PTM-Mamba

Open gewichten Duke University February 2024

Geen schatting

Geen hardware-eisen voor dit model

Dit model's gewichten zijn open-source, maar er is geen parameter aantal gepubliceerd. Elk geheugen- en snelheidsfiguur begint vanaf dat nummer, dus we geven liever niets weer dan een gefabriceerde schatting..

Op record

Volledige specificatie

Alles wat geregistreerd is voor dit model. Het merendeel beschrijft hoe het getraind werd in plaats van hoe het draait - nuttige context om te beoordelen hoeveel werk erin is gestoken, en hoe het zich verhoudt tot modellen die op een andere schaal zijn gebouwd..

Oorsprong

Wie heeft dit model gebouwd, waar, en wanneer het gepubliceerd werd.

Organisatie
Duke University
Organisatietype
Academia
Land
United States of America
Gepubliceerd
29 February 2024
Auteurs
Zhangzhi Peng, Benjamin Schussheim, Pranam Chatterjee

Wat het doet

De probleemgebieden waarvoor het model is gebouwd. Een model kan meerdere van elk bevatten.

Domein
Biology
Taak
Protein or nucleotide language model (pLM/nLM)
Basis model
ESM2-650M

Grootte

Hoe groot het model is en hoeveel data het is getraind. Parameters zijn het cijfer dat bepaalt of het past op een gegeven grafische kaart.

Training gegevens
tokens

79,707 sequences × 400 tokens/sequence = 31,882,800 tokens ≈ 3.2 × 10⁷ tokens

Training rekenen

De berekeningen uitgevoerd om het model te trainen, gemeten in drijvende-komma-operaties. Het is een maat voor wat de trainingsrun kostte, niet voor hoe snel het voltooide model je beantwoordt.

Hoe het werd opgericht
Hardware

De trainingsrun

Wat het fysiek kostte om te trainen: welke chips, hoeveel, hoe lang, en wat dat van het stopcontact vroeg.

Training hardware
NVIDIA A100
Gebruikte chips
8
Stroomverbruik
6.3 kW

Beschikbaarheid

Of je het model kunt verkrijgen en het op je eigen hardware kunt draaien, wat bepaalt of een van de grafische kaartcijfers op deze pagina van toepassing is.

Gewichten
Open — downloadable
Toegang tot model
Open weights (non-commercial)
Training code
Open source

CC-BY-NC-ND-4.0 for weights https://huggingface.co/ChatterjeeLab/PTM-Mamba Apache 2.0 for inference and training code https://github.com/programmablebio/ptm-mamba?tab=readme-ov-file

Hugging Face
ChatterjeeLab

Hoe het is geclassificeerd

Labels van de brondataset die worden toegepast bij het volgen van opmerkelijke modellen, en hoe zeker het is van de invoer.

Record vertrouwen
Likely
Citaties
45

Bronnen

Waar deze record vandaan kwam en wanneer deze voor het laatst is gecontroleerd.

Referentie
PTM-Mamba: A PTM-Aware Protein Language Model with Bidirectional Gated Mamba Blocks
Laatst bijgewerkt
1 January 2026

Wat de cijfers betekenen

Achtergrond

PTM-Mamba werd gepubliceerd door Duke University, in het land geregistreerd als United States of America, tijdens February 2024. De categorie waaronder de uitgever valt is academia.

Het werkt in het domein van Biology, en wordt geregistreerd als het uitvoeren van de taak van protein or nucleotide language model (pLM/nLM).

In plaats van vanaf nul te worden getraind, is het afgeleid van ESM2-650M. Dat is de gebruikelijke manier waarop een gespecialiseerd model wordt geproduceerd.

De gewichten zijn gepubliceerd, zodat ze gedownload en onbeperkt, offline, op je eigen hardware kunnen worden uitgevoerd, zonder dat er een account aan verbonden is. Op Hugging Face is het gepubliceerd onder de organisatie ChatterjeeLab.

Antwoorden

PTM-Mamba — veelgestelde vragen

01

PTM-Mamba— wanneer is het uitgebracht?

Het werd gepubliceerd in February 2024. De capaciteit per parameter is aanzienlijk verbeterd sinds, zodat een nieuwere model van dezelfde grootte vaak een betere benutting van dezelfde hardware is.

02

PTM-Mamba— waarvoor wordt het gebruikt?

Het werkt in het domein van Biology, en wordt geregistreerd als het afhandelen van protein or nucleotide language model (pLM/nLM). Dit zijn de gebieden waar het omheen is ontworpen; ze beschrijven intentie eerder dan een harde grens.

03

PTM-Mamba— waar kan ik het downloaden?

Zijn gewichten zijn gepubliceerd op Hugging Face, onder de organisatie ChatterjeeLab. Wij hosten geen modelbestanden - deze site berekent welke hardware nodig is om ze te draaien.

04

PTM-Mamba— Welke GPU heb ik nodig om het te draaien?

We kunnen niets zeggen. Het heeft open weights, maar er is geen parameter telling gepubliceerd voor het, en elke memory en snelheid berekening begint vanaf dat nummer. We tonen liever niets dan een gefabriceerde schatting.

05

PTM-Mamba— is het open-source?

De gewichten zijn gepubliceerd, zodat ze kunnen worden gedownload en op je eigen hardware kunnen worden uitgevoerd. Houd er rekening mee dat OPEN WEIGHTS niet hetzelfde is als open source in de volle zin — het zegt niets over de trainingsdata, de trainingscode of de commerciële voorwaarden die eraan zijn verbonden.

06

PTM-Mamba— hoeveel parameters heeft het?

Er is geen parameter telling gepubliceerd, daarom verschijnt er geen geheugen of snelheidsfiguur op deze pagina.

07

PTM-Mamba— wie heeft het gemaakt?

Het werd gepubliceerd door Duke University, gebaseerd op United States of America, een organisatie geclassificeerd als academia.

Bron

Originele publicatie

Laatste update geregistreerd 1 January 2026

De andere richting

Van de andere kant bekijken?

Deze pagina begint met het model. Als je al een kaart bezit en alles wilt weten wat het zal draaien, begin in plaats van de hardware.