Arabia, un'organizzazione categorizzata come academia,Academia.

03

LEP-AD— quando è stato rilasciato?

È stato pubblicato in March 2023. La capacità per parametro è migliorata considerevolmente da allora, quindi un modello più recente della stessa dimensione è spesso un uso migliore dello stesso hardware.

04

LEP-AD— A cosa serve?

Funziona nel dominio di Biology, e viene registrato come gestire il compito di proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction. Un modello può gestire diversi di ciascuno, quindi queste sono le aree per cui è stato costruito piuttosto che un limite su ciò che tenterà.

05

LEP-AD— che GPU ho bisogno per eseguirlo?

Nessuno. Questo è un modello chiuso - i suoi pesi non sono mai stati pubblicati, quindi non può essere scaricato o eseguito sul tuo hardware a qualsiasi prezzo. È accessibile solo attraverso il suo fornitore.

06

LEP-AD— è open-source?

No. I pesi non sono stati pubblicati, quindi esiste solo come servizio controllato dal suo proprietario.

Fonte

Pubblicazione originale

Ultimo aggiornamento del record 28 November 2025

L'altra direzione

Guardandolo dall'altro lato?

Questa pagina parte dal modello. Se possiedi già una scheda e vuoi sapere tutto ciò che farà funzionare, inizia dall'hardware invece.