ProteinBERT TPS kalkulátor

Otevřít váhy Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading 16M parametry February 2022

Každá karta níže je hodnocena podle tohoto modelu na základě délky kontextu a minimální kvality, kterou si zvolíte. Rychlost je odhad pro jednotlivý požadavek, vypočítaná z paměťové šířky karty a velikosti modelu po kompresi..

Vypočteno pro tento model

818 karty, které to mohou spustit

818 karty, které máme specifikace pro

Nejmenší karta, která se vejde

Tesla C1080

4 GB · Q8_0 · 2,304 tok/s

Nejrychlejší karta

B200

211,765 tok/s · 180 GB

Které GPU mohou spustit ProteinBERT?

Nastavte vstupy, přečtěte si odpověď

Delší konverzace potřebuje více paměti, což může tento model vytlačit z menších karet..

Skrývá karty, které by se do modelu vešly pouze jeho stlačením pod tento bod.

818 karty odpovídají

Vypočítávání
Potřebuje Kvantisace Pohodlné
211,765 tok/s

127,059–338,824 · nízká důvěra

B200 NVIDIA 180 GB 8,000 GB/s Jan 2024 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
211,765 tok/s

127,059–338,824 · nízká důvěra

B300 NVIDIA 288 GB 8,000 GB/s Sep 2025 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
169,099 tok/s

101,460–270,559 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI350X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
169,099 tok/s

101,460–270,559 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI355X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
135,238 tok/s

81,143–216,381 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI300 AMD 128 GB 6,550 GB/s Jan 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
129,441 tok/s

77,665–207,106 · nízká důvěra

H200 NVL NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
129,441 tok/s

77,665–207,106 · nízká důvěra

H200 SXM 141 GB NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
123,882 tok/s

74,329–198,212 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI325X AMD 256 GB 6,000 GB/s Oct 2024 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
109,946 tok/s

65,967–175,913 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI300A AMD 128 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
109,946 tok/s

65,967–175,913 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI300X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
109,946 tok/s

65,967–175,913 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI308X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
104,294 tok/s

62,576–166,871 · nízká důvěra

H100 NVL 94 GB NVIDIA 94 GB 3,940 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
88,941 tok/s

53,365–142,306 · nízká důvěra

H100 PCIe 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
88,941 tok/s

53,365–142,306 · nízká důvěra

H100 SXM5 80 GB NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Oct 2022 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
88,941 tok/s

53,365–142,306 · nízká důvěra

H100 SXM5 94 GB NVIDIA 94 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
88,941 tok/s

53,365–142,306 · nízká důvěra

H100 SXM5 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
88,941 tok/s

53,365–142,306 · nízká důvěra

H800 SXM5 NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
67,722 tok/s

40,633–108,356 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI250 AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
67,722 tok/s

40,633–108,356 · nízká důvěra

Radeon Instinct MI250X AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
56,435 tok/s

33,861–90,296 · nízká důvěra

Data Center GPU Max 1550 Intel 128 GB 3,280 GB/s Jan 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
55,231 tok/s

33,139–88,369 · nízká důvěra

Data Center GPU Max Subsystem Intel 128 GB 3,210 GB/s Jan 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
54,000 tok/s

32,400–86,400 · nízká důvěra

A100 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Nov 2020 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
54,000 tok/s

32,400–86,400 · nízká důvěra

A100X NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Jun 2021 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
54,000 tok/s

32,400–86,400 · nízká důvěra

A800 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Aug 2022 0.7 GB Q8_0 Pohodlný
54,000 tok/s

32,400–86,400 · nízká důvěra

H100 CNX NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Mar 2023 0.7 GB Q8_0 Pohodlný

Rychlosti jsou odhady pro jednoho žadatele — jednu konverzaci najednou — vypočítané z šířky pásma paměti, velikosti modelu a kvantizace. Skutečný průchod se liší s výkonem inference a jeho verzí. Čísla zveřejněná výrobci hardwaru měří mnoho simultánních požadavků a jsou mnohem vyšší..

Na záznamu

Plná specifikace

Všechno o tomto modelu v záznamech. Většina z toho popisuje, jak byl trénován, spíše než jak funguje — užitečný kontext pro posouzení, kolik práce do něj bylo vynaloženo, a jak se srovnává s modely postavenými na jiné úrovni..

Původ

Kdo vytvořil tento model, kde a kdy byl publikován.

Organizace
Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading
Typ organizace
Academia,Academia,Industry
Země
Israel, United States of America
Publikováno
10 February 2022
Autoři
Nadav Brandes, Dan Ofer, Yam Peleg, Nadav Rappoport, Michal Linial

Co to dělá

Problémové oblasti, pro které byl model vytvořen. Model může obsahovat několik z každého.

Doména
Biology
Úkol
Proteins, Protein generation, Protein representation learning
Přístup
Self-supervised learning

Velikost

Jak velký je model a kolik dat byl trénován. Parametry jsou číslo, které rozhoduje, zda se vejde na danou grafickou kartu.

parametry
16M

"Altogether, it includes ∼16M trainable parameters, making it substantially smaller than other protein language models"

Výcviková data
37,598,200,000 tokens

Number of proteins: 106,000,000 Average protein length: 300 amino acids Total unique tokens = 106,000,000 × 300 = 31,800,000,000 ≈ 3.2e10 tokens

Epochy
6.4
Velikost dávky
26,008

Supplementary materials: "During pretraining we used batch sizes of 128, 64 or 32 for episodes of 128, 512 or 1,024 tokens, respectively" Since they seem to be used in equal parts, taking geometric mean: ((128*128)*(64*512)*(32*1024))**(1/3) = 26,008

Výpočty pro trénink

Aritmetika prováděná k trénování modelu, měřená v operacích s plovoucí desetinnou čárkou. Je to měřítko toho, kolik stál tréninkový běh, ne jak rychle hotový model na vás odpovídá.

Výpočty pro trénink
6.5 × 10¹⁹ FLOP

"Pretraining speed on a single GPU (Nvidia Quadro RTX 5000) was 280 protein records per second. We trained the model for 28 days over ∼670M records" 28 * 24 * 3600 * 89 TFLOP/s * 0.3 (assumed utilization) = 6.5e19 https://www.wolframalpha.com/input?i=28+days+*+89+TFLOP%2Fs+*+0.3

Jak bylo ustanoveno
Hardware

Tréninkový běh

Co fyzicky vyžadovalo trénování: které čipy, kolik, jak dlouho a co to vyžadovalo ze zásuvky.

Tréninkový hardware
NVIDIA Quadro RTX 5000
Používané čipy
1
Doba reálného času
672 hours (28 days)

28 days

Příkon
254 W

Dostupnost

Zda můžete získat model a spustit ho na svém vlastním hardwaru, což rozhoduje o tom, zda se některé z čísel grafických karet na této stránce vztahují.

Hmotnosti
Open — downloadable
Přístup k modelu
Open weights (unrestricted)
Tréninkový kód
Open source

MIT license https://github.com/nadavbra/protein_bert

Jak je to klasifikováno

Štítky aplikačních datových sad, které se používají při sledování významných modelů, a jak jistý je ve záznamu.

Proč je to sledováno
SOTA improvement

Table 2: evaluated on TAPE benchmark, not absolute SOTA on all of it, only on Stability (Spearman ρ = 0.76) "ProteinBERT obtains near state-of-the-art performance, and sometimes exceeds it, on multiple benchmarks covering diverse protein properties (including protein structure, post-translational modifications and biophysical attributes)"

Záznam důvěry
Confident
Citace
775

Žrovy

Odkud tento záznam pochází a kdy byl naposledy zkontrolován.

Reference
ProteinBERT: a universal deep-learning model of protein sequence and function
Nap poslední aktualizace
1 January 2026

Extrémy

Co čísla znamenají

Hardwareová stránka

Minimum karta

Tesla C1080

Potřeba paměti

0.7 GB

Nejrychlejší

211,765 tok/s

ProteinBERT dosahuje počtu parametrů 16M. To je dost malé, že hardware je zřídkakdy překážkou, včetně karet starých několik let. Počet karet, které sledujeme, které to mohou spustit: 818.

Na nízkém konci se to řeší pomocí Tesla C1080, s kapacitou VRAM 4 GB, spuštění na kompresi Q8_0 a vyrábějí kolem 2,304 tokenů za sekundu

Na druhém konci sedí B200, generování přibližně 211,765 tokens za sekundu na základě šířky pásma VRAM 8,000 GB/s.

Co je tento MODEL

ProteinBERT byl zveřejněn Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading, v zemi zaznamenané jako Israel, během February 2022. Vydavatelská organizace je kategorizována jako academia,Academia,Industry.

funguje v oblasti Biology, a je zaznamenán jako vykonávající úkol proteins, Protein generation, Protein representation learning.

Váhy jsou zveřejněny, takže si je můžete stáhnout a spustit na své vlastní hardwaru neomezeně, offline, bez připojeného účtu.

Co rozhoduje o rychlosti

Polovina karet, které to drží, zvládne více než 5,946.4 tokens za sekundu. Překračující rychlost čtení rovnou: 818 z nich

Je to hustý model, takže každý parametr je čten pro každý token vyprodukovaný. To dělá rychlost téměř přesně sledovat paměťovou šířku pásma — karta s dvojnásobnou šířkou pásma generuje přibližně dvojnásobně rychle.

Jeho vnitřní architektura není v evidenci, takže paměť je přibližně odhadnuta z počtu parametrů a označena odpovídajícím způsobem. Očekávejte, že skutečná čísla se budou lišit, zejména u dlouhého kontextu.

Trénink a původ

Produkce toho vyžadovala aritmetiku v celkové výši přibližně 6.5 × 10¹⁹ FLOP, na hardwaru zaznamenáno jako NVIDIA Quadro RTX 5000. Tato částka měří, kolik stál výroba modelu, a nemá žádný vliv na to, jak rychle odpovídá.

Tréninková sada běžela na přibližně 37,598,200,000 tokeny textu

Jeho kritérium zahrnutí: sOTA improvement.

Krok za krokem

Jak vybrat GPU pro ProteinBERT

Stůl výše již posoudil každou kartu, pro kterou máme specifikace, proti tomuto modelu. Dostání se k vaší odpovědi trvá šest kroků.

  1. 01

    Přečtěte si nejprve číslo paměti

    Každá KARTA zde byla zkontrolována proti ProteinBERT, potřebující kolem 0.7 GB při kompresi Q8_0. Žádné množství výpočetního výkonu nenahradí kartu, která to nemůže udržet.

  2. 02

    Rozhodněte, jak dlouho vaše konverzace běží

    Nastavte kontext na to, co skutečně použijete. Cache roste s konverzací a to je obvyklý důvod, proč karta, která se zdála v pořádku, přestane vejít. ProteinBERT.

  3. 03

    Rozhodněte, jaké množství komprese přijmete

    Sloupec kvantizace se liší podle KARTY, protože větší KARTA má přesnější kopii., dosahující komprese Q8_0 na nejmenší kartě, která se vejde. Nastavení minimální kvality odstraňuje karty, které pouze splňují tuto kvalitu tím, že ji dále stlačují více, než byste chtěli, a udržuje srovnání na jedné úrovni.

  4. 04

    Hodnoťte podle propustnosti spíše než podle specifikace

    Rychlostní řazení je v podstatě řazením podle šířky pásma paměti, pro ProteinBERT. Nebude to odpovídat hernímu pořádku, protože generace je omezena šířkou pásma paměti. Grafická karta, která vede seznam, je B200, na 211,765 tok/s

  5. 05

    Přečtěte si poslední sloupec fit

    Tight znamená, že se načítá a funguje bez možnosti později zvýšit context length, v případě ProteinBERT. Pohodlný znamená, že můžete později zvětšit kontext. Ten rozdíl má větší význam než pár tokenů za sekundu, takže kupte pro pohodlné, pokud to očekáváte.

  6. 06

    Otevřete kartu, na které jste se usadili.

    Každý název karty odkazuje na její vlastní stránku, která provádí stejný výpočet v celém katalogu modelů. Karta se obvykle kupuje pro více než jeden model, takže se vyplatí se podívat před tím, než koupíte. ProteinBERT.

Odpovědi

ProteinBERT — běžné otázky

01

ProteinBERT— proč se kvantizace liší mezi kartami?

Každá KARTA je zobrazena, jak běží nejméně komprimovaná kopie, kterou může udržet. Počet různých úrovní komprese napříč KARTAMI, které ji vejít: 1. Větší karty získávají přesnější verzi a kvalita podlahy nad piny srovnává na jednu úroveň.

02

ProteinBERT— Jak přesné jsou tyto odhady rychlosti?

Toto jsou odhady s reálnými chybami a kterýkoli z nich může rozumně spadnout kamkoli v jeho publikovaném rozmezí v závislosti na tom, který run AI model použijete. Nejrychlejší výsledek zde: 127,059–338,824 tok/s na B200. Stejný model a karta se liší o třicet až padesát procent v závislosti na softwaru pro inferenci a jeho verzi.

03

ProteinBERT— Jakou GPU potřebuji k jejímu spuštění?

Nejmenší karta v našem katalogu, která to udrží, je Tesla C1080, s kapacitou VRAM 4 GB. Spouští model při kompresi Q8_0 používající přibližně 0.7 GB, a produkuje přibližně 2,304 tokeny za sekundu. Celkový počet karet, které mohou model běžet: 818.

04

ProteinBERT— jak rychle je to na GPU?

Záleží na kartě. Nejrychleji, jak to spočítáme, je B200, přibližně 211,765 tokenů za sekundu; nejpomalejší, který stále běží, zvládá výrazně méně. Rychlost čtení je kolem deseti tokenů za sekundu, a počet karet, které to zvládají: 818.

05

ProteinBERT— kolik VRAM potřebuje?

Potřebuje asi 0.7 GB při kompresi Q8_0, která je ta nejmenší karta, která to používá. Méně komprese vyžaduje více: čísla ve sloupci paměti výše jsou přepočítána pro každou kartu, protože každá drží nejméně komprimovanou verzi, kterou může.

06

ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 8 GB?

Ano. GPU kartu CMP 170HX 8 GB, držení 8 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 39,441 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.

07

ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 12 GB?

Ano. GPU kartu GeForce RTX 3080 Ti, držení 12 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 24,152 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.

08

ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 16 GB?

Ano. GPU kartu Tesla V100 SXM2 16 GB, držení 16 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 29,912 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.

09

ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 24 GB?

Ano. GPU kartu GeForce RTX 5090 D V2, držení 24 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 35,471 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.

10

ProteinBERT— Je to OPEN SOURCE?

Jeho váhy jsou zveřejněny, takže si je lze stáhnout a spustit na vlastním hardwaru. Všimněte si, že open WEIGHTS není totéž co open SOURCE v plném smyslu — neříká nic o tréninkových datech, tréninkovém kódu nebo obchodních podmínkách připojených.

11

ProteinBERT— kolik má parametrů?

Má počet parametrů 16M. "Altogether, it includes ∼16M trainable parameters, making it substantially smaller than other protein language models". Tato cifra je celková a rozhoduje o tom, kolik VRAM model potřebuje — přibližně půl gigabajtu na miliardu při kompresi, kterou většina lidí používá.

12

ProteinBERT— Kdo to vytvořil?

Bylo to publikováno společností Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading, zakládající se na Israel, organizace zařazená jako academia,Academia,Industry.

13

ProteinBERT— Kdy byl vydán?

Bylo to zveřejněno v February 2022. Schopnost na parametr se od té doby výrazně zlepšila, takže novější model stejné velikosti je často lepším využitím stejného hardwaru.

14

ProteinBERT— K čemu se to používá?

funguje v oblasti Biology, a je zaznamenáno jako zpracovávající úkol proteins, Protein generation, Protein representation learning. Toto jsou oblasti, kolem nichž byl navržen; popisují záměr spíše než tvrdou hranici.

15

ProteinBERT— kde si to mohu stáhnout?

Váhy jsou zveřejněny, i když nemáme odkaz na repozitář. Tato stránka vypočítává hardwarové požadavky spíše než aby hostila modelové soubory.

16

ProteinBERT— kolik výpočetního výkonu bylo použito k jeho trénování?

Trénink spotřeboval kolem 6.5 × 10¹⁹ FLOP, na hardwaru zaznamenáno jako NVIDIA Quadro RTX 5000. To měří, co stálo výrobu modelu, a neříká nic o tom, jak rychle odpovídá po natrénování — rychlost inferencí závisí na šířce pásma paměti, nikoli na rozpočtu na trénink.

17

ProteinBERT— Mohu to spustit, pokud se to nevejde do mé GPU?

Může být rozdělen mezi GPU kartu a systémovou paměť, ale v tomto případě se generuje bolestivě pomalu. Každá postava zde předpokládá, že celý model je umístěn na kartě.

18

ProteinBERT— Běhalo by to rychleji na dvou GPU?

Dvě karty koupit paměť spíše než rychlost, což záleží pouze pokud jedna karta to nemůže udržet. Číslo, které může: 818. Takže druhá karta je tu zřídka odpovědí.

Zdroj

Původní publikace

Nahrávka naposledy aktualizována 1 January 2026

Druhý směr

Díváte se na to z druhé strany?

Tato stránka začíná od modelu. Pokud již vlastníte kartu a chcete vědět všechno, co bude spuštěno, začněte raději od hardwaru.