LEP-AD

Gesloten gewichten King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute 3B parameters March 2023

Geen schatting

Geen hardware-eisen voor dit model

De gewichten voor dit model zijn niet gepubliceerd, dus het kan niet worden gedownload of uitgevoerd op je eigen hardware in welke grootte dan ook. Het is alleen bereikbaar via de aanbieder, en geen enkele grafische kaart verandert dat..

Op record

Volledige specificatie

Alles wat geregistreerd is voor dit model. Het merendeel beschrijft hoe het getraind werd in plaats van hoe het draait - nuttige context om te beoordelen hoeveel werk erin is gestoken, en hoe het zich verhoudt tot modellen die op een andere schaal zijn gebouwd..

Oorsprong

Wie heeft dit model gebouwd, waar, en wanneer het gepubliceerd werd.

Organisatie
King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute
Organisatietype
Academia,Academia
Land
Saudi Arabia, Sweden
Gepubliceerd
15 March 2023
Auteurs
Anuj Daga, Sumeer Ahmad Khan, David Gomez Cabrero, Robert Hoehndorf, Narsis A. Kiani, Jesper Tegner

Wat het doet

De probleemgebieden waarvoor het model is gebouwd. Een model kan meerdere van elk bevatten.

Domein
Biology
Taak
Proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction
Basis model
ESM2-3B
Numerieke indeling
FP16

Grootte

Hoe groot het model is en hoeveel data het is getraind. Parameters zijn het cijfer dat bepaalt of het past op een gegeven grafische kaart.

parameters
3B

Uses ESM-2 3B. Table 2 gives details on the non-ESM layers. The GCN appears to have about 3.31M parameters and the linear layers should have 771k and 3.3M, respectively. So total is ~3.007B

Training gegevens
1,244,420 tokens

Largest dataset appears to be STITCH, at 1244420 drug-target pairs.

Beschikbaarheid

Of je het model kunt verkrijgen en het op je eigen hardware kunt draaien, wat bepaalt of een van de grafische kaartcijfers op deze pagina van toepassing is.

Gewichten
Closed — provider access only
Toegang tot model
Unreleased
Training code
Open (non-commercial)

https://github.com/adaga06/LEP-AD unclear license

Hoe het is geclassificeerd

Labels van de brondataset die worden toegepast bij het volgen van opmerkelijke modellen, en hoe zeker het is van de invoer.

Waarom het wordt gevolgd
SOTA improvement

Tables 3-5 "We report new best-in-class state-of-the-art results compared to competing methods such as SimBoost, DeepCPI, Attention-DTA, GraphDTA, and more using multiple datasets, including Davis, KIBA, DTC, Metz, ToxCast, and STITCH. Finally, we find that a pre-trained model with embedding of proteins (the LED-AD) outperforms a model using an explicit alpha-fold 3D representation of proteins (e.g., LEP-AD supervised by Alphafold)"

Record vertrouwen
Confident
Citaties
1

Bronnen

Waar deze record vandaan kwam en wanneer deze voor het laatst is gecontroleerd.

Referentie
LEP-AD: Language Embedding of Proteins and Attention to Drugs predicts Drug Target Interactions
Laatst bijgewerkt
28 November 2025

Wat de cijfers betekenen

Wat dit model is

LEP-AD werd gepubliceerd door King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute, in het land geregistreerd als Saudi Arabia, tijdens March 2023. De publicerende organisatie is geclassificeerd als academia,Academia.

Het werkt in het domein van Biology, en wordt geregistreerd als het uitvoeren van de taak van proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction.

In plaats van vanaf nul te worden getraind, is het afgeleid van ESM2-3B. De meeste modellen op deze schaal zijn aangepast van een bestaande basis in plaats van vanuit het niets gebouwd.

Omdat de weights niet beschikbaar zijn, zijn geen van de hardwarefiguren elders op deze site van toepassing op het.

Wat erin ging zitten om het te bouwen

Training verbruikte een corpus van ongeveer 1,244,420 tekstokens

De reden dat het überhaupt in deze catalogus verschijnt: sOTA improvement.

Antwoorden

LEP-AD — veelgestelde vragen

01

LEP-AD— hoeveel parameters heeft het?

Het heeft een parameter telling van 3B. Uses ESM-2 3B. Table 2 gives details on the non-ESM layers. The GCN appears to have about 3.31M parameters and the linear layers should have 771k and 3.3M, respectively. So total is ~3.007B. Dat cijfer is het totaal, en het bepaalt hoeveel MEMORY het MODEL nodig heeft - ongeveer een halve gigabyte per miljard bij de compressie die de meeste mensen gebruiken.

02

LEP-AD— wie heeft het gemaakt?

Het werd gepubliceerd door King Abdullah University of Science and Technology (KAUST),Karolinska Institute, gebaseerd op Saudi Arabia, een organisatie geclassificeerd als academia,Academia.

03

LEP-AD— wanneer is het uitgebracht?

Het werd gepubliceerd in March 2023. De capaciteit per parameter is aanzienlijk verbeterd sinds, zodat een nieuwere model van dezelfde grootte vaak een betere benutting van dezelfde hardware is.

04

LEP-AD— waarvoor wordt het gebruikt?

Het werkt in het domein van Biology, en wordt geregistreerd als het afhandelen van proteins, Protein interaction prediction, Drug discovery, Protein-ligand binding affinity prediction. Een model kan er verschillende van elk dragen, dus dit zijn de gebieden waarvoor het is gebouwd in plaats van een limiet op wat het zal proberen.

05

LEP-AD— Welke GPU heb ik nodig om het te draaien?

Dit is een gesloten model — de gewichten zijn nooit gepubliceerd, dus het kan niet gedownload of uitgevoerd worden op je eigen hardware voor eender welke prijs. Het is alleen bereikbaar via de aanbieder.

06

LEP-AD— is het open-source?

Nee. De gewichten zijn niet gepubliceerd, dus het bestaat alleen als een dienst die wordt beheerd door de eigenaar.

Bron

Originele publicatie

Laatste update geregistreerd 28 November 2025

De andere richting

Van de andere kant bekijken?

Deze pagina begint met het model. Als je al een kaart bezit en alles wilt weten wat het zal draaien, begin in plaats van de hardware.