AlphaFold 2 calculateur TPS
Chaque carte ci-dessous est évaluée par rapport à ce modèle à la longueur de contexte et à la qualité minimale que vous choisissez. La vitesse est une estimation pour une demande unique, calculée à partir de la bande passante mémoire de la carte et de la taille du modèle une fois compressé..
Calculé pour ce modèle
818 cartes dont nous détenons les spécifications pour
Carte la plus petite qui convient
Tesla C1080
4 GB · Q8_0 · 396 tok/s
Carte la plus rapide
B200
36,433 tok/s · 180 GB
Quelles GPU peuvent exécuter AlphaFold 2?
Définir les entrées, lire la réponse
Une conversation plus longue nécessite plus de mémoire, ce qui peut pousser ce modèle hors des cartes plus petites..
Cache des cartes qui ne conviendraient qu'au modèle en le compressant en dessous de ce point..
818 cartes correspondent
Calcul en cours| Besoin | Quantification | Convient | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
36,433
tok/s
21,860–58,292 · faible confiance |
B200 NVIDIA | 180 GB | 8,000 GB/s | Jan 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
36,433
tok/s
21,860–58,292 · faible confiance |
B300 NVIDIA | 288 GB | 8,000 GB/s | Sep 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
29,092
tok/s
17,455–46,548 · faible confiance |
Radeon Instinct MI350X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
29,092
tok/s
17,455–46,548 · faible confiance |
Radeon Instinct MI355X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
23,267
tok/s
13,960–37,227 · faible confiance |
Radeon Instinct MI300 AMD | 128 GB | 6,550 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
22,269
tok/s
13,362–35,631 · faible confiance |
H200 NVL NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
22,269
tok/s
13,362–35,631 · faible confiance |
H200 SXM 141 GB NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
21,313
tok/s
12,788–34,101 · faible confiance |
Radeon Instinct MI325X AMD | 256 GB | 6,000 GB/s | Oct 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
18,915
tok/s
11,349–30,265 · faible confiance |
Radeon Instinct MI300A AMD | 128 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
18,915
tok/s
11,349–30,265 · faible confiance |
Radeon Instinct MI300X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
18,915
tok/s
11,349–30,265 · faible confiance |
Radeon Instinct MI308X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
17,943
tok/s
10,766–28,709 · faible confiance |
H100 NVL 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,940 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
15,302
tok/s
9,181–24,483 · faible confiance |
H100 PCIe 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
15,302
tok/s
9,181–24,483 · faible confiance |
H100 SXM5 80 GB NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Oct 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
15,302
tok/s
9,181–24,483 · faible confiance |
H100 SXM5 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
15,302
tok/s
9,181–24,483 · faible confiance |
H100 SXM5 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
15,302
tok/s
9,181–24,483 · faible confiance |
H800 SXM5 NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
11,651
tok/s
6,991–18,642 · faible confiance |
Radeon Instinct MI250 AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
11,651
tok/s
6,991–18,642 · faible confiance |
Radeon Instinct MI250X AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
9,709
tok/s
5,826–15,535 · faible confiance |
Data Center GPU Max 1550 Intel | 128 GB | 3,280 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
9,502
tok/s
5,701–15,203 · faible confiance |
Data Center GPU Max Subsystem Intel | 128 GB | 3,210 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
9,290
tok/s
5,574–14,865 · faible confiance |
A100 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Nov 2020 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
9,290
tok/s
5,574–14,865 · faible confiance |
A100X NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Jun 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
9,290
tok/s
5,574–14,865 · faible confiance |
A800 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Aug 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
|
9,290
tok/s
5,574–14,865 · faible confiance |
H100 CNX NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Confortable |
Les vitesses sont des estimations pour une seule demande — une conversation à la fois — calculées à partir de la bande passante de la mémoire, de la taille du modèle et de la quantification. Le débit réel varie avec le temps d'exécution d'inférence et sa version. Les chiffres publiés par les fournisseurs de matériel mesurent de nombreuses demandes simultanées et sont beaucoup plus élevés..
Enregistrement
Spécifications complètes
Tout est enregistré pour ce modèle. La plupart décrit comment il a été entraîné plutôt que comment il fonctionne — un contexte utile pour juger combien de travail a été investi, et comment il se compare avec des modèles construits à une échelle différente..
Origine
Qui a construit ce modèle, où, et quand il a été publié.
- Organisation
- DeepMind
- Type d'organisation
- Industry
- Pays
- United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland
- Publié
- 30 November 2020
- Auteurs
- John Jumper, Richard Evans, Alexander Pritzel, Tim Green, Michael Figurnov, Kathryn Tunyasuvunakool, Olaf Ronneberger, Russ Bates, Augustin Žídek, Alex Bridgland, Clemens Meyer, Simon A A Kohl, Anna Potapenko, Andrew J Ballard, Andrew Cowie, Bernardino Romera-Paredes, Stanislav Nikolov, Rishub Jain, Jonas Adler, Trevor Back, Stig Petersen, David Reiman, Martin Steinegger, Michalina Pacholska, Davi…
Ce qu'il fait
Les domaines problématiques pour lesquels le modèle a été conçu. Un modèle peut contenir plusieurs de chacun.
- Domaine
- Biology
- Tâche
- Protein folding prediction, Proteins
- Format numérique
- BF16
Taille
Quelle est la taille du modèle et combien de données il a été formé. Les paramètres sont le chiffre qui décide s'il convient à une carte graphique donnée.
- paramètres
- 93M
- Données d'entraînement
- 5,724,000,000 tokens
https://arxiv.org/abs/2207.05477 reimplements AlphaFold 2 in a more efficient way, and states there are 93M parameters in the original version (Table 1)
3 different types of input data to the network: (1) Amino acid sequence (2) Multiple sequence alignments (MSA) to sequences from evolutionarily related proteins (3) Template structures (3D atom coordinates of homologous structures), where available Training data is processed into the following two datasets that are sampled with different probabilities. Supplementary Material, Section 1.2.4. Training data: "With 75% probability a training example comes from the self-distillation set (see subsec…
Calcul de formation
L'arithmétique effectuée pour entraîner le modèle, mesurée en opérations en virgule flottante. C'est une mesure du coût de l'exécution de l'entraînement, pas de la rapidité avec laquelle le modèle fini vous répond.
- Calcul de formation
- 3 × 10²¹ FLOP
- Comment cela a été établi
- Hardware
123 teraFLOPS / TPU v3 chip * 128 cores * (1 chip / 2 cores) * 11 days * 40% utilization = 2.99e21 FLOP https://www.wolframalpha.com/input?i=123+teraFLOPS+*+128+*+11+days+*+0.4 "Training regimen" section: "We train the model on Tensor Processing Unit (TPU) v3 with a batch size of 1 per TPU core, hence the model uses 128 TPU v3 cores. [...] The initial training stage takes approximately 1 week, and the fine-tuning stage takes approximately 4 additional days."
L'exécution de formation
Ce qu'il a physiquement fallu pour entraîner : quels chips, combien, pendant combien de temps, et ce que cela a tiré du secteur.
- Matériel d'entraînement
- Google TPU v3
- Temps en temps réel
- 264 hours (11 days)
- Coût de calcul
- $3,842
7 days pretrain and 4 days finetune
Disponibilité
Que vous puissiez obtenir le modèle et l'exécuter sur votre propre matériel, ce qui détermine si l'un des chiffres de la carte graphique sur cette page s'applique.
- Poids
- Open — downloadable
- Accès au modèle
- Open weights (unrestricted)
- Code d'entraînement
- Unreleased
While the AlphaFold code is licensed under the Apache 2.0 License, the AlphaFold parameters and CASP15 prediction data are made available under the terms of the CC BY 4.0 license code in this repo is inference code: https://github.com/google-deepmind/alphafold
Comment il est classé
Étiquettes que le ensemble de données source applique lors du suivi de modèles notables, et à quel point il est confiant dans l'entrée.
- Pourquoi c'est suivi
- Historical significance,Highly cited,SOTA improvement
- Confiance d'enregistrement
- Likely
- Citations
- 31,909
"Here we provide the first computational method that can regularly predict protein structures with atomic accuracy even in cases in which no similar structure is known" [Abstract] >17790 citations "In the challenging 14th Critical Assessment of protein Structure Prediction (CASP14)15, demonstrating accuracy competitive with experimental structures in a majority of cases and greatly outperforming other methods."
Sources
D'où vient cet enregistrement et quand a-t-il été vérifié pour la dernière fois.
- Référence
- Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold
- Dernière mise à jour
- 1 January 2026
Les extrêmes
Les dix GPU les plus rapides qui exécutent AlphaFold 2
Classé par tokens par seconde estimés, la carte la plus récente en premier lorsque les vitesses se rejoignent. Étant donné que la génération est limitée par la bande passante de la mémoire, cet ordre suit la bande passante plutôt que tout indice de jeu..
- 01 B300 288 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 36,433 tok/s
- 02 B200 180 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 36,433 tok/s
- 03 Radeon Instinct MI350X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 29,092 tok/s
- 04 Radeon Instinct MI355X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 29,092 tok/s
- 05 Radeon Instinct MI300 128 GB · 6,550 GB/s · Q8_0 23,267 tok/s
- 06 H200 NVL 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 22,269 tok/s
- 07 H200 SXM 141 GB 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 22,269 tok/s
- 08 Radeon Instinct MI325X 256 GB · 6,000 GB/s · Q8_0 21,313 tok/s
- 09 Radeon Instinct MI300A 128 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 18,915 tok/s
- 10 Radeon Instinct MI300X 192 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 18,915 tok/s
Les plus petits GPU qui fonctionnent encore AlphaFold 2
Le chemin le moins cher, par capacité de mémoire. Un ajustement serré exécute le modèle mais ne laisse rien de libre pour une conversation plus longue..
- 01 GeForce RTX 4010 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 437 tok/s
- 02 RTX A400 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 437 tok/s
- 03 RTX 500 Mobile Ada Generation 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 583 tok/s
- 04 GeForce RTX 3050 A Mobile 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 874 tok/s
- 05 Jetson Orin Nano 4 GB 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 155 tok/s
- 06 Radeon RX 6450M 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 455 tok/s
- 07 Radeon RX 6550M 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 512 tok/s
- 08 Radeon RX 6550S 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 455 tok/s
- 09 Arc A310 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 367 tok/s
- 10 Arc Pro A30M 4 GB · Besoin 0.8 GB · Q8_0 · Confortable 379 tok/s
Ce que les chiffres signifient
Exigences matérielles en pratique
Carte minimale
Tesla C1080
Mémoire requise
0.8 GB
Le plus rapide
36,433 tok/s
AlphaFold 2 atteint un nombre de paramètres de 93M. C'est suffisamment petit pour que le matériel soit rarement l'obstacle, y compris sur des CARDS âgées de plusieurs années. Le nombre de CARDS que nous suivons et qui peuvent le faire fonctionner : 818.
Le point d'entrée est Tesla C1080, avec une capacité de mémoire de 4 GB, le faisant fonctionner à une compression de Q8_0 et produisant environ 396 tokens par seconde
Haut de gamme est B200, générant à peu près 36,433 tokens par seconde sur la base d'une bande passante de mémoire de 8,000 GB/s.
D'où cela vient-il
AlphaFold 2 a été publié par DeepMind, dans le pays enregistré comme United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, durant November 2020. L'organisation de publication est catégorisée comme industry.
Il fonctionne dans le domaine de Biology, et est enregistré comme exécutant la tâche de protein folding prediction, Proteins.
Parce que ses poids ont été publiés, rien sur son exécution ne dépend d'un fournisseur restant disponible — il est à vous une fois téléchargé.
Comprendre les vitesses
Le résultat médian est d'environ 1,023.0 tokens par seconde 818 d'eux
C'est un modèle dense, donc chaque paramètre est lu pour chaque jeton produit. Cela rend la vitesse presque exactement proportionnelle à la bande passante mémoire — une carte avec le double de la bande passante génère environ deux fois plus rapidement.
La mémoire ici est estimée à partir de la taille plutôt que calculée à partir de l'architecture, qui n'est pas enregistrée pour ce modèle — les chiffres sont indicatifs plutôt qu'exacts.
Entraînement et provenance
L'entraînement a nécessité un budget de calcul d'environ 3 × 10²¹ FLOP, sur matériel enregistré comme Google TPU v3. Ce chiffre mesure le coût de production du modèle, et n'a aucune incidence sur la vitesse de réponse.
L'ensemble d'entraînement a duré environ 5,724,000,000 jetons de texte
Son critère d'inclusion : historical significance,Highly cited,SOTA improvement.
Étape par étape
Comment choisir un GPU pour AlphaFold 2
Le tableau ci-dessus a déjà évalué chaque carte pour laquelle nous avons des spécifications par rapport à ce modèle. Obtenir votre réponse prend six étapes..
-
01
Commencez par la colonne mémoire
La table répertorie chaque carte capable de supporter AlphaFold 2, ayant besoin d'environ 0.8 GB à une compression de Q8_0. La capacité est la porte — une carte soit la détient soit ne la détient pas.
-
02
Faites correspondre le contexte à votre utilisation réelle.
La conversation occupe aussi de la mémoire et grandit au fur et à mesure. Réglez le curseur sur la longueur que vous attendez, car avec un long CONTEXTE, une CARTE qui gère facilement les courtes questions peut être abandonnée par. AlphaFold 2.
-
03
Décidez combien de compression vous allez accepter
La colonne de quantification varie selon la carte, car une plus grande carte contient une copie plus précise., atteignant une compression de Q8_0 sur la plus petite carte qui convient. Fixer une qualité minimale élimine les cartes qui ne parviennent à l'atteindre qu'en exerçant une pression plus forte que vous ne le souhaiteriez, et maintient la comparaison à un niveau.
-
04
Classer par débit plutôt que par fiche technique
Trier par vitesse pour voir comment les cartes se classent pour AlphaFold 2. Il ne s'alignera pas sur une commande de jeu, car la génération est limitée par la bande passante de la mémoire. La carte en tête de liste est B200, à 36,433 tok/s
-
05
Vérifiez le verdict de compatibilité avant d'acheter
Un ajustement serré fonctionne, mais ne laisse rien de libre pour une conversation plus longue, dans le cas de AlphaFold 2. Confortable signifie que vous pouvez augmenter le contexte plus tard. Cette différence compte plus que quelques tokens par seconde, donc achetez pour confortable si vous vous attendez à cela.
-
06
Voir ce que cette carte exécute d'autre.
Chaque page de carte répète ce balayage pour chaque modèle que nous détenons, répondant à ce que le matériel peut faire d'autre au-delà de AlphaFold 2.
Réponses
AlphaFold 2 — questions courantes
AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter s'il ne tient pas dans ma GPU?
Partiellement. Les couches qui ne tiennent pas sont dans la mémoire système et fonctionnent à une fraction de la vitesse, donc un modèle principalement déchargé vaut rarement la peine d'être utilisé. Chaque chiffre ici suppose que l'ensemble du modèle est résident sur la carte.
AlphaFold 2— deux GPUs l'exécuteraient-ils plus rapidement ?
Une seconde carte double à peu près la mémoire disponible mais pas le taux de génération. Le nombre déjà capable de le faire seul : 818. Ainsi, une seconde carte est rarement la réponse ici.
AlphaFold 2— pourquoi la quantification diffère-t-elle entre les cartes ?
Chaque carte est montrée en exécutant la copie la moins compressée qu'elle peut contenir. Le nombre de niveaux de compression distincts parmi les cartes qui la supportent : 1. Les cartes plus grandes obtiennent la version plus précise, et le seuil de qualité au-dessus fixe la comparaison à un niveau.
AlphaFold 2— quelle est la précision de ces estimations de vitesse ?
Ce sont des estimations avec de véritables barres d'erreur, et n'importe lequel d'entre eux pourrait raisonnablement se situer n'importe où dans sa plage publiée en fonction du temps d'exécution que vous utilisez. Le résultat le plus rapide ici : 21,860–58,292 tok/s sur B200. Le même modèle et carte varient de trente à cinquante pour cent en fonction du logiciel d'inférence et de sa version.
AlphaFold 2— Quelle GPU ai-je besoin pour l'exécuter ?
La plus petite CARTE de notre catalogue qui le supporte est Tesla C1080, avec une capacité de mémoire de 4 GB. Il exécute le modèle à une compression de Q8_0 environ 0.8 GB, et produit environ 396 tous les GPU capables de l'exécuter en total 818.
AlphaFold 2— à quelle vitesse est-il sur un GPU ?
Cela dépend de la carte. Le plus rapide que nous calculons est B200, à propos de 36,433 tokens par seconde; le plus lent qui fonctionne encore gère considérablement moins. La vitesse de lecture est d'environ dix tokens par seconde, et le nombre de cartes qui réussissent cela : 818.
AlphaFold 2— combien de VRAM cela nécessite-t-il ?
Cela nécessite environ 0.8 GB à une compression de Q8_0, laquelle est la plus petite carte qui l'exécute. Moins de compression nécessite plus : les chiffres dans la colonne mémoire ci-dessus sont recalculés pour chaque carte, car chacune détient la version la moins compressée qu'elle peut.
AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 8 GB ?
Oui. La carte CMP 170HX 8 GB, tenue 8 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 6,786 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 12 GB ?
Oui. La carte GeForce RTX 3080 Ti, tenue 12 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 4,155 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 16 GB ?
Oui. La carte Tesla V100 SXM2 16 GB, tenue 16 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 5,146 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
AlphaFold 2— Puis-je l'exécuter sur un GPU détenant 24 GB ?
Oui. La carte GeForce RTX 5090 D V2, tenue 24 GB, l'exécute à une compression de Q8_0, environ 0.8 GO et générant à peu près 6,102 jetons par seconde. L'adéquation est confortable.
AlphaFold 2— est-ce que c'est open source ?
Ses poids sont publiés, donc il peut être téléchargé et exécuté sur votre propre matériel. Notez que les poids ouverts ne sont pas la même chose que l'open source au sens plein — cela ne dit rien sur les données d'entraînement, le code d'entraînement ou les conditions commerciales attachées.
AlphaFold 2— combien de paramètres cela a-t-il ?
Il a un nombre de paramètres de 93M. https://arxiv.org/abs/2207.05477 reimplements AlphaFold 2 in a more efficient way, and states there are 93M parameters in the original version (Table 1). Ce chiffre est le total, et c'est ce qui détermine combien de mémoire le modèle nécessite — environ un demi-gigaoctet par milliard à la compression que la plupart des gens utilisent.
AlphaFold 2— qui l'a créé ?
Il a été publié par DeepMind, basé sur United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland, une organisation catégorisée comme industry.
AlphaFold 2— quand a-t-il été publié ?
Il a été publié dans November 2020. La capacité par paramètre s'est considérablement améliorée depuis, donc un modèle plus récent de la même taille est souvent le meilleur usage du même matériel.
AlphaFold 2— à quoi ça sert ?
Il fonctionne dans le domaine de Biology, et est enregistré comme gérant la tâche de protein folding prediction, Proteins. Un modèle peut porter plusieurs de chacun, donc ce sont les domaines pour lesquels il a été conçu plutôt qu'une limite sur ce qu'il tentera.
AlphaFold 2— où puis-je le télécharger ?
Les poids sont publiés, bien que nous ne possédions pas de lien vers un dépôt pour cela. Ce site calcule les exigences matérielles plutôt que d'héberger des fichiers de modèle.
AlphaFold 2— combien de puissance de calcul a été utilisée pour l'entraîner ?
L'entraînement a consommé environ 3 × 10²¹ FLOP, sur matériel enregistré comme Google TPU v3. Cela mesure ce que coûte la production du modèle et ne dit rien sur la rapidité avec laquelle il répond une fois entraîné — la vitesse d'inférence provient de la bande passante mémoire, et non du budget d'entraînement.
L'autre direction
Regardez-le de l'autre côté ?
Cette page commence par le modèle. Si vous possédez déjà une carte et souhaitez savoir tout ce qu'elle exécutera., commencez par le matériel à la place.