BERT-RBP TPS kalkulátor
Každá karta níže je hodnocena podle tohoto modelu na základě délky kontextu a minimální kvality, kterou si zvolíte. Rychlost je odhad pro jednotlivý požadavek, vypočítaná z paměťové šířky karty a velikosti modelu po kompresi..
Vypočteno pro tento model
818 karty, které máme specifikace pro
Nejmenší karta, která se vejde
Tesla C1080
4 GB · Q8_0 · 335 tok/s
Nejrychlejší karta
B200
30,802 tok/s · 180 GB
Které GPU mohou spustit BERT-RBP?
Nastavte vstupy, přečtěte si odpověď
Delší konverzace potřebuje více paměti, což může tento model vytlačit z menších karet..
Skrývá karty, které by se do modelu vešly pouze jeho stlačením pod tento bod.
818 karty odpovídají
Vypočítávání| Potřebuje | Kvantisace | Pohodlné | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
30,802
tok/s
18,481–49,283 · nízká důvěra |
B200 NVIDIA | 180 GB | 8,000 GB/s | Jan 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
30,802
tok/s
18,481–49,283 · nízká důvěra |
B300 NVIDIA | 288 GB | 8,000 GB/s | Sep 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
24,596
tok/s
14,758–39,354 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI350X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
24,596
tok/s
14,758–39,354 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI355X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
19,671
tok/s
11,803–31,474 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI300 AMD | 128 GB | 6,550 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
18,828
tok/s
11,297–30,124 · nízká důvěra |
H200 NVL NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
18,828
tok/s
11,297–30,124 · nízká důvěra |
H200 SXM 141 GB NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
18,019
tok/s
10,812–28,831 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI325X AMD | 256 GB | 6,000 GB/s | Oct 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI300A AMD | 128 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI300X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI308X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
15,170
tok/s
9,102–24,272 · nízká důvěra |
H100 NVL 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,940 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · nízká důvěra |
H100 PCIe 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · nízká důvěra |
H100 SXM5 80 GB NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Oct 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · nízká důvěra |
H100 SXM5 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · nízká důvěra |
H100 SXM5 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · nízká důvěra |
H800 SXM5 NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
9,851
tok/s
5,910–15,761 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI250 AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
9,851
tok/s
5,910–15,761 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI250X AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
8,209
tok/s
4,925–13,134 · nízká důvěra |
Data Center GPU Max 1550 Intel | 128 GB | 3,280 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
8,034
tok/s
4,820–12,854 · nízká důvěra |
Data Center GPU Max Subsystem Intel | 128 GB | 3,210 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · nízká důvěra |
A100 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Nov 2020 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · nízká důvěra |
A100X NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Jun 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · nízká důvěra |
A800 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Aug 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · nízká důvěra |
H100 CNX NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Pohodlný |
Rychlosti jsou odhady pro jednoho žadatele — jednu konverzaci najednou — vypočítané z šířky pásma paměti, velikosti modelu a kvantizace. Skutečný průchod se liší s výkonem inference a jeho verzí. Čísla zveřejněná výrobci hardwaru měří mnoho simultánních požadavků a jsou mnohem vyšší..
Na záznamu
Plná specifikace
Všechno o tomto modelu v záznamech. Většina z toho popisuje, jak byl trénován, spíše než jak funguje — užitečný kontext pro posouzení, kolik práce do něj bylo vynaloženo, a jak se srovnává s modely postavenými na jiné úrovni..
Původ
Kdo vytvořil tento model, kde a kdy byl publikován.
- Organizace
- Waseda University
- Typ organizace
- Academia
- Země
- Japan
- Publikováno
- 7 April 2022
- Autoři
- Keisuke Yamada, Michiaki Hamada
Co to dělá
Problémové oblasti, pro které byl model vytvořen. Model může obsahovat několik z každého.
- Doména
- Biology
- Úkol
- Proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction
- Základní model
- DNABERT
Velikost
Jak velký je model a kolik dat byl trénován. Parametry jsou číslo, které rozhoduje, zda se vejde na danou grafickou kartu.
- parametry
- 110M
- Výcviková data
- tokens
- Epochy
- 3
Base model is BERT base (110M parameters), pre-trained on human reference genome (DNABert: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/15/2112/6128680)
RBPs: 154 Sequences per RBP: 15,000 Total sequences = 154 × 15,000 = 2,310,000 Tokens per sequence = 34 Total tokens = 2,310,000 × 34 = 78,540,000 Final estimate: 7.8 × 10⁷ tokens
Výpočty pro trénink
Aritmetika prováděná k trénování modelu, měřená v operacích s plovoucí desetinnou čárkou. Je to měřítko toho, kolik stál tréninkový běh, ne jak rychle hotový model na vás odpovídá.
- Výpočty pro trénink
- 1.4 × 10²⁰ FLOP
- Jak bylo ustanoveno
- Hardware
- Ladění výpočtů
- 2.2 × 10¹⁶ FLOP
See DNABert entry: "Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)" Assuming FP16 and 30% utilization Calculation = (25 * 24 *3600) s * 2.7e13 FLOP/s per GPU * 8 GPUs * 0.3 utilization = 1.4e20 FLOP
"The models were trained on four NVIDIA Tesla V100 GPUs (128 GB memory). The training of one RBP model using 19 200 samples took <10 min." Calculation assuming FP16 and 30% utlization and NVIDIA Tesla V100 SMX2 model: 10 min * 60 sec/min * 3.1e13 FLOP/s * 4 GPU * 0.3 utilization = 2.2e16
Dostupnost
Zda můžete získat model a spustit ho na svém vlastním hardwaru, což rozhoduje o tom, zda se některé z čísel grafických karet na této stránce vztahují.
- Hmotnosti
- Open — downloadable
- Přístup k modelu
- Open weights (non-commercial)
- Tréninkový kód
- Open (non-commercial)
No clear license: https://github.com/kkyamada/bert-rbp train script: https://github.com/kkyamada/bert-rbp/blob/master/examples/run_finetune.py data also doesn't have a clear license: http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/RBPsuite/dataset_new.html
Jak je to klasifikováno
Štítky aplikačních datových sad, které se používají při sledování významných modelů, a jak jistý je ve záznamu.
- Proč je to sledováno
- SOTA improvement
- Záznam důvěry
- Confident
- Citace
- 68
"Our model outperformed state-of-the-art prediction models using the eCLIP-seq data of 154 RBPs" [Abstract] - SOTA improvement on a very specific task "Using the eCLIP-seq data of 154 different RBPs, our model outperformed state-of-the-art methods and the baseline BERT model."
Žrovy
Odkud tento záznam pochází a kdy byl naposledy zkontrolován.
- Reference
- Prediction of RNA–protein interactions using a nucleotide language model
- Nap poslední aktualizace
- 1 January 2026
Extrémy
Deset nejrychlejších GPU, které běží BERT-RBP
Seřazeno podle odhadovaných tokenů za sekundu, nejnovější karta první, kde se rychlosti shodují. Protože generování je omezeno šířkou pásma paměti, toto řazení následuje šířku pásma spíše než jakýkoli herní benchmark..
- 01 B300 288 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 30,802 tok/s
- 02 B200 180 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 30,802 tok/s
- 03 Radeon Instinct MI350X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 24,596 tok/s
- 04 Radeon Instinct MI355X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 24,596 tok/s
- 05 Radeon Instinct MI300 128 GB · 6,550 GB/s · Q8_0 19,671 tok/s
- 06 H200 NVL 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 18,828 tok/s
- 07 H200 SXM 141 GB 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 18,828 tok/s
- 08 Radeon Instinct MI325X 256 GB · 6,000 GB/s · Q8_0 18,019 tok/s
- 09 Radeon Instinct MI300A 128 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 15,992 tok/s
- 10 Radeon Instinct MI300X 192 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 15,992 tok/s
Nejmenší GPU, které ještě běží BERT-RBP
Nejlevnější cesta dovnitř, podle kapacity paměti. Těsný fit spustí model, ale nenechá nic navíc na delší konverzaci..
- 01 GeForce RTX 4010 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 370 tok/s
- 02 RTX A400 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 370 tok/s
- 03 RTX 500 Mobile Ada Generation 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 493 tok/s
- 04 GeForce RTX 3050 A Mobile 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 739 tok/s
- 05 Jetson Orin Nano 4 GB 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 131 tok/s
- 06 Radeon RX 6450M 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 384 tok/s
- 07 Radeon RX 6550M 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 432 tok/s
- 08 Radeon RX 6550S 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 384 tok/s
- 09 Arc A310 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 310 tok/s
- 10 Arc Pro A30M 4 GB · Potřebuje 0.8 GB · Q8_0 · Pohodlný 320 tok/s
Co čísla znamenají
Hardwareová stránka
Minimum karta
Tesla C1080
Potřeba paměti
0.8 GB
Nejrychlejší
30,802 tok/s
BERT-RBP dosahuje počtu parametrů 110M. To je dost malé, že hardware je zřídkakdy překážkou, včetně karet starých několik let. Počet karet, které sledujeme, které to mohou spustit: 818.
Na nízkém konci se to řeší pomocí Tesla C1080, s kapacitou VRAM 4 GB, spuštění na kompresi Q8_0 a vyrábějí kolem 335 tokenů za sekundu
Nejrychlejší výsledek pochází z B200, generování přibližně 30,802 tokens za sekundu na základě šířky pásma VRAM 8,000 GB/s.
Co je tento MODEL
BERT-RBP byl zveřejněn Waseda University, v zemi zaznamenané jako Japan, během April 2022. Vychází z organizace, která je kategorizována jako academia.
funguje v oblasti Biology, a je zaznamenán jako vykonávající úkol proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction.
Jeho výchozím bodem byl existující základní model, DNABERT. Většina modelů na této úrovni je přizpůsobena z existující základny namísto toho, aby byla vytvořena od nuly.
Otevřené váhy jsou to, co dává této stránce místo v kalkulátoru spíše než pouze v katalogu: je to model, který můžeš skutečně držet.
Co rozhoduje o rychlosti
Polovina karet, které to drží, zvládne více než 864.9 tokenů za sekundu. Producing text faster than most people read it: 818 z nich
Je to hustý model, takže každý parametr je čten pro každý token vyprodukovaný. To dělá rychlost téměř přesně sledovat paměťovou šířku pásma — karta s dvojnásobnou šířkou pásma generuje přibližně dvojnásobně rychle.
Paměť zde je odhadována podle velikosti, spíše než aby byla vypočtena z architektury, která není pro tento model zaznamenána — čísla jsou spíše indikativní než přesná.
Co bylo zapotřebí k jeho vybudování
Produkce toho vyžadovala aritmetiku v celkové výši přibližně 1.4 × 10²⁰ FLOP. Tato částka měří, kolik stál výroba modelu, a nemá žádný vliv na to, jak rychle odpovídá.
Je sledováno v základním datasetu z jednoho konkrétního důvodu: sOTA improvement.
Krok za krokem
Jak vybrat GPU pro BERT-RBP
Stůl výše již posoudil každou kartu, pro kterou máme specifikace, proti tomuto modelu. Dostání se k vaší odpovědi trvá šest kroků.
-
01
Přečtěte si nejprve číslo paměti
Každá KARTA zde byla zkontrolována proti BERT-RBP, potřebující kolem 0.8 GB při kompresi Q8_0. Žádné množství výpočetního výkonu nenahradí kartu, která to nemůže udržet.
-
02
Rozhodněte, jak dlouho vaše konverzace běží
Konverzace také zabírá MEMORY a roste, jak pokračuje. Nastavte posuvník na délku, kterou očekáváte, protože při dlouhém CONTEXT může být KARTA, která snadno zvládá krátké dotazy, odmítnuta. BERT-RBP.
-
03
Rozhodněte, jaké množství komprese přijmete
Kompresce je to, co umožňuje modelu pojmout menší KARTY, za určitou cenu v přesnosti., dosahující komprese Q8_0 na nejmenší kartě, která se vejde. Nastavení minimální kvality odstraňuje karty, které pouze splňují tuto kvalitu tím, že ji dále stlačují více, než byste chtěli, a udržuje srovnání na jedné úrovni.
-
04
Třídit podle rychlosti
Rychlostní řazení je v podstatě řazením podle šířky pásma paměti, pro BERT-RBP. Nebude to odpovídat hernímu pořádku, protože generace je omezena šířkou pásma paměti. Grafická karta, která vede seznam, je B200, na 30,802 tok/s
-
05
Přečtěte si poslední sloupec fit
Sloupec vhodnosti odděluje karty, které to jen tak tak zvládají, od těch, které mají místo navíc, v případě BERT-RBP. Pohodlný znamená, že můžete později zvětšit kontext. Ten rozdíl má větší význam než pár tokenů za sekundu, takže kupte pro pohodlné, pokud to očekáváte.
-
06
Podívejte se, co dalšího ta karta spouští
Každá stránka karty opakuje tento postup pro každý model, který máme, a odpovídá na to, k čemu je hardware dobrý kromě BERT-RBP.
Odpovědi
BERT-RBP — běžné otázky
BERT-RBP— mohu to spustit na GPU držící 24 GB?
Ano. GPU kartu GeForce RTX 5090 D V2, držení 24 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.8 GB a generováním zhruba 5,159 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
BERT-RBP— Je to OPEN SOURCE?
Jeho váhy jsou zveřejněny, takže si je lze stáhnout a spustit na vlastním hardwaru. Všimněte si, že open WEIGHTS není totéž co open SOURCE v plném smyslu — neříká nic o tréninkových datech, tréninkovém kódu nebo obchodních podmínkách připojených.
BERT-RBP— kolik má parametrů?
Má počet parametrů 110M. Base model is BERT base (110M parameters), pre-trained on human reference genome (DNABert: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/15/2112/6128680). Tato cifra je celková a rozhoduje o tom, kolik VRAM model potřebuje — přibližně půl gigabajtu na miliardu při kompresi, kterou většina lidí používá.
BERT-RBP— Kdo to vytvořil?
Bylo to publikováno společností Waseda University, zakládající se na Japan, organizace zařazená jako academia.
BERT-RBP— Kdy byl vydán?
Bylo to zveřejněno v April 2022. Schopnost na parametr se od té doby výrazně zlepšila, takže novější model stejné velikosti je často lepším využitím stejného hardwaru.
BERT-RBP— K čemu se to používá?
funguje v oblasti Biology, a je zaznamenáno jako zpracovávající úkol proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction. Model může nést několik z každého, takže to jsou oblasti, pro které byl navržen, spíše než omezení toho, co se pokusí.
BERT-RBP— kde si to mohu stáhnout?
Váhy jsou zveřejněny, i když nemáme odkaz na repozitář. Tato stránka vypočítává hardwarové požadavky spíše než aby hostila modelové soubory.
BERT-RBP— kolik výpočetního výkonu bylo použito k jeho trénování?
Trénink spotřeboval kolem 1.4 × 10²⁰ FLOP. To měří, co stálo výrobu modelu, a neříká nic o tom, jak rychle odpovídá po natrénování — rychlost inferencí závisí na šířce pásma paměti, nikoli na rozpočtu na trénink.
BERT-RBP— Mohu to spustit, pokud se to nevejde do mé GPU?
Pouze přenosem, což je obvykle falešná ekonomika: část držená v paměti systému zpomaluje celé to. Každá postava zde předpokládá, že celý model je umístěn na kartě.
BERT-RBP— Běhalo by to rychleji na dvou GPU?
Druhá karta přibližně zdvojnásobí dostupnou paměť, ale ne rychlost generování. Počet, který je již schopen ji spustit sám: 818. Takže druhá karta je tu zřídka odpovědí.
BERT-RBP— proč se kvantizace liší mezi kartami?
Větší karta obsahuje přesnější kopii. Počet úrovní komprese používaných na kartách, které ji provádějí: 1. Větší karty získávají přesnější verzi a kvalita podlahy nad piny srovnává na jednu úroveň.
BERT-RBP— Jak přesné jsou tyto odhady rychlosti?
Jsou vypočítány ze specifikací spíše než měřeny a každá má určité rozmezí. Jeden příklad: 18,481–49,283 tok/s na B200. Stejný model a karta se liší o třicet až padesát procent v závislosti na softwaru pro inferenci a jeho verzi.
BERT-RBP— Jakou GPU potřebuji k jejímu spuštění?
Nejmenší karta v našem katalogu, která to udrží, je Tesla C1080, s kapacitou VRAM 4 GB. Spouští model při kompresi Q8_0 používající přibližně 0.8 GB, a produkuje přibližně 335 tokeny za sekundu. Celkový počet karet, které mohou model běžet: 818.
BERT-RBP— jak rychle je to na GPU?
Záleží na kartě. Nejrychleji, jak to spočítáme, je B200, přibližně 30,802 tokenů za sekundu; nejpomalejší, který stále běží, zvládá výrazně méně. Rychlost čtení je kolem deseti tokenů za sekundu, a počet karet, které to zvládají: 818.
BERT-RBP— kolik VRAM potřebuje?
Potřebuje asi 0.8 GB při kompresi Q8_0, která je ta nejmenší karta, která to používá. Méně komprese vyžaduje více: čísla ve sloupci paměti výše jsou přepočítána pro každou kartu, protože každá drží nejméně komprimovanou verzi, kterou může.
BERT-RBP— mohu to spustit na GPU držící 8 GB?
Ano. GPU kartu CMP 170HX 8 GB, držení 8 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.8 GB a generováním zhruba 5,737 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
BERT-RBP— mohu to spustit na GPU držící 12 GB?
Ano. GPU kartu GeForce RTX 3080 Ti, držení 12 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.8 GB a generováním zhruba 3,513 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
BERT-RBP— mohu to spustit na GPU držící 16 GB?
Ano. GPU kartu Tesla V100 SXM2 16 GB, držení 16 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.8 GB a generováním zhruba 4,351 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
Druhý směr
Díváte se na to z druhé strany?
Tato stránka začíná od modelu. Pokud již vlastníte kartu a chcete vědět všechno, co bude spuštěno, začněte raději od hardwaru.