OntoProtein calculateur TPS
Chaque carte ci-dessous est évaluée par rapport à ce modèle à la longueur de contexte et à la qualité minimale que vous choisissez. La vitesse est une estimation pour une demande unique, calculée à partir de la bande passante mémoire de la carte et de la taille du modèle une fois compressé..
Calculé pour ce modèle
818 cartes dont nous détenons les spécifications pour
Carte la plus petite qui convient
Tesla C1080
4 GB · Q8_0 · 87.8 tok/s
Carte la plus rapide
B200
8,067 tok/s · 180 GB
Quelles GPU peuvent exécuter OntoProtein?
Définir les entrées, lire la réponse
Une conversation plus longue nécessite plus de mémoire, ce qui peut pousser ce modèle hors des cartes plus petites..
Cache des cartes qui ne conviendraient qu'au modèle en le compressant en dessous de ce point..
818 cartes correspondent
Calcul en cours| Besoin | Quantification | Convient | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
8,067
tok/s
4,840–12,908 · faible confiance |
B200 NVIDIA | 180 GB | 8,000 GB/s | Jan 2024 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
8,067
tok/s
4,840–12,908 · faible confiance |
B300 NVIDIA | 288 GB | 8,000 GB/s | Sep 2025 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
6,442
tok/s
3,865–10,307 · faible confiance |
Radeon Instinct MI350X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
6,442
tok/s
3,865–10,307 · faible confiance |
Radeon Instinct MI355X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
5,152
tok/s
3,091–8,243 · faible confiance |
Radeon Instinct MI300 AMD | 128 GB | 6,550 GB/s | Jan 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
4,931
tok/s
2,959–7,890 · faible confiance |
H200 NVL NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
4,931
tok/s
2,959–7,890 · faible confiance |
H200 SXM 141 GB NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
4,719
tok/s
2,832–7,551 · faible confiance |
Radeon Instinct MI325X AMD | 256 GB | 6,000 GB/s | Oct 2024 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
4,188
tok/s
2,513–6,701 · faible confiance |
Radeon Instinct MI300A AMD | 128 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
4,188
tok/s
2,513–6,701 · faible confiance |
Radeon Instinct MI300X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
4,188
tok/s
2,513–6,701 · faible confiance |
Radeon Instinct MI308X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
3,973
tok/s
2,384–6,357 · faible confiance |
H100 NVL 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,940 GB/s | Mar 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
3,388
tok/s
2,033–5,421 · faible confiance |
H100 PCIe 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
3,388
tok/s
2,033–5,421 · faible confiance |
H100 SXM5 80 GB NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Oct 2022 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
3,388
tok/s
2,033–5,421 · faible confiance |
H100 SXM5 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
3,388
tok/s
2,033–5,421 · faible confiance |
H100 SXM5 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
3,388
tok/s
2,033–5,421 · faible confiance |
H800 SXM5 NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
2,580
tok/s
1,548–4,128 · faible confiance |
Radeon Instinct MI250 AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
2,580
tok/s
1,548–4,128 · faible confiance |
Radeon Instinct MI250X AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
2,150
tok/s
1,290–3,440 · faible confiance |
Data Center GPU Max 1550 Intel | 128 GB | 3,280 GB/s | Jan 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
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2,104
tok/s
1,262–3,366 · faible confiance |
Data Center GPU Max Subsystem Intel | 128 GB | 3,210 GB/s | Jan 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
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2,057
tok/s
1,234–3,291 · faible confiance |
A100 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Nov 2020 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
2,057
tok/s
1,234–3,291 · faible confiance |
A100X NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Jun 2021 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
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2,057
tok/s
1,234–3,291 · faible confiance |
A800 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Aug 2022 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
|
2,057
tok/s
1,234–3,291 · faible confiance |
H100 CNX NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Mar 2023 | 1.1 GB | Q8_0 | Confortable |
Les vitesses sont des estimations pour une seule demande — une conversation à la fois — calculées à partir de la bande passante de la mémoire, de la taille du modèle et de la quantification. Le débit réel varie avec le temps d'exécution d'inférence et sa version. Les chiffres publiés par les fournisseurs de matériel mesurent de nombreuses demandes simultanées et sont beaucoup plus élevés..
Enregistrement
Spécifications complètes
Tout est enregistré pour ce modèle. La plupart décrit comment il a été entraîné plutôt que comment il fonctionne — un contexte utile pour juger combien de travail a été investi, et comment il se compare avec des modèles construits à une échelle différente..
Origine
Qui a construit ce modèle, où, et quand il a été publié.
- Organisation
- Zhejiang University (ZJU)
- Type d'organisation
- Academia
- Pays
- China
- Publié
- 23 January 2022
- Auteurs
- Ningyu Zhang, Zhen Bi, Xiaozhuan Liang, Siyuan Cheng, Shumin Deng, Qiang Zhang, Jiazhang Lian, Huajun Chen, Haosen Hong
Ce qu'il fait
Les domaines problématiques pour lesquels le modèle a été conçu. Un modèle peut contenir plusieurs de chacun.
- Domaine
- Biology, Language
- Tâche
- Proteins, Protein or nucleotide language model (pLM/nLM), Protein interaction prediction, Protein function prediction, Protein representation learning
- Modèle de base
- ProtBERT-BFD
- Format numérique
- FP16
Taille
Quelle est la taille du modèle et combien de données il a été formé. Les paramètres sont le chiffre qui décide s'il convient à une carte graphique donnée.
- paramètres
- 420M
- Données d'entraînement
- 2,868,520,960 tokens
"For the protein encoder, we use the pre-trained ProtBert from Elnaggar et al. (2020)."
Data Summary: - Protein tokens: 488,000 × 300 = 1.464 × 10^8 - GO term tokens: 612,483 × 20 = 1.224966 × 10^7 - Knowledge graph triples: 4,990,097 Total: (1.464 × 10^8 + 1.224966 × 10^7 + 4.99 × 10^6) ≈ 1.626 × 10^8 data points
Disponibilité
Que vous puissiez obtenir le modèle et l'exécuter sur votre propre matériel, ce qui détermine si l'un des chiffres de la carte graphique sur cette page s'applique.
- Poids
- Open — downloadable
- Accès au modèle
- Open weights (unrestricted)
- Code d'entraînement
- Open source
- Hugging Face
- zjunlp
MIT license https://github.com/zjunlp/OntoProtein unclear license https://huggingface.co/zjunlp/OntoProtein
Comment il est classé
Étiquettes que le ensemble de données source applique lors du suivi de modèles notables, et à quel point il est confiant dans l'entrée.
- Pourquoi c'est suivi
- SOTA improvement
- Confiance d'enregistrement
- Likely
Not absolute SOTA, outperforms protein-language models but not MSA transformer. Experimental results show that OntoProtein can surpass state-of-the-art methods with pre-trained protein language models in TAPE benchmark and yield better performance compared with baselines in protein-protein interaction and protein function prediction1.
Sources
D'où vient cet enregistrement et quand a-t-il été vérifié pour la dernière fois.
- Référence
- ONTOPROTEIN: PROTEIN PRETRAINING WITH GENE ONTOLOGY EMBEDDING
- Dernière mise à jour
- 28 November 2025
Les extrêmes
Les dix GPU les plus rapides qui exécutent OntoProtein
Classé par tokens par seconde estimés, la carte la plus récente en premier lorsque les vitesses se rejoignent. Étant donné que la génération est limitée par la bande passante de la mémoire, cet ordre suit la bande passante plutôt que tout indice de jeu..
- 01 B300 288 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 8,067 tok/s
- 02 B200 180 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 8,067 tok/s
- 03 Radeon Instinct MI350X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 6,442 tok/s
- 04 Radeon Instinct MI355X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 6,442 tok/s
- 05 Radeon Instinct MI300 128 GB · 6,550 GB/s · Q8_0 5,152 tok/s
- 06 H200 NVL 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 4,931 tok/s
- 07 H200 SXM 141 GB 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 4,931 tok/s
- 08 Radeon Instinct MI325X 256 GB · 6,000 GB/s · Q8_0 4,719 tok/s
- 09 Radeon Instinct MI300A 128 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 4,188 tok/s
- 10 Radeon Instinct MI300X 192 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 4,188 tok/s
Les plus petits GPU qui fonctionnent encore OntoProtein
Le chemin le moins cher, par capacité de mémoire. Un ajustement serré exécute le modèle mais ne laisse rien de libre pour une conversation plus longue..
- 01 GeForce RTX 4010 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 96.8 tok/s
- 02 RTX A400 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 96.8 tok/s
- 03 RTX 500 Mobile Ada Generation 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 129 tok/s
- 04 GeForce RTX 3050 A Mobile 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 194 tok/s
- 05 Jetson Orin Nano 4 GB 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 34.4 tok/s
- 06 Radeon RX 6450M 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 101 tok/s
- 07 Radeon RX 6550M 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 113 tok/s
- 08 Radeon RX 6550S 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 101 tok/s
- 09 Arc A310 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 81.3 tok/s
- 10 Arc Pro A30M 4 GB · Besoin 1.1 GB · Q8_0 · Confortable 83.9 tok/s
Ce que les chiffres signifient
Ce dont vous avez besoin pour l'exécuter
Carte minimale
Tesla C1080
Mémoire requise
1.1 GB
Le plus rapide
8,067 tok/s
OntoProtein atteint un nombre de paramètres de 420M. C'est suffisamment petit pour que le matériel soit rarement l'obstacle, y compris sur des CARDS âgées de plusieurs années. Le nombre de CARDS que nous suivons et qui peuvent le faire fonctionner : 818.
Le matériel minimum qui fonctionne est Tesla C1080, avec une capacité de mémoire de 4 GB, le faisant fonctionner à une compression de Q8_0 et produisant environ 87.8 tokens par seconde
Haut de gamme est B200, générant à peu près 8,067 tokens par seconde sur la base d'une bande passante de mémoire de 8,000 GB/s.
Ce que ce modèle est
OntoProtein a été publié par Zhejiang University (ZJU), dans le pays enregistré comme China, durant January 2022. Cela provient d'une organisation classée comme academia.
Il fonctionne dans le domaine de Biology, Language, et est enregistré comme exécutant la tâche de proteins, Protein or nucleotide language model (pLM/nLM), Protein interaction prediction, Protein function prediction, Protein representation learning.
Il s'appuie sur ProtBERT-BFD. C'est la façon habituelle de produire un modèle spécialisé.
Les poids sont publiés, donc il peut être téléchargé et exécuté sur votre propre matériel indéfiniment, hors ligne, sans compte associé. Sur Hugging Face, il est publié sous l'organisation zjunlp.
Qu'est-ce qui détermine la vitesse
Le résultat médian est d'environ 226.5 tokens par seconde 817 d'eux
Étant dense, il lit tout de lui-même par jeton, c'est pourquoi le classement par vitesse ci-dessous suit de si près le classement par bande passante mémoire.
Sans la disposition d'attention sur fichier, la colonne de mémoire est une approximation. Elle est suffisamment proche pour choisir le matériel, et la moins fiable sur un long contexte.
Comment il a été entraîné
L'entraînement a consommé un corpus d'environ 2,868,520,960 jetons de texte
Son critère d'inclusion : sOTA improvement.
Étape par étape
Comment choisir un GPU pour OntoProtein
Le tableau ci-dessus a déjà évalué chaque carte pour laquelle nous avons des spécifications par rapport à ce modèle. Obtenir votre réponse prend six étapes..
-
01
Lisez d'abord le chiffre de mémoire
Chaque carte ici a été vérifiée contre OntoProtein, ayant besoin d'environ 1.1 GB à une compression de Q8_0. La capacité est la porte — une carte soit la détient soit ne la détient pas.
-
02
Décidez combien de temps vos conversations tournent
Définissez le contexte de ce que vous allez réellement utiliser. Le cache augmente avec la conversation, et c'est la raison habituelle pour laquelle une carte qui semblait convenir cesse de s'adapter. OntoProtein.
-
03
Décidez combien de compression vous allez accepter
La colonne de quantification varie selon la carte, car une plus grande carte contient une copie plus précise., atteignant une compression de Q8_0 sur la plus petite carte qui convient. Fixer une qualité minimale élimine les cartes qui ne parviennent à l'atteindre qu'en exerçant une pression plus forte que vous ne le souhaiteriez, et maintient la comparaison à un niveau.
-
04
Comparez les tokens par seconde, pas les spécifications.
Trier par vitesse pour voir comment les cartes se classent pour OntoProtein. Il ne s'alignera pas sur une commande de jeu, car la génération est limitée par la bande passante de la mémoire. La carte en tête de liste est B200, à 8,067 tok/s
-
05
Vérifiez le verdict de compatibilité avant d'acheter
La colonne d'adéquation sépare les cartes qui y parviennent juste de celles qui ont de la marge, dans le cas de OntoProtein. Confortable signifie que vous pouvez augmenter le contexte plus tard. Cette différence compte plus que quelques tokens par seconde, donc achetez pour confortable si vous vous attendez à cela.
-
06
Vérifiez la carte de l'autre côté
Suivre une CARTE jusqu'à sa propre page montre chaque autre MODÈLE qu'elle peut supporter, ce qui est la question qui suit une fois que vous vous êtes décidé sur OntoProtein.
Réponses
OntoProtein — questions courantes
OntoProtein— combien de VRAM cela nécessite-t-il ?
Cela nécessite environ 1.1 GB à une compression de Q8_0, laquelle est la plus petite carte qui l'exécute. Moins de compression nécessite plus : les chiffres dans la colonne mémoire ci-dessus sont recalculés pour chaque carte, car chacune détient la version la moins compressée qu'elle peut.
OntoProtein— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 8 GB ?
Oui. La carte CMP 170HX 8 GB, tenue 8 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 1.1 GO et générant à peu près 1,503 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
OntoProtein— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 12 GB ?
Oui. La carte GeForce RTX 3080 Ti, tenue 12 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 1.1 GO et générant à peu près 920 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
OntoProtein— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 16 GB ?
Oui. La carte Tesla V100 SXM2 16 GB, tenue 16 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 1.1 GO et générant à peu près 1,140 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
OntoProtein— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 24 GB ?
Oui. La carte GeForce RTX 5090 D V2, tenue 24 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 1.1 GO et générant à peu près 1,351 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
OntoProtein— est-ce que c'est open source ?
Ses poids sont publiés, donc il peut être téléchargé et exécuté sur votre propre matériel. Notez que les poids ouverts ne sont pas la même chose que l'open source au sens plein — cela ne dit rien sur les données d'entraînement, le code d'entraînement ou les conditions commerciales attachées.
OntoProtein— combien de paramètres cela a-t-il ?
Il a un nombre de paramètres de 420M. "For the protein encoder, we use the pre-trained ProtBert from Elnaggar et al. (2020).". Ce chiffre est le total, et c'est ce qui détermine combien de mémoire le modèle nécessite — environ un demi-gigaoctet par milliard à la compression que la plupart des gens utilisent.
OntoProtein— qui l'a créé ?
Il a été publié par Zhejiang University (ZJU), basé sur China, une organisation catégorisée comme academia.
OntoProtein— quand a-t-il été publié ?
Il a été publié dans January 2022. La capacité par paramètre s'est considérablement améliorée depuis, donc un modèle plus récent de la même taille est souvent le meilleur usage du même matériel.
OntoProtein— à quoi ça sert ?
Il fonctionne dans le domaine de Biology, Language, et est enregistré comme gérant la tâche de proteins, Protein or nucleotide language model (pLM/nLM), Protein interaction prediction, Protein function prediction, Protein representation learning. Les modèles portent souvent plus d'un de chacun, et les tags décrivent l'objectif plutôt que les limites de capacité.
OntoProtein— où puis-je le télécharger ?
Ses poids sont publiés sur Hugging Face, sous l'organisation zjunlp. Nous n'hébergeons pas de fichiers de modèle — ce site calcule le matériel nécessaire pour les faire fonctionner.
OntoProtein— Puis-je l'exécuter s'il ne tient pas dans ma GPU?
Il peut être réparti entre la carte et la mémoire système, mais cela génère de manière douloureuse lentement. Chaque chiffre ici suppose que l'ensemble du modèle est résident sur la carte.
OntoProtein— deux GPUs l'exécuteraient-ils plus rapidement ?
Deux cartes achètent de la mémoire plutôt que de la vitesse, ce qui est important seulement si une carte ne peut pas la contenir. Le nombre qui peut : 818. Ainsi, une seconde carte est rarement la réponse ici.
OntoProtein— pourquoi la quantification diffère-t-elle entre les cartes ?
Parce que la capacité varie, il en va de même pour la difficulté à être comprimé. Le nombre de niveaux distincts dans le tableau ci-dessus : 1. Les cartes plus grandes obtiennent la version plus précise, et le seuil de qualité au-dessus fixe la comparaison à un niveau.
OntoProtein— quelle est la précision de ces estimations de vitesse ?
Ils sont calculés à partir des spécifications plutôt que mesurés, et chacun a une plage. Un exemple : 4,840–12,908 tok/s sur B200. Le même modèle et carte varient de trente à cinquante pour cent en fonction du logiciel d'inférence et de sa version.
OntoProtein— Quelle GPU ai-je besoin pour l'exécuter ?
La plus petite CARTE de notre catalogue qui le supporte est Tesla C1080, avec une capacité de mémoire de 4 GB. Il exécute le modèle à une compression de Q8_0 environ 1.1 GB, et produit environ 87.8 tous les GPU capables de l'exécuter en total 818.
OntoProtein— à quelle vitesse est-il sur un GPU ?
Cela dépend de la carte. Le plus rapide que nous calculons est B200, à propos de 8,067 tokens par seconde; le plus lent qui fonctionne encore gère considérablement moins. La vitesse de lecture est d'environ dix tokens par seconde, et le nombre de cartes qui réussissent cela : 817.
L'autre direction
Regardez-le de l'autre côté ?
Cette page commence par le modèle. Si vous possédez déjà une carte et souhaitez savoir tout ce qu'elle exécutera., commencez par le matériel à la place.