PepMLM TPS-rekenmachine

Open gewichten Duke University,Cornell University,McMaster University 3B parameters August 2024

Elke kaart hieronder wordt beoordeeld op basis van dit model met de contextlengte en minimale kwaliteit die je kiest. Snelheid is een schatting voor een enkele aanvraag, berekend op basis van de geheugendoorvoer van de kaart en de grootte van het model eenmaal gecomprimeerd..

Bereken voor dit model

818 kaarten die het kunnen draaien

818 kaarten die we hebben specificaties voor

Kleinste kaart die past

Tesla C1080

4 GB · Q6_K · 17.9 tok/s

Snelste kaart

B200

1,129 tok/s · 180 GB

Welke GPU's kunnen draaien PepMLM?

Stel de invoer in, lees het antwoord

Een langere conversatie heeft meer geheugen nodig, wat dit model van kleinere kaarten kan duwen..

Verbergt kaarten die alleen in het model passen door het onder dit punt te comprimeren.

818 kaarten passen

Berekenen
Heeft Kwantificatie Past
1,129 tok/s

678–1,807 · lage vertrouwen

B200 NVIDIA 180 GB 8,000 GB/s Jan 2024 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
1,129 tok/s

678–1,807 · lage vertrouwen

B300 NVIDIA 288 GB 8,000 GB/s Sep 2025 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
902 tok/s

541–1,443 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI350X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
902 tok/s

541–1,443 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI355X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
721 tok/s

433–1,154 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI300 AMD 128 GB 6,550 GB/s Jan 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
690 tok/s

414–1,105 · lage vertrouwen

H200 NVL NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
690 tok/s

414–1,105 · lage vertrouwen

H200 SXM 141 GB NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
661 tok/s

396–1,057 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI325X AMD 256 GB 6,000 GB/s Oct 2024 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
586 tok/s

352–938 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI300A AMD 128 GB 5,325 GB/s Dec 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
586 tok/s

352–938 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI300X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
586 tok/s

352–938 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI308X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
556 tok/s

334–890 · lage vertrouwen

H100 NVL 94 GB NVIDIA 94 GB 3,940 GB/s Mar 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
474 tok/s

285–759 · lage vertrouwen

H100 PCIe 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
474 tok/s

285–759 · lage vertrouwen

H100 SXM5 80 GB NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Oct 2022 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
474 tok/s

285–759 · lage vertrouwen

H100 SXM5 94 GB NVIDIA 94 GB 3,360 GB/s Mar 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
474 tok/s

285–759 · lage vertrouwen

H100 SXM5 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
474 tok/s

285–759 · lage vertrouwen

H800 SXM5 NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Mar 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
361 tok/s

217–578 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI250 AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
361 tok/s

217–578 · lage vertrouwen

Radeon Instinct MI250X AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
301 tok/s

181–482 · lage vertrouwen

Data Center GPU Max 1550 Intel 128 GB 3,280 GB/s Jan 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
295 tok/s

177–471 · lage vertrouwen

Data Center GPU Max Subsystem Intel 128 GB 3,210 GB/s Jan 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
288 tok/s

173–461 · lage vertrouwen

A100 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Nov 2020 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
288 tok/s

173–461 · lage vertrouwen

A100X NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Jun 2021 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
288 tok/s

173–461 · lage vertrouwen

A800 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Aug 2022 3.9 GB Q8_0 Comfortabel
288 tok/s

173–461 · lage vertrouwen

H100 CNX NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Mar 2023 3.9 GB Q8_0 Comfortabel

Snelheden zijn schattingen voor een enkele aanvraag — één gesprek tegelijk — berekend vanuit geheugendebandbreedte, modelgrootte en kwantisatie. De werkelijke doorvoer varieert met de inferentietijd en de versie ervan. Cijfers gepubliceerd door hardwareleveranciers meten veel gelijktijdige aanvragen en zijn veel hoger.

Op record

Volledige specificatie

Alles wat geregistreerd is voor dit model. Het merendeel beschrijft hoe het getraind werd in plaats van hoe het draait - nuttige context om te beoordelen hoeveel werk erin is gestoken, en hoe het zich verhoudt tot modellen die op een andere schaal zijn gebouwd..

Oorsprong

Wie heeft dit model gebouwd, waar, en wanneer het gepubliceerd werd.

Organisatie
Duke University,Cornell University,McMaster University
Organisatietype
Academia,Academia,Academia
Land
United States of America, Canada
Gepubliceerd
11 August 2024
Auteurs
Tianlai Chen, Madeleine Dumas, Rio Watson, Sophia Vincoff, Christina Peng, Lin Zhao, Lauren Hong, Sarah Pertsemlidis, Mayumi Shaepers-Cheu, Tian Zi Wang, Divya Srijay, Connor Monticello, Pranay Vure, Rishab Pulugurta, Kseniia Kholina, Shrey Goel, Matthew P DeLisa, Ray Truant, Hector C Aguilar, Pranam Chatterjee

Wat het doet

De probleemgebieden waarvoor het model is gebouwd. Een model kan meerdere van elk bevatten.

Domein
Biology
Taak
Protein generation

Grootte

Hoe groot het model is en hoeveel data het is getraind. Parameters zijn het cijfer dat bepaalt of het past op een gegeven grafische kaart.

parameters
3B

To assess the performance of larger models, we note that we additionally fine-tuned ESM-2-3B for peptide generation (PepMLM-3B)

Training gegevens
tokens

We subjected our curated dataset to a filtration process based on the lengths of the binder and target protein sequences, which were confined to 50 and 500 respectively. To remove redundancies, we applied a homology filter thresholded at 80%, resulting in a final training set of 10,000 samples and leaving 203 samples for testing.

Beschikbaarheid

Of je het model kunt verkrijgen en het op je eigen hardware kunt draaien, wat bepaalt of een van de grafische kaartcijfers op deze pagina van toepassing is.

Gewichten
Open — downloadable
Toegang tot model
Open weights (non-commercial)
Training code
Unreleased

All data needed to evaluate the conclusions in the paper are present in the paper and code repository: https://github.com/programmablebio/pepmlm. PepMLM-650M is also hosted on HuggingFace for academic use only, with an easy-to-use demo for peptide generation: https://huggingface.co/ChatterjeeLab/PepMLM-650M. All raw and processed data (including raw immunoblots) have been deposited to the Zenodo repository: https://doi.org/10.5281/zenodo.11201091 License: CC BY-NC-SA 4.0

Hugging Face
ChatterjeeLab

Hoe het is geclassificeerd

Labels van de brondataset die worden toegepast bij het volgen van opmerkelijke modellen, en hoe zeker het is van de invoer.

Record vertrouwen
Confident

Bronnen

Waar deze record vandaan kwam en wanneer deze voor het laatst is gecontroleerd.

Referentie
PepMLM: Target Sequence-Conditioned Generation of Therapeutic Peptide Binders via Span Masked Language Modelin
Laatst bijgewerkt
28 November 2025

De extremen

Wat de cijfers betekenen

Wat nodig is om dit model te draaien

Minimum kaart

Tesla C1080

Geheugen nodig

3.2 GB

Snelste

1,129 tok/s

PepMLM bereikt een parameter telling van 3B. Dat is klein genoeg zodat hardware zelden de obstakel is, inclusief op kaarten van enkele jaren oud. Het aantal kaarten dat we volgen die het kunnen draaien: 818.

De kleinste kaart die het vasthoudt is Tesla C1080, met een geheugen capaciteit van 4 GB, het draaien ervan met een compressie van Q6_K en produceren rond 17.9 tokens per seconde

De snelste we er voor berekenen is B200, genereren ongeveer 1,129 tokens per seconde op basis van een geheugendoorbandsnelheid van 8,000 GB/s.

Wat dit model is

PepMLM werd gepubliceerd door Duke University,Cornell University,McMaster University, in het land geregistreerd als United States of America, tijdens August 2024. De categorie waaronder de uitgever valt is academia,Academia,Academia.

Het werkt in het domein van Biology, en wordt geregistreerd als het uitvoeren van de taak van protein generation.

Het feit dat de gewichten open zijn, is wat deze pagina in de calculator plaatst in plaats van alleen in de catalogus: het is een model dat je daadwerkelijk kunt vasthouden. Op Hugging Face is het gepubliceerd onder de organisatie ChatterjeeLab.

Wat bepaalt de snelheid

De helft van de kaarten die het vasthouden, beheren meer dan 35.8 tokens per second. Outright de leessnelheid overschrijden. 780 van hen

Het is een dicht model, dus elke parameter wordt gelezen voor elk token dat wordt geproduceerd. Dat maakt de snelheid bijna precies het geheugenbandbreedte bijhouden — een kaart met twee keer de bandbreedte genereert ongeveer twee keer zo snel.

De interne architectuur is niet gedocumenteerd, dus het geheugen wordt geschat op basis van het aantal parameters en dienovereenkomstig gemarkeerd. Verwacht dat de werkelijke waarde verschilt, vooral bij lange context.

Stap voor stap

Hoe een GPU te kiezen voor PepMLM

De tabel hierboven heeft elke kaart die we specificaties voor hebben al vergeleken met dit model. Het bereiken van uw antwoord kost zes stappen..

  1. 01

    Begin vanuit de geheugen kolom

    De tabel vermeldt elke kaart die in staat is om te bevatten. PepMLM, ongeveer nodig 3.2 GB bij een compressie van Q6_K. De capaciteit is de poort — een GPU-kaart houdt het of het houdt het niet.

  2. 02

    Stem de context af op uw werkelijke gebruik

    Het gesprek verbruikt ook geheugen en groeit naarmate het vordert. Stel de schuifregelaar in op de lengte die je verwacht, want bij lange CONTEXT kan een KAART die korte vragen gemakkelijk afhandelt, verworpen worden door PepMLM.

  3. 03

    Kies hoe ver je het wilt comprimeren

    Elke kaart draait de minst-gecomprimeerde kopie die hij kan vasthouden., bereiken van een compressie van Q6_K op de kleinste kaart die past. Het instellen van een minimumkwaliteit laat de kaarten vallen die het alleen maar beheersen door verder te persen dan je zou willen, en houdt de vergelijking op één niveau.

  4. 04

    Sorteer op snelheid

    Sorteren op snelheid om te zien hoe de kaarten gerangschikt zijn voor PepMLM. Het zal niet passen bij een gaming bestelling, omdat generatie gebonden is aan geheugenbandbreedte. De kaart bovenaan de lijst is B200, bij 1,129 tok/s

  5. 05

    Kijk naar de speling, niet alleen naar de pasvorm.

    Een strakke pasvorm draait, maar laat niets over voor een langer gesprek, in het geval van PepMLM. Comfortabel betekent dat je de context later kunt vergroten. Dat verschil is belangrijker dan een paar tokens per seconde, dus koop voor comfortabel als je dat verwacht.

  6. 06

    Controleer de kaart vanaf de andere kant

    Elke kaartpagina herhaalt deze scan voor elk model dat we hebben, en beantwoordt waarvoor de hardware verder goed is naast PepMLM.

Antwoorden

PepMLM — veelgestelde vragen

01

PepMLM— hoeveel parameters heeft het?

Het heeft een parameter telling van 3B. To assess the performance of larger models, we note that we additionally fine-tuned ESM-2-3B for peptide generation (PepMLM-3B). Dat cijfer is het totaal, en het bepaalt hoeveel MEMORY het MODEL nodig heeft - ongeveer een halve gigabyte per miljard bij de compressie die de meeste mensen gebruiken.

02

PepMLM— wie heeft het gemaakt?

Het werd gepubliceerd door Duke University,Cornell University,McMaster University, gebaseerd op United States of America, een organisatie geclassificeerd als academia,Academia,Academia.

03

PepMLM— wanneer is het uitgebracht?

Het werd gepubliceerd in August 2024. De capaciteit per parameter is aanzienlijk verbeterd sinds, zodat een nieuwere model van dezelfde grootte vaak een betere benutting van dezelfde hardware is.

04

PepMLM— waarvoor wordt het gebruikt?

Het werkt in het domein van Biology, en wordt geregistreerd als het afhandelen van protein generation. Een model kan er verschillende van elk dragen, dus dit zijn de gebieden waarvoor het is gebouwd in plaats van een limiet op wat het zal proberen.

05

PepMLM— waar kan ik het downloaden?

Zijn gewichten zijn gepubliceerd op Hugging Face, onder de organisatie ChatterjeeLab. Wij hosten geen modelbestanden - deze site berekent welke hardware nodig is om ze te draaien.

06

PepMLM— kan ik het draaien als het niet in mijn GPU past?

Alleen door af te laden, wat meestal een valse economie is: het deel dat in systeemgeheugen wordt vastgehouden, houdt het hele ding tegen. Elke figuur hier gaat ervan uit dat het hele model op de kaart staat.

07

PepMLM— Zouden twee GPU's het sneller draaien?

Capaciteit voegt samen over kaarten; doorvoer niet. Het aantal kaarten dat het al op zichzelf vasthoudt: 818. Dus een tweede card is zelden het antwoord hier.

08

PepMLM— waarom verschilt de quantisatie tussen kaarten?

Elke kaart wordt weergegeven met de minst-gecomprimeerde kopie die hij kan bevatten. Het aantal verschillende compressieniveaus op de kaarten die het kunnen houden: 2. Grotere CARDS krijgen de meer nauwkeurige versie, en de kwaliteitsvloer boven pins beperkt de vergelijking tot één niveau.

09

PepMLM— hoe nauwkeurig zijn deze snelheidsschattingen?

Ze worden berekend uit specificaties in plaats van gemeten, en elk heeft een bereik. Een voorbeeld: 678–1,807 tok/s op B200. Hetzelfde model en kaart variëren met dertig tot vijftig procent, afhankelijk van de inferentiesoftware en de versie ervan.

10

PepMLM— Welke GPU heb ik nodig om het te draaien?

De kleinste kaart in onze catalogus die het vasthoudt is Tesla C1080, met een geheugen capaciteit van 4 GB. Het draait het model op een compressie van Q6_K ongeveer 3.2 GB, en produceert ongeveer 17.9 tokens per second. Het aantal kaarten dat het totaal kan draaien: 818.

11

PepMLM— hoe snel is het op een GPU?

Het hangt af van de kaart. De snelste die we berekenen is B200, ongeveer 1,129 tokens per seconde; de langzaamste die het nog steeds draait haalt aanzienlijk minder. De leessnelheid is rond de tien tokens per seconde, en het aantal kaarten dat dat haalt: 780.

12

PepMLM— hoeveel VRAM heeft het nodig?

Het heeft ongeveer 3.2 GB bij een compressie van Q6_K, welke is wat de kleinste card die het draait gebruikt. Minder compressie heeft meer nodig: de cijfers in de memory-kolom hierboven worden opnieuw berekend voor elke card, omdat elke card de minst gecomprimeerde versie kan vasthouden.

13

PepMLM— kan ik het draaien op een GPU met 8 GB?

Ja. De GPU kaart CMP 170HX 8 GB, houden 8 GB, draait het met een compressie van Q8_0, ongeveer 3.9 GB en genereren ongeveer 210 tokens per second. De fit is comfortabel.

14

PepMLM— kan ik het draaien op een GPU met 12 GB?

Ja. De GPU kaart GeForce RTX 3080 Ti, houden 12 GB, draait het met een compressie van Q8_0, ongeveer 3.9 GB en genereren ongeveer 129 tokens per second. De fit is comfortabel.

15

PepMLM— kan ik het draaien op een GPU met 16 GB?

Ja. De GPU kaart Tesla V100 SXM2 16 GB, houden 16 GB, draait het met een compressie van Q8_0, ongeveer 3.9 GB en genereren ongeveer 160 tokens per second. De fit is comfortabel.

16

PepMLM— kan ik het draaien op een GPU met 24 GB?

Ja. De GPU kaart GeForce RTX 5090 D V2, houden 24 GB, draait het met een compressie van Q8_0, ongeveer 3.9 GB en genereren ongeveer 189 tokens per second. De fit is comfortabel.

17

PepMLM— is het open-source?

De gewichten zijn gepubliceerd, zodat ze kunnen worden gedownload en op je eigen hardware kunnen worden uitgevoerd. Houd er rekening mee dat OPEN WEIGHTS niet hetzelfde is als open source in de volle zin — het zegt niets over de trainingsdata, de trainingscode of de commerciële voorwaarden die eraan zijn verbonden.

Bron

Originele publicatie

Laatste update geregistreerd 28 November 2025

De andere richting

Van de andere kant bekijken?

Deze pagina begint met het model. Als je al een kaart bezit en alles wilt weten wat het zal draaien, begin in plaats van de hardware.