ProteinBERT TPS kalkulátor
Každá karta níže je hodnocena podle tohoto modelu na základě délky kontextu a minimální kvality, kterou si zvolíte. Rychlost je odhad pro jednotlivý požadavek, vypočítaná z paměťové šířky karty a velikosti modelu po kompresi..
Vypočteno pro tento model
818 karty, které máme specifikace pro
Nejmenší karta, která se vejde
Tesla C1080
4 GB · Q8_0 · 2,304 tok/s
Nejrychlejší karta
B200
211,765 tok/s · 180 GB
Které GPU mohou spustit ProteinBERT?
Nastavte vstupy, přečtěte si odpověď
Delší konverzace potřebuje více paměti, což může tento model vytlačit z menších karet..
Skrývá karty, které by se do modelu vešly pouze jeho stlačením pod tento bod.
818 karty odpovídají
Vypočítávání| Potřebuje | Kvantisace | Pohodlné | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
211,765
tok/s
127,059–338,824 · nízká důvěra |
B200 NVIDIA | 180 GB | 8,000 GB/s | Jan 2024 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
211,765
tok/s
127,059–338,824 · nízká důvěra |
B300 NVIDIA | 288 GB | 8,000 GB/s | Sep 2025 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
169,099
tok/s
101,460–270,559 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI350X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
169,099
tok/s
101,460–270,559 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI355X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
135,238
tok/s
81,143–216,381 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI300 AMD | 128 GB | 6,550 GB/s | Jan 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
129,441
tok/s
77,665–207,106 · nízká důvěra |
H200 NVL NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
129,441
tok/s
77,665–207,106 · nízká důvěra |
H200 SXM 141 GB NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
123,882
tok/s
74,329–198,212 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI325X AMD | 256 GB | 6,000 GB/s | Oct 2024 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
109,946
tok/s
65,967–175,913 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI300A AMD | 128 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
109,946
tok/s
65,967–175,913 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI300X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
109,946
tok/s
65,967–175,913 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI308X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
104,294
tok/s
62,576–166,871 · nízká důvěra |
H100 NVL 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,940 GB/s | Mar 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
88,941
tok/s
53,365–142,306 · nízká důvěra |
H100 PCIe 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
88,941
tok/s
53,365–142,306 · nízká důvěra |
H100 SXM5 80 GB NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Oct 2022 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
88,941
tok/s
53,365–142,306 · nízká důvěra |
H100 SXM5 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
88,941
tok/s
53,365–142,306 · nízká důvěra |
H100 SXM5 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
88,941
tok/s
53,365–142,306 · nízká důvěra |
H800 SXM5 NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
67,722
tok/s
40,633–108,356 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI250 AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
67,722
tok/s
40,633–108,356 · nízká důvěra |
Radeon Instinct MI250X AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
56,435
tok/s
33,861–90,296 · nízká důvěra |
Data Center GPU Max 1550 Intel | 128 GB | 3,280 GB/s | Jan 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
55,231
tok/s
33,139–88,369 · nízká důvěra |
Data Center GPU Max Subsystem Intel | 128 GB | 3,210 GB/s | Jan 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
54,000
tok/s
32,400–86,400 · nízká důvěra |
A100 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Nov 2020 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
54,000
tok/s
32,400–86,400 · nízká důvěra |
A100X NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Jun 2021 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
54,000
tok/s
32,400–86,400 · nízká důvěra |
A800 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Aug 2022 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
|
54,000
tok/s
32,400–86,400 · nízká důvěra |
H100 CNX NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Mar 2023 | 0.7 GB | Q8_0 | Pohodlný |
Rychlosti jsou odhady pro jednoho žadatele — jednu konverzaci najednou — vypočítané z šířky pásma paměti, velikosti modelu a kvantizace. Skutečný průchod se liší s výkonem inference a jeho verzí. Čísla zveřejněná výrobci hardwaru měří mnoho simultánních požadavků a jsou mnohem vyšší..
Na záznamu
Plná specifikace
Všechno o tomto modelu v záznamech. Většina z toho popisuje, jak byl trénován, spíše než jak funguje — užitečný kontext pro posouzení, kolik práce do něj bylo vynaloženo, a jak se srovnává s modely postavenými na jiné úrovni..
Původ
Kdo vytvořil tento model, kde a kdy byl publikován.
- Organizace
- Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading
- Typ organizace
- Academia,Academia,Industry
- Země
- Israel, United States of America
- Publikováno
- 10 February 2022
- Autoři
- Nadav Brandes, Dan Ofer, Yam Peleg, Nadav Rappoport, Michal Linial
Co to dělá
Problémové oblasti, pro které byl model vytvořen. Model může obsahovat několik z každého.
- Doména
- Biology
- Úkol
- Proteins, Protein generation, Protein representation learning
- Přístup
- Self-supervised learning
Velikost
Jak velký je model a kolik dat byl trénován. Parametry jsou číslo, které rozhoduje, zda se vejde na danou grafickou kartu.
- parametry
- 16M
- Výcviková data
- 37,598,200,000 tokens
- Epochy
- 6.4
- Velikost dávky
- 26,008
"Altogether, it includes ∼16M trainable parameters, making it substantially smaller than other protein language models"
Number of proteins: 106,000,000 Average protein length: 300 amino acids Total unique tokens = 106,000,000 × 300 = 31,800,000,000 ≈ 3.2e10 tokens
Supplementary materials: "During pretraining we used batch sizes of 128, 64 or 32 for episodes of 128, 512 or 1,024 tokens, respectively" Since they seem to be used in equal parts, taking geometric mean: ((128*128)*(64*512)*(32*1024))**(1/3) = 26,008
Výpočty pro trénink
Aritmetika prováděná k trénování modelu, měřená v operacích s plovoucí desetinnou čárkou. Je to měřítko toho, kolik stál tréninkový běh, ne jak rychle hotový model na vás odpovídá.
- Výpočty pro trénink
- 6.5 × 10¹⁹ FLOP
- Jak bylo ustanoveno
- Hardware
"Pretraining speed on a single GPU (Nvidia Quadro RTX 5000) was 280 protein records per second. We trained the model for 28 days over ∼670M records" 28 * 24 * 3600 * 89 TFLOP/s * 0.3 (assumed utilization) = 6.5e19 https://www.wolframalpha.com/input?i=28+days+*+89+TFLOP%2Fs+*+0.3
Tréninkový běh
Co fyzicky vyžadovalo trénování: které čipy, kolik, jak dlouho a co to vyžadovalo ze zásuvky.
- Tréninkový hardware
- NVIDIA Quadro RTX 5000
- Používané čipy
- 1
- Doba reálného času
- 672 hours (28 days)
- Příkon
- 254 W
28 days
Dostupnost
Zda můžete získat model a spustit ho na svém vlastním hardwaru, což rozhoduje o tom, zda se některé z čísel grafických karet na této stránce vztahují.
- Hmotnosti
- Open — downloadable
- Přístup k modelu
- Open weights (unrestricted)
- Tréninkový kód
- Open source
MIT license https://github.com/nadavbra/protein_bert
Jak je to klasifikováno
Štítky aplikačních datových sad, které se používají při sledování významných modelů, a jak jistý je ve záznamu.
- Proč je to sledováno
- SOTA improvement
- Záznam důvěry
- Confident
- Citace
- 775
Table 2: evaluated on TAPE benchmark, not absolute SOTA on all of it, only on Stability (Spearman ρ = 0.76) "ProteinBERT obtains near state-of-the-art performance, and sometimes exceeds it, on multiple benchmarks covering diverse protein properties (including protein structure, post-translational modifications and biophysical attributes)"
Žrovy
Odkud tento záznam pochází a kdy byl naposledy zkontrolován.
- Reference
- ProteinBERT: a universal deep-learning model of protein sequence and function
- Nap poslední aktualizace
- 1 January 2026
Extrémy
Deset nejrychlejších GPU, které běží ProteinBERT
Seřazeno podle odhadovaných tokenů za sekundu, nejnovější karta první, kde se rychlosti shodují. Protože generování je omezeno šířkou pásma paměti, toto řazení následuje šířku pásma spíše než jakýkoli herní benchmark..
- 01 B300 288 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 211,765 tok/s
- 02 B200 180 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 211,765 tok/s
- 03 Radeon Instinct MI350X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 169,099 tok/s
- 04 Radeon Instinct MI355X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 169,099 tok/s
- 05 Radeon Instinct MI300 128 GB · 6,550 GB/s · Q8_0 135,238 tok/s
- 06 H200 NVL 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 129,441 tok/s
- 07 H200 SXM 141 GB 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 129,441 tok/s
- 08 Radeon Instinct MI325X 256 GB · 6,000 GB/s · Q8_0 123,882 tok/s
- 09 Radeon Instinct MI300A 128 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 109,946 tok/s
- 10 Radeon Instinct MI300X 192 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 109,946 tok/s
Nejmenší GPU, které ještě běží ProteinBERT
Nejlevnější cesta dovnitř, podle kapacity paměti. Těsný fit spustí model, ale nenechá nic navíc na delší konverzaci..
- 01 GeForce RTX 4010 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,541 tok/s
- 02 RTX A400 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,541 tok/s
- 03 RTX 500 Mobile Ada Generation 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 3,388 tok/s
- 04 GeForce RTX 3050 A Mobile 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 5,082 tok/s
- 05 Jetson Orin Nano 4 GB 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 903 tok/s
- 06 Radeon RX 6450M 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,643 tok/s
- 07 Radeon RX 6550M 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,973 tok/s
- 08 Radeon RX 6550S 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,643 tok/s
- 09 Arc A310 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,134 tok/s
- 10 Arc Pro A30M 4 GB · Potřebuje 0.7 GB · Q8_0 · Pohodlný 2,202 tok/s
Co čísla znamenají
Hardwareová stránka
Minimum karta
Tesla C1080
Potřeba paměti
0.7 GB
Nejrychlejší
211,765 tok/s
ProteinBERT dosahuje počtu parametrů 16M. To je dost malé, že hardware je zřídkakdy překážkou, včetně karet starých několik let. Počet karet, které sledujeme, které to mohou spustit: 818.
Na nízkém konci se to řeší pomocí Tesla C1080, s kapacitou VRAM 4 GB, spuštění na kompresi Q8_0 a vyrábějí kolem 2,304 tokenů za sekundu
Na druhém konci sedí B200, generování přibližně 211,765 tokens za sekundu na základě šířky pásma VRAM 8,000 GB/s.
Co je tento MODEL
ProteinBERT byl zveřejněn Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading, v zemi zaznamenané jako Israel, během February 2022. Vydavatelská organizace je kategorizována jako academia,Academia,Industry.
funguje v oblasti Biology, a je zaznamenán jako vykonávající úkol proteins, Protein generation, Protein representation learning.
Váhy jsou zveřejněny, takže si je můžete stáhnout a spustit na své vlastní hardwaru neomezeně, offline, bez připojeného účtu.
Co rozhoduje o rychlosti
Polovina karet, které to drží, zvládne více než 5,946.4 tokens za sekundu. Překračující rychlost čtení rovnou: 818 z nich
Je to hustý model, takže každý parametr je čten pro každý token vyprodukovaný. To dělá rychlost téměř přesně sledovat paměťovou šířku pásma — karta s dvojnásobnou šířkou pásma generuje přibližně dvojnásobně rychle.
Jeho vnitřní architektura není v evidenci, takže paměť je přibližně odhadnuta z počtu parametrů a označena odpovídajícím způsobem. Očekávejte, že skutečná čísla se budou lišit, zejména u dlouhého kontextu.
Trénink a původ
Produkce toho vyžadovala aritmetiku v celkové výši přibližně 6.5 × 10¹⁹ FLOP, na hardwaru zaznamenáno jako NVIDIA Quadro RTX 5000. Tato částka měří, kolik stál výroba modelu, a nemá žádný vliv na to, jak rychle odpovídá.
Tréninková sada běžela na přibližně 37,598,200,000 tokeny textu
Jeho kritérium zahrnutí: sOTA improvement.
Krok za krokem
Jak vybrat GPU pro ProteinBERT
Stůl výše již posoudil každou kartu, pro kterou máme specifikace, proti tomuto modelu. Dostání se k vaší odpovědi trvá šest kroků.
-
01
Přečtěte si nejprve číslo paměti
Každá KARTA zde byla zkontrolována proti ProteinBERT, potřebující kolem 0.7 GB při kompresi Q8_0. Žádné množství výpočetního výkonu nenahradí kartu, která to nemůže udržet.
-
02
Rozhodněte, jak dlouho vaše konverzace běží
Nastavte kontext na to, co skutečně použijete. Cache roste s konverzací a to je obvyklý důvod, proč karta, která se zdála v pořádku, přestane vejít. ProteinBERT.
-
03
Rozhodněte, jaké množství komprese přijmete
Sloupec kvantizace se liší podle KARTY, protože větší KARTA má přesnější kopii., dosahující komprese Q8_0 na nejmenší kartě, která se vejde. Nastavení minimální kvality odstraňuje karty, které pouze splňují tuto kvalitu tím, že ji dále stlačují více, než byste chtěli, a udržuje srovnání na jedné úrovni.
-
04
Hodnoťte podle propustnosti spíše než podle specifikace
Rychlostní řazení je v podstatě řazením podle šířky pásma paměti, pro ProteinBERT. Nebude to odpovídat hernímu pořádku, protože generace je omezena šířkou pásma paměti. Grafická karta, která vede seznam, je B200, na 211,765 tok/s
-
05
Přečtěte si poslední sloupec fit
Tight znamená, že se načítá a funguje bez možnosti později zvýšit context length, v případě ProteinBERT. Pohodlný znamená, že můžete později zvětšit kontext. Ten rozdíl má větší význam než pár tokenů za sekundu, takže kupte pro pohodlné, pokud to očekáváte.
-
06
Otevřete kartu, na které jste se usadili.
Každý název karty odkazuje na její vlastní stránku, která provádí stejný výpočet v celém katalogu modelů. Karta se obvykle kupuje pro více než jeden model, takže se vyplatí se podívat před tím, než koupíte. ProteinBERT.
Odpovědi
ProteinBERT — běžné otázky
ProteinBERT— proč se kvantizace liší mezi kartami?
Každá KARTA je zobrazena, jak běží nejméně komprimovaná kopie, kterou může udržet. Počet různých úrovní komprese napříč KARTAMI, které ji vejít: 1. Větší karty získávají přesnější verzi a kvalita podlahy nad piny srovnává na jednu úroveň.
ProteinBERT— Jak přesné jsou tyto odhady rychlosti?
Toto jsou odhady s reálnými chybami a kterýkoli z nich může rozumně spadnout kamkoli v jeho publikovaném rozmezí v závislosti na tom, který run AI model použijete. Nejrychlejší výsledek zde: 127,059–338,824 tok/s na B200. Stejný model a karta se liší o třicet až padesát procent v závislosti na softwaru pro inferenci a jeho verzi.
ProteinBERT— Jakou GPU potřebuji k jejímu spuštění?
Nejmenší karta v našem katalogu, která to udrží, je Tesla C1080, s kapacitou VRAM 4 GB. Spouští model při kompresi Q8_0 používající přibližně 0.7 GB, a produkuje přibližně 2,304 tokeny za sekundu. Celkový počet karet, které mohou model běžet: 818.
ProteinBERT— jak rychle je to na GPU?
Záleží na kartě. Nejrychleji, jak to spočítáme, je B200, přibližně 211,765 tokenů za sekundu; nejpomalejší, který stále běží, zvládá výrazně méně. Rychlost čtení je kolem deseti tokenů za sekundu, a počet karet, které to zvládají: 818.
ProteinBERT— kolik VRAM potřebuje?
Potřebuje asi 0.7 GB při kompresi Q8_0, která je ta nejmenší karta, která to používá. Méně komprese vyžaduje více: čísla ve sloupci paměti výše jsou přepočítána pro každou kartu, protože každá drží nejméně komprimovanou verzi, kterou může.
ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 8 GB?
Ano. GPU kartu CMP 170HX 8 GB, držení 8 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 39,441 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 12 GB?
Ano. GPU kartu GeForce RTX 3080 Ti, držení 12 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 24,152 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 16 GB?
Ano. GPU kartu Tesla V100 SXM2 16 GB, držení 16 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 29,912 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
ProteinBERT— mohu to spustit na GPU držící 24 GB?
Ano. GPU kartu GeForce RTX 5090 D V2, držení 24 GB, provozuje ho při kompresi Q8_0, používající přibližně 0.7 GB a generováním zhruba 35,471 tokenů za sekundu. Fit je pohodlný.
ProteinBERT— Je to OPEN SOURCE?
Jeho váhy jsou zveřejněny, takže si je lze stáhnout a spustit na vlastním hardwaru. Všimněte si, že open WEIGHTS není totéž co open SOURCE v plném smyslu — neříká nic o tréninkových datech, tréninkovém kódu nebo obchodních podmínkách připojených.
ProteinBERT— kolik má parametrů?
Má počet parametrů 16M. "Altogether, it includes ∼16M trainable parameters, making it substantially smaller than other protein language models". Tato cifra je celková a rozhoduje o tom, kolik VRAM model potřebuje — přibližně půl gigabajtu na miliardu při kompresi, kterou většina lidí používá.
ProteinBERT— Kdo to vytvořil?
Bylo to publikováno společností Hebrew University of Jerusalem,Ben-Gurion University of the Negev,Deep Trading, zakládající se na Israel, organizace zařazená jako academia,Academia,Industry.
ProteinBERT— Kdy byl vydán?
Bylo to zveřejněno v February 2022. Schopnost na parametr se od té doby výrazně zlepšila, takže novější model stejné velikosti je často lepším využitím stejného hardwaru.
ProteinBERT— K čemu se to používá?
funguje v oblasti Biology, a je zaznamenáno jako zpracovávající úkol proteins, Protein generation, Protein representation learning. Toto jsou oblasti, kolem nichž byl navržen; popisují záměr spíše než tvrdou hranici.
ProteinBERT— kde si to mohu stáhnout?
Váhy jsou zveřejněny, i když nemáme odkaz na repozitář. Tato stránka vypočítává hardwarové požadavky spíše než aby hostila modelové soubory.
ProteinBERT— kolik výpočetního výkonu bylo použito k jeho trénování?
Trénink spotřeboval kolem 6.5 × 10¹⁹ FLOP, na hardwaru zaznamenáno jako NVIDIA Quadro RTX 5000. To měří, co stálo výrobu modelu, a neříká nic o tom, jak rychle odpovídá po natrénování — rychlost inferencí závisí na šířce pásma paměti, nikoli na rozpočtu na trénink.
ProteinBERT— Mohu to spustit, pokud se to nevejde do mé GPU?
Může být rozdělen mezi GPU kartu a systémovou paměť, ale v tomto případě se generuje bolestivě pomalu. Každá postava zde předpokládá, že celý model je umístěn na kartě.
ProteinBERT— Běhalo by to rychleji na dvou GPU?
Dvě karty koupit paměť spíše než rychlost, což záleží pouze pokud jedna karta to nemůže udržet. Číslo, které může: 818. Takže druhá karta je tu zřídka odpovědí.
Druhý směr
Díváte se na to z druhé strany?
Tato stránka začíná od modelu. Pokud již vlastníte kartu a chcete vědět všechno, co bude spuštěno, začněte raději od hardwaru.