DNABERT calcolatore TPS
Ogni scheda sottostante è valutata rispetto a questo modello alla lunghezza di contesto e alla qualità minima che scegli. La velocità è una stima per una singola richiesta, calcolata dalla larghezza di banda della memoria della scheda e dalla dimensione del modello una volta compresso..
Calcolato per questo modello
818 schede per cui abbiamo specifiche
Scheda più piccola che si adatta
Tesla C1080
4 GB · Q8_0 · 335 tok/s
Scheda più veloce
B200
30,802 tok/s · 180 GB
Quali GPU possono eseguire DNABERT?
Imposta gli input, leggi la risposta
Una conversazione più lunga richiede più MEMORY, il che può spingere questo modello fuori da schede più piccole..
Nasconde le schede che si adatterebbero solo al modello comprimendolo al di sotto di questo punto..
818 schede corrispondono
Calcolo| Ha bisogno | Quantizzazione | Adatto | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
30,802
tok/s
18,481–49,283 · bassa fiducia |
B200 NVIDIA | 180 GB | 8,000 GB/s | Jan 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
30,802
tok/s
18,481–49,283 · bassa fiducia |
B300 NVIDIA | 288 GB | 8,000 GB/s | Sep 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
24,596
tok/s
14,758–39,354 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI350X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
24,596
tok/s
14,758–39,354 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI355X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
19,671
tok/s
11,803–31,474 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI300 AMD | 128 GB | 6,550 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
18,828
tok/s
11,297–30,124 · bassa fiducia |
H200 NVL NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
18,828
tok/s
11,297–30,124 · bassa fiducia |
H200 SXM 141 GB NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
18,019
tok/s
10,812–28,831 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI325X AMD | 256 GB | 6,000 GB/s | Oct 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI300A AMD | 128 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI300X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI308X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
15,170
tok/s
9,102–24,272 · bassa fiducia |
H100 NVL 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,940 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · bassa fiducia |
H100 PCIe 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · bassa fiducia |
H100 SXM5 80 GB NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Oct 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · bassa fiducia |
H100 SXM5 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · bassa fiducia |
H100 SXM5 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · bassa fiducia |
H800 SXM5 NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
9,851
tok/s
5,910–15,761 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI250 AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
9,851
tok/s
5,910–15,761 · bassa fiducia |
Radeon Instinct MI250X AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
8,209
tok/s
4,925–13,134 · bassa fiducia |
Data Center GPU Max 1550 Intel | 128 GB | 3,280 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
8,034
tok/s
4,820–12,854 · bassa fiducia |
Data Center GPU Max Subsystem Intel | 128 GB | 3,210 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · bassa fiducia |
A100 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Nov 2020 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · bassa fiducia |
A100X NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Jun 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · bassa fiducia |
A800 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Aug 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · bassa fiducia |
H100 CNX NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Comodo |
Le velocità sono stime per una singola richiesta — una conversazione alla volta — calcolate dalla larghezza di banda della memoria, dalla dimensione del modello e dalla quantizzazione. Il throughput reale varia con il runtime di inferenza e la sua versione. I valori pubblicati dai fornitori di hardware misurano molte richieste simultanee e sono molto più elevati..
In registrazione
specifiche complete
Tutto in archivio per questo modello. La maggior parte descrive come è stato addestrato piuttosto che come gira — contesto utile per giudicare quanto lavoro c'è stato dietro, e come si confronta con i modelli costruiti su una scala diversa..
Origine
Chi ha costruito questo modello, dove e quando è stato pubblicato.
- Organizzazione
- Northeastern University
- Tipo di organizzazione
- Academia
- Paese
- United States of America
- Pubblicato
- 15 August 2021
- Autori
- Yanrong Ji, Zhihan Zhou, Han Liu, Ramana V Davuluri
Cosa fa
Le aree problematiche per cui è stato progettato il modello. Un modello può contenere diversi di ciascuno.
- Dominio
- Biology
- Compito
- Protein or nucleotide language model (pLM/nLM)
- Formato numerico
- FP16
Dimensione
Quanto è grande il modello e su quanti dati è stato addestrato. I parametri sono la cifra che decide se si adatta a una determinata scheda grafica.
- parametri
- 110M
- Dati di addestramento
- 1,444,128,539 tokens
- Epoche
- 4.04
"We used the same model architecture as the BERT base, which consists of 12 Transformer layers with 768 hidden units and 12 attention heads in each layer, and the same parameter setting across all the four DNABERT models during pre-training" Known to have 110 million parameters as reported in: https://arxiv.org/pdf/1810.04805v2.pdf "We primarily report results on two model sizes: BERTBASE (L=12, H=768, A=12, Total Parameters=110M) [...]"
The human genome is around 3 billion base pairs (https://useast.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/Annotation). The authors use both non-overlapping sampling and random sampling from a human genome, though the source is unspecified.
Calcolo di addestramento
L'aritmetica eseguita per addestrare il modello, misurata in operazioni in virgola mobile. È una misura di quanto è costato il run di addestramento, e non di quanto velocemente il modello finito ti risponde.
- Calcolo di addestramento
- 1.1 × 10²⁰ FLOP
- Come è stato stabilito
- Hardware,Operation counting
"Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)" Assuming FP16 and 30% utilization Calculation = (25 * 24 *3600) s * 2.7e13 FLOP/s per GPU * 8 GPUs * 0.3 utilization = 1.4e20 FLOP Alternatively: "DNABERT takes a sequence with a max length of 512 as input... We pre-trained DNABERT for 120k steps with a batch size of 2000" 6 * 512 * 2000 * 120k * 110M = 8.11e19 Geometric mean: 1.07e20
La corsa di addestramento
Cosa ha richiesto fisicamente per addestrare: quali chip, quanti, per quanto tempo e cosa ha prelevato dalla presa.
- Hardware di addestramento
- NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 11GB
- Tempo di parete
- 600 hours (25 days)
"Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)"
Disponibilità
Se puoi ottenere il modello e farlo funzionare sul tuo hardware, il che decide se alcune delle cifre della scheda grafica su questa pagina sono applicabili.
- Pesi
- Open — downloadable
- Accesso al modello
- Open weights (unrestricted)
- Codice di addestramento
- Open source
Apache 2.0, code and weights: https://github.com/jerryji1993/DNABERT
Come è classificato
Etichette del dataset sorgente si applicano quando si tracciano modelli notevoli, e quanto è sicuro nell'entry.
- Perché è monitorato
- SOTA improvement
- Record fiducia
- Confident
- Citazioni
- 958
"We show that the single pre-trained transformers model can simultaneously achieve state-of-the-art performance on prediction of promoters, splice sites and transcription factor binding sites, after easy fine-tuning using small task-specific labeled data." [Abstract] - SOTA improvement on very specific task
Fonti
Da dove proviene questo record e quando è stato controllato l'ultima volta.
- Riferimento
- DNABERT: pre-trained Bidirectional Encoder Representations from Transformers model for DNA-language in genome
- Ultimo aggiornamento
- 1 January 2026
Gli estremi
Le dieci GPU più veloci che eseguono DNABERT
Classificato per token stimati al secondo, scheda più recente per prima dove le velocità coincidono. Poiché la generazione è vincolata dalla larghezza di banda della memoria, quest'ordinamento segue la larghezza di banda piuttosto che qualsiasi benchmark di gioco..
- 01 B300 288 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 30,802 tok/s
- 02 B200 180 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 30,802 tok/s
- 03 Radeon Instinct MI350X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 24,596 tok/s
- 04 Radeon Instinct MI355X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 24,596 tok/s
- 05 Radeon Instinct MI300 128 GB · 6,550 GB/s · Q8_0 19,671 tok/s
- 06 H200 NVL 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 18,828 tok/s
- 07 H200 SXM 141 GB 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 18,828 tok/s
- 08 Radeon Instinct MI325X 256 GB · 6,000 GB/s · Q8_0 18,019 tok/s
- 09 Radeon Instinct MI300A 128 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 15,992 tok/s
- 10 Radeon Instinct MI300X 192 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 15,992 tok/s
Le GPU più piccole che ancora funzionano DNABERT
Il percorso più economico, in base alla capacità di memoria. Un adattamento stretto esegue il modello ma non lascia nulla di riserva per una conversazione più lunga..
- 01 GeForce RTX 4010 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 370 tok/s
- 02 RTX A400 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 370 tok/s
- 03 RTX 500 Mobile Ada Generation 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 493 tok/s
- 04 GeForce RTX 3050 A Mobile 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 739 tok/s
- 05 Jetson Orin Nano 4 GB 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 131 tok/s
- 06 Radeon RX 6450M 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 384 tok/s
- 07 Radeon RX 6550M 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 432 tok/s
- 08 Radeon RX 6550S 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 384 tok/s
- 09 Arc A310 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 310 tok/s
- 10 Arc Pro A30M 4 GB · Ha bisogno 0.8 GB · Q8_0 · Comodo 320 tok/s
Cosa significano i numeri
Cosa serve per eseguire questo modello
Scheda minima
Tesla C1080
Memoria necessaria
0.8 GB
Più veloce
30,802 tok/s
DNABERT raggiunge un conteggio di parametri di 110M. È piccolo abbastanza che l'hardware è raramente l'ostacolo, anche su CARD di diversi anni fa. Il numero di CARD che monitoriamo che possono eseguirlo: 818.
La scheda più piccola che lo tiene è Tesla C1080, con una capacità di memoria di 4 GB, eseguendolo a una compressione di Q8_0 e producendo circa 335 token al secondo
Top di gamma è B200, generando approssimativamente 30,802 token al secondo sulla base di una larghezza di banda di VRAM 8,000 GB/s.
Da dove è venuto
DNABERT è stato pubblicato da Northeastern University, nel paese registrato come United States of America, durante August 2021. La categoria sotto cui rientra l'editore è academia.
Funziona nel dominio di Biology, ed è registrato come eseguire il compito di protein or nucleotide language model (pLM/nLM).
I pesi sono pubblicati, quindi possono essere scaricati e eseguiti sul proprio hardware indefinitamente, offline, senza un account associato.
Comprendere le velocità
Su ogni CARD che può eseguirlo, il centro della gamma si trova a 864.9 token al secondo 818 di loro
Ogni peso partecipa a ogni token qui, quindi la larghezza di banda è tutta la storia: la classifica sottostante è effettivamente una classifica del throughput di memoria.
Senza il layout di attenzione in archivio, la colonna della memoria è un'approssimazione. È abbastanza vicino per scegliere l'hardware e meno affidabile con contesto lungo.
Addestramento e provenienza
Il run di addestramento ha consumato circa 1.1 × 10²⁰ FLOP, su hardware registrato come NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 11GB. Quella cifra misura quanto è costata la produzione del modello e non ha alcun impatto su quanto velocemente risponde.
L'addestramento ha consumato un corpus di circa 1,444,128,539 token di testo
È tracciato nel dataset sottostante per una ragione in particolare: sOTA improvement.
Passo dopo passo
Come scegliere una GPU per DNABERT
La tabella sopra ha già valutato ogni card di cui possediamo le specifiche rispetto a questo modello. Arrivare alla tua risposta richiede sei passaggi..
-
01
Controlla cosa serve prima di ogni altra cosa
Inizia da ciò di cui ha realmente bisogno, ovvero il requisito di DNABERT, avere bisogno di circa 0.8 GB a una compressione di Q8_0. Quella cifra, non le prestazioni di punta di una CARD, è ciò che decide se può essere eseguita.
-
02
Imposta la lunghezza del CONTEXT che utilizzerai.
Conversazioni più lunghe richiedono memoria oltre a ciò che i pesi necessitano. Muovi il cursore sulla tua reale lunghezza di lavoro prima di fidarti di qualsiasi riga per DNABERT.
-
03
Imposta un pavimento di qualità
La Compression è ciò che rende un modello adatto a schede più piccole, a fronte di un certo costo in accuratezza., raggiungendo una compressione di Q8_0 sulla scheda più piccola che si adatta. Impostare una qualità minima elimina le schede che riescono a gestirla solo spremendo oltre quanto desiderato e mantiene il confronto a un livello.
-
04
Ordina per velocità
La velocità dell'ordinamento è effettivamente un ordinamento per larghezza di banda di memoria, per DNABERT. Non si adatterà a un'ordinazione da gaming, perché la generazione è vincolata dalla larghezza di banda della memoria. La scheda in cima alla lista è B200, nella 30,802 tok/s
-
05
Guarda il margine, non solo l'adattamento
La colonna della compatibilità separa le schede che riescono appena a farlo da quelle con spazio in più, nel caso di DNABERT. Comfortable significa che puoi espandere il contesto in seguito. Quella differenza conta più di pochi token al secondo, quindi acquista per comfortable se ti aspetti di farlo.
-
06
Vedi cos'altro che questa card esegue
Ogni pagina della scheda ripete questo sondaggio per ogni modello che possediamo, rispondendo a cosa altro l'hardware è utile oltre a DNABERT.
Risposte
DNABERT — domande comuni
DNABERT— posso eseguirlo se non si adatta nella mia GPU?
Solo scaricando, che di solito è una falsa economia: la parte tenuta in SYSTEM MEMORY rallenta tutto. Ogni figura qui presume che l'intero modello sia residente sulla scheda.
DNABERT— due GPU lo farebbero andare più veloce?
La capacità si somma tra le schede; il throughput no. Il numero di schede che già la possiedono da sole: 818. Quindi una seconda CARD è raramente la risposta qui.
DNABERT— perché la quantizzazione differisce tra le schede?
Poiché la capacità varia, così deve essere spremuta. Il numero di livelli distinti nella tabella sopra: 1. Schede più grandi ottengono la versione più accurata e il livello di qualità sopra fissa il confronto a un livello.
DNABERT— quanto sono accurate queste stime di velocità?
Ogni cifra è derivata dalla larghezza di banda della memoria e dalle dimensioni del modello, non calibrata, motivo per cui ognuna è pubblicata come un intervallo anziché come un singolo numero. Un esempio: 18,481–49,283 tok/s su B200. Lo stesso modello e scheda variano tra il trenta e il cinquanta per cento a seconda del software di inferenza e della sua versione.
DNABERT— che GPU ho bisogno per eseguirlo?
La scheda più piccola nel nostro catalogo che la contiene è Tesla C1080, con una capacità di memoria di 4 GB. Esegui il modello a una compressione di Q8_0 utilizzando circa 0.8 GB, e produce approssimativamente 335 token al secondo. Il numero di card in grado di eseguirlo in totale: 818.
DNABERT— quanto è veloce su una GPU?
Dipende dalla scheda. La più rapida che calcoliamo è B200, circa 30,802 token al secondo; il più lento che riesce a farlo gestisce considerevolmente meno. La velocità di lettura è di circa dieci token al secondo, e il numero di schede che riescono a farlo: 818.
DNABERT— quanta VRAM serve?
Ha bisogno di 0.8 GB a una compressione di Q8_0, quale è la scheda più piccola che lo utilizza. Meno compressione richiede di più: le cifre nella colonna della memoria sopra sono ricalcolate per ogni scheda, perché ognuna contiene la versione meno compressa possibile.
DNABERT— posso eseguirlo su una GPU holding 8 GB?
Sì. La scheda CMP 170HX 8 GB, tenere 8 GB, lo esegue a una compressione di Q8_0, utilizzando circa 0.8 GB e generando approssimativamente 5,737 token al secondo. Il fit è comodo.
DNABERT— posso eseguirlo su una GPU holding 12 GB?
Sì. La scheda GeForce RTX 3080 Ti, tenere 12 GB, lo esegue a una compressione di Q8_0, utilizzando circa 0.8 GB e generando approssimativamente 3,513 token al secondo. Il fit è comodo.
DNABERT— posso eseguirlo su una GPU holding 16 GB?
Sì. La scheda Tesla V100 SXM2 16 GB, tenere 16 GB, lo esegue a una compressione di Q8_0, utilizzando circa 0.8 GB e generando approssimativamente 4,351 token al secondo. Il fit è comodo.
DNABERT— posso eseguirlo su una GPU holding 24 GB?
Sì. La scheda GeForce RTX 5090 D V2, tenere 24 GB, lo esegue a una compressione di Q8_0, utilizzando circa 0.8 GB e generando approssimativamente 5,159 token al secondo. Il fit è comodo.
DNABERT— è open-source?
I suoi pesi sono pubblicati, quindi può essere scaricato e eseguito sul proprio hardware. Si noti che OPEN WEIGHTS non è lo stesso di OPEN SOURCE nel senso completo — non dice nulla sui dati di addestramento, sul codice di addestramento o sui termini commerciali allegati.
DNABERT— quanti parametri ha?
Ha un numero di parametri di 110M. "We used the same model architecture as the BERT base, which consists of 12 Transformer layers with 768 hidden units and 12 attention heads in each layer, and the same parameter setting across all the four DNABERT models during pre-training" Known to have 110 million parameters as reported in: https://arxiv.org/pdf/1810.04805v2.pdf "We primarily report results on two model sizes: BERTBASE (L=12, H=768, A=12, Total Parameters=110M) [...]". Quella cifra è il totale, ed è ciò che decide quanto memoria il modello ha bisogno — circa mezzo gigabyte per miliardo alla compressione che la maggior parte delle persone usa.
DNABERT— chi l'ha creato?
È stato pubblicato da Northeastern University, basato su United States of America, un'organizzazione categorizzata come academia.
DNABERT— quando è stato rilasciato?
È stato pubblicato in August 2021. La capacità per parametro è migliorata considerevolmente da allora, quindi un modello più recente della stessa dimensione è spesso un uso migliore dello stesso hardware.
DNABERT— A cosa serve?
Funziona nel dominio di Biology, e viene registrato come gestire il compito di protein or nucleotide language model (pLM/nLM). Queste sono le aree su cui è stato progettato; descrivono l'intento piuttosto che un confine rigido.
DNABERT— Dove posso scaricarlo?
I pesi sono pubblicati, anche se non abbiamo un link al repository per essi. Questo sito calcola i requisiti hardware anziché ospitare file di modello.
DNABERT— quanto calcolo è stato utilizzato per addestrarlo?
L'addestramento ha consumato circa 1.1 × 10²⁰ FLOP, su hardware registrato come NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 11GB. Questo misura quanto costa produrre il modello e non dice nulla su quanto rapidamente risponde una volta addestrato — la velocità di inferenza deriva dalla larghezza di banda della memoria, non dal budget di addestramento.
L'altra direzione
Guardandolo dall'altro lato?
Questa pagina parte dal modello. Se possiedi già una scheda e vuoi sapere tutto ciò che farà funzionare, inizia dall'hardware invece.