AlphaFold 2 calculateur TPS

Ouvrir les poids DeepMind 93M paramètres November 2020

Chaque carte ci-dessous est évaluée par rapport à ce modèle à la longueur de contexte et à la qualité minimale que vous choisissez. La vitesse est une estimation pour une demande unique, calculée à partir de la bande passante mémoire de la carte et de la taille du modèle une fois compressé..

Calculé pour ce modèle

818 cartes qui peuvent le faire

818 cartes dont nous détenons les spécifications pour

Carte la plus petite qui convient

Tesla C1080

4 GB · Q8_0 · 396 tok/s

Carte la plus rapide

B200

36,433 tok/s · 180 GB

Quelles GPU peuvent exécuter AlphaFold 2?

Définir les entrées, lire la réponse

Une conversation plus longue nécessite plus de mémoire, ce qui peut pousser ce modèle hors des cartes plus petites..

Cache des cartes qui ne conviendraient qu'au modèle en le compressant en dessous de ce point..

818 cartes correspondent

Calcul en cours
Besoin Quantification Convient
36,433 tok/s

21,860–58,292 · faible confiance

B200 NVIDIA 180 GB 8,000 GB/s Jan 2024 0.8 GB Q8_0 Confortable
36,433 tok/s

21,860–58,292 · faible confiance

B300 NVIDIA 288 GB 8,000 GB/s Sep 2025 0.8 GB Q8_0 Confortable
29,092 tok/s

17,455–46,548 · faible confiance

Radeon Instinct MI350X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.8 GB Q8_0 Confortable
29,092 tok/s

17,455–46,548 · faible confiance

Radeon Instinct MI355X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.8 GB Q8_0 Confortable
23,267 tok/s

13,960–37,227 · faible confiance

Radeon Instinct MI300 AMD 128 GB 6,550 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
22,269 tok/s

13,362–35,631 · faible confiance

H200 NVL NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.8 GB Q8_0 Confortable
22,269 tok/s

13,362–35,631 · faible confiance

H200 SXM 141 GB NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.8 GB Q8_0 Confortable
21,313 tok/s

12,788–34,101 · faible confiance

Radeon Instinct MI325X AMD 256 GB 6,000 GB/s Oct 2024 0.8 GB Q8_0 Confortable
18,915 tok/s

11,349–30,265 · faible confiance

Radeon Instinct MI300A AMD 128 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
18,915 tok/s

11,349–30,265 · faible confiance

Radeon Instinct MI300X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
18,915 tok/s

11,349–30,265 · faible confiance

Radeon Instinct MI308X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
17,943 tok/s

10,766–28,709 · faible confiance

H100 NVL 94 GB NVIDIA 94 GB 3,940 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
15,302 tok/s

9,181–24,483 · faible confiance

H100 PCIe 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
15,302 tok/s

9,181–24,483 · faible confiance

H100 SXM5 80 GB NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Oct 2022 0.8 GB Q8_0 Confortable
15,302 tok/s

9,181–24,483 · faible confiance

H100 SXM5 94 GB NVIDIA 94 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
15,302 tok/s

9,181–24,483 · faible confiance

H100 SXM5 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
15,302 tok/s

9,181–24,483 · faible confiance

H800 SXM5 NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
11,651 tok/s

6,991–18,642 · faible confiance

Radeon Instinct MI250 AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.8 GB Q8_0 Confortable
11,651 tok/s

6,991–18,642 · faible confiance

Radeon Instinct MI250X AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.8 GB Q8_0 Confortable
9,709 tok/s

5,826–15,535 · faible confiance

Data Center GPU Max 1550 Intel 128 GB 3,280 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
9,502 tok/s

5,701–15,203 · faible confiance

Data Center GPU Max Subsystem Intel 128 GB 3,210 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable
9,290 tok/s

5,574–14,865 · faible confiance

A100 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Nov 2020 0.8 GB Q8_0 Confortable
9,290 tok/s

5,574–14,865 · faible confiance

A100X NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Jun 2021 0.8 GB Q8_0 Confortable
9,290 tok/s

5,574–14,865 · faible confiance

A800 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Aug 2022 0.8 GB Q8_0 Confortable
9,290 tok/s

5,574–14,865 · faible confiance

H100 CNX NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Confortable

Les vitesses sont des estimations pour une seule demande — une conversation à la fois — calculées à partir de la bande passante de la mémoire, de la taille du modèle et de la quantification. Le débit réel varie avec le temps d'exécution d'inférence et sa version. Les chiffres publiés par les fournisseurs de matériel mesurent de nombreuses demandes simultanées et sont beaucoup plus élevés..

Enregistrement

Spécifications complètes

Tout est enregistré pour ce modèle. La plupart décrit comment il a été entraîné plutôt que comment il fonctionne — un contexte utile pour juger combien de travail a été investi, et comment il se compare avec des modèles construits à une échelle différente..

Origine

Qui a construit ce modèle, où, et quand il a été publié.

Organisation
DeepMind
Type d'organisation
Industry
Pays
United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
Publié
30 November 2020
Auteurs
John Jumper, Richard Evans, Alexander Pritzel, Tim Green, Michael Figurnov, Kathryn Tunyasuvunakool, Olaf Ronneberger, Russ Bates, Augustin Žídek, Alex Bridgland, Clemens Meyer, Simon A A Kohl, Anna Potapenko, Andrew J Ballard, Andrew Cowie, Bernardino Romera-Paredes, Stanislav Nikolov, Rishub Jain, Jonas Adler, Trevor Back, Stig Petersen, David Reiman, Martin Steinegger, Michalina Pacholska, Davi…

Ce qu'il fait

Les domaines problématiques pour lesquels le modèle a été conçu. Un modèle peut contenir plusieurs de chacun.

Domaine
Biology
Tâche
Protein folding prediction, Proteins
Format numérique
BF16

Taille

Quelle est la taille du modèle et combien de données il a été formé. Les paramètres sont le chiffre qui décide s'il convient à une carte graphique donnée.

paramètres
93M

https://arxiv.org/abs/2207.05477 reimplements AlphaFold 2 in a more efficient way, and states there are 93M parameters in the original version (Table 1)

Données d'entraînement
5,724,000,000 tokens

3 different types of input data to the network: (1) Amino acid sequence (2) Multiple sequence alignments (MSA) to sequences from evolutionarily related proteins (3) Template structures (3D atom coordinates of homologous structures), where available Training data is processed into the following two datasets that are sampled with different probabilities. Supplementary Material, Section 1.2.4. Training data: "With 75% probability a training example comes from the self-distillation set (see subsec…

Calcul de formation

L'arithmétique effectuée pour entraîner le modèle, mesurée en opérations en virgule flottante. C'est une mesure du coût de l'exécution de l'entraînement, pas de la rapidité avec laquelle le modèle fini vous répond.

Calcul de formation
3 × 10²¹ FLOP

123 teraFLOPS / TPU v3 chip * 128 cores * (1 chip / 2 cores) * 11 days * 40% utilization = 2.99e21 FLOP https://www.wolframalpha.com/input?i=123+teraFLOPS+*+128+*+11+days+*+0.4 "Training regimen" section: "We train the model on Tensor Processing Unit (TPU) v3 with a batch size of 1 per TPU core, hence the model uses 128 TPU v3 cores. [...] The initial training stage takes approximately 1 week, and the fine-tuning stage takes approximately 4 additional days."

Comment cela a été établi
Hardware

L'exécution de formation

Ce qu'il a physiquement fallu pour entraîner : quels chips, combien, pendant combien de temps, et ce que cela a tiré du secteur.

Matériel d'entraînement
Google TPU v3
Temps en temps réel
264 hours (11 days)

7 days pretrain and 4 days finetune

Coût de calcul
$3,842

Disponibilité

Que vous puissiez obtenir le modèle et l'exécuter sur votre propre matériel, ce qui détermine si l'un des chiffres de la carte graphique sur cette page s'applique.

Poids
Open — downloadable
Accès au modèle
Open weights (unrestricted)
Code d'entraînement
Unreleased

While the AlphaFold code is licensed under the Apache 2.0 License, the AlphaFold parameters and CASP15 prediction data are made available under the terms of the CC BY 4.0 license code in this repo is inference code: https://github.com/google-deepmind/alphafold

Comment il est classé

Étiquettes que le ensemble de données source applique lors du suivi de modèles notables, et à quel point il est confiant dans l'entrée.

Pourquoi c'est suivi
Historical significance,Highly cited,SOTA improvement

"Here we provide the first computational method that can regularly predict protein structures with atomic accuracy even in cases in which no similar structure is known" [Abstract] >17790 citations "In the challenging 14th Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP14)15, demonstrating accuracy competitive with experimental structures in a majority of cases and greatly outperforming other methods."

Confiance d'enregistrement
Likely
Citations
31,909

Sources

D'où vient cet enregistrement et quand a-t-il été vérifié pour la dernière fois.

Référence
Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold
Dernière mise à jour
1 January 2026

Les extrêmes

Ce que les chiffres signifient

Exigences matérielles en pratique

Carte minimale

Tesla C1080

Mémoire requise

0.8 GB

Le plus rapide

36,433 tok/s

AlphaFold 2 atteint un nombre de paramètres de 93M. C'est suffisamment petit pour que le matériel soit rarement l'obstacle, y compris sur des CARDS âgées de plusieurs années. Le nombre de CARDS que nous suivons et qui peuvent le faire fonctionner : 818.

Le point d'entrée est Tesla C1080, avec une capacité de mémoire de 4 GB, le faisant fonctionner à une compression de Q8_0 et produisant environ 396 tokens par seconde

Haut de gamme est B200, générant à peu près 36,433 tokens par seconde sur la base d'une bande passante de mémoire de 8,000 GB/s.

D'où cela vient-il

AlphaFold 2 a été publié par DeepMind, dans le pays enregistré comme United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, durant November 2020. L'organisation de publication est catégorisée comme industry.

Il fonctionne dans le domaine de Biology, et est enregistré comme exécutant la tâche de protein folding prediction, Proteins.

Parce que ses poids ont été publiés, rien sur son exécution ne dépend d'un fournisseur restant disponible — il est à vous une fois téléchargé.

Comprendre les vitesses

Le résultat médian est d'environ 1,023.0 tokens par seconde 818 d'eux

C'est un modèle dense, donc chaque paramètre est lu pour chaque jeton produit. Cela rend la vitesse presque exactement proportionnelle à la bande passante mémoire — une carte avec le double de la bande passante génère environ deux fois plus rapidement.

La mémoire ici est estimée à partir de la taille plutôt que calculée à partir de l'architecture, qui n'est pas enregistrée pour ce modèle — les chiffres sont indicatifs plutôt qu'exacts.

Entraînement et provenance

L'entraînement a nécessité un budget de calcul d'environ 3 × 10²¹ FLOP, sur matériel enregistré comme Google TPU v3. Ce chiffre mesure le coût de production du modèle, et n'a aucune incidence sur la vitesse de réponse.

L'ensemble d'entraînement a duré environ 5,724,000,000 jetons de texte

Son critère d'inclusion : historical significance,Highly cited,SOTA improvement.

Étape par étape

Comment choisir un GPU pour AlphaFold 2

Le tableau ci-dessus a déjà évalué chaque carte pour laquelle nous avons des spécifications par rapport à ce modèle. Obtenir votre réponse prend six étapes..

  1. 01

    Commencez par la colonne mémoire

    La table répertorie chaque carte capable de supporter AlphaFold 2, ayant besoin d'environ 0.8 GB à une compression de Q8_0. La capacité est la porte — une carte soit la détient soit ne la détient pas.

  2. 02

    Faites correspondre le contexte à votre utilisation réelle.

    La conversation occupe aussi de la mémoire et grandit au fur et à mesure. Réglez le curseur sur la longueur que vous attendez, car avec un long CONTEXTE, une CARTE qui gère facilement les courtes questions peut être abandonnée par. AlphaFold 2.

  3. 03

    Décidez combien de compression vous allez accepter

    La colonne de quantification varie selon la carte, car une plus grande carte contient une copie plus précise., atteignant une compression de Q8_0 sur la plus petite carte qui convient. Fixer une qualité minimale élimine les cartes qui ne parviennent à l'atteindre qu'en exerçant une pression plus forte que vous ne le souhaiteriez, et maintient la comparaison à un niveau.

  4. 04

    Classer par débit plutôt que par fiche technique

    Trier par vitesse pour voir comment les cartes se classent pour AlphaFold 2. Il ne s'alignera pas sur une commande de jeu, car la génération est limitée par la bande passante de la mémoire. La carte en tête de liste est B200, à 36,433 tok/s

  5. 05

    Vérifiez le verdict de compatibilité avant d'acheter

    Un ajustement serré fonctionne, mais ne laisse rien de libre pour une conversation plus longue, dans le cas de AlphaFold 2. Confortable signifie que vous pouvez augmenter le contexte plus tard. Cette différence compte plus que quelques tokens par seconde, donc achetez pour confortable si vous vous attendez à cela.

  6. 06

    Voir ce que cette carte exécute d'autre.

    Chaque page de carte répète ce balayage pour chaque modèle que nous détenons, répondant à ce que le matériel peut faire d'autre au-delà de AlphaFold 2.

Réponses

AlphaFold 2 — questions courantes

01

AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter s'il ne tient pas dans ma GPU?

Partiellement. Les couches qui ne tiennent pas sont dans la mémoire système et fonctionnent à une fraction de la vitesse, donc un modèle principalement déchargé vaut rarement la peine d'être utilisé. Chaque chiffre ici suppose que l'ensemble du modèle est résident sur la carte.

02

AlphaFold 2— deux GPUs l'exécuteraient-ils plus rapidement ?

Une seconde carte double à peu près la mémoire disponible mais pas le taux de génération. Le nombre déjà capable de le faire seul : 818. Ainsi, une seconde carte est rarement la réponse ici.

03

AlphaFold 2— pourquoi la quantification diffère-t-elle entre les cartes ?

Chaque carte est montrée en exécutant la copie la moins compressée qu'elle peut contenir. Le nombre de niveaux de compression distincts parmi les cartes qui la supportent : 1. Les cartes plus grandes obtiennent la version plus précise, et le seuil de qualité au-dessus fixe la comparaison à un niveau.

04

AlphaFold 2— quelle est la précision de ces estimations de vitesse ?

Ce sont des estimations avec de véritables barres d'erreur, et n'importe lequel d'entre eux pourrait raisonnablement se situer n'importe où dans sa plage publiée en fonction du temps d'exécution que vous utilisez. Le résultat le plus rapide ici : 21,860–58,292 tok/s sur B200. Le même modèle et carte varient de trente à cinquante pour cent en fonction du logiciel d'inférence et de sa version.

05

AlphaFold 2— Quelle GPU ai-je besoin pour l'exécuter ?

La plus petite CARTE de notre catalogue qui le supporte est Tesla C1080, avec une capacité de mémoire de 4 GB. Il exécute le modèle à une compression de Q8_0 environ 0.8 GB, et produit environ 396 tous les GPU capables de l'exécuter en total 818.

06

AlphaFold 2— à quelle vitesse est-il sur un GPU ?

Cela dépend de la carte. Le plus rapide que nous calculons est B200, à propos de 36,433 tokens par seconde; le plus lent qui fonctionne encore gère considérablement moins. La vitesse de lecture est d'environ dix tokens par seconde, et le nombre de cartes qui réussissent cela : 818.

07

AlphaFold 2— combien de VRAM cela nécessite-t-il ?

Cela nécessite environ 0.8 GB à une compression de Q8_0, laquelle est la plus petite carte qui l'exécute. Moins de compression nécessite plus : les chiffres dans la colonne mémoire ci-dessus sont recalculés pour chaque carte, car chacune détient la version la moins compressée qu'elle peut.

08

AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 8 GB ?

Oui. La carte CMP 170HX 8 GB, tenue 8 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 6,786 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.

09

AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 12 GB ?

Oui. La carte GeForce RTX 3080 Ti, tenue 12 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 4,155 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.

10

AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 16 GB ?

Oui. La carte Tesla V100 SXM2 16 GB, tenue 16 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 5,146 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.

11

AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 24 GB ?

Oui. La carte GeForce RTX 5090 D V2, tenue 24 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 6,102 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.

12

AlphaFold 2— est-ce que c'est open source ?

Ses poids sont publiés, donc il peut être téléchargé et exécuté sur votre propre matériel. Notez que les poids ouverts ne sont pas la même chose que l'open source au sens plein — cela ne dit rien sur les données d'entraînement, le code d'entraînement ou les conditions commerciales attachées.

13

AlphaFold 2— combien de paramètres cela a-t-il ?

Il a un nombre de paramètres de 93M. https://arxiv.org/abs/2207.05477 reimplements AlphaFold 2 in a more efficient way, and states there are 93M parameters in the original version (Table 1). Ce chiffre est le total, et c'est ce qui détermine combien de mémoire le modèle nécessite — environ un demi-gigaoctet par milliard à la compression que la plupart des gens utilisent.

14

AlphaFold 2— qui l'a créé ?

Il a été publié par DeepMind, basé sur United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, une organisation catégorisée comme industry.

15

AlphaFold 2— quand a-t-il été publié ?

Il a été publié dans November 2020. La capacité par paramètre s'est considérablement améliorée depuis, donc un modèle plus récent de la même taille est souvent le meilleur usage du même matériel.

16

AlphaFold 2— à quoi ça sert ?

Il fonctionne dans le domaine de Biology, et est enregistré comme gérant la tâche de protein folding prediction, Proteins. Un modèle peut porter plusieurs de chacun, donc ce sont les domaines pour lesquels il a été conçu plutôt qu'une limite sur ce qu'il tentera.

17

AlphaFold 2— où puis-je le télécharger ?

Les poids sont publiés, bien que nous ne possédions pas de lien vers un dépôt pour cela. Ce site calcule les exigences matérielles plutôt que d'héberger des fichiers de modèle.

18

AlphaFold 2— combien de puissance de calcul a été utilisée pour l'entraîner ?

L'entraînement a consommé environ 3 × 10²¹ FLOP, sur matériel enregistré comme Google TPU v3. Cela mesure ce que coûte la production du modèle et ne dit rien sur la rapidité avec laquelle il répond une fois entraîné — la vitesse d'inférence provient de la bande passante mémoire, et non du budget d'entraînement.

Source

Publication originale

Dernière mise à jour enregistrée 1 January 2026

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