DNABERT TPS kalkulátor

Nyitott súlyok Northeastern University 110M Paraméterek August 2021

Minden kártyát az alábbiak szerint értékelünk e modell alapján a választott kontextus hossza és minimális minőség szerint. A sebesség egy becslés egyetlen kérésre, amelyet a kártya memória sávszélessége és a modell mérete alapján számítunk ki, miután tömörítettük..

Kiszámítva ehhez a MODElhez

818 kártyák, amelyek futtatni tudják

818 kártyák, amelyek specifikációs adataink vannak

Legkisebb kártya, ami elfér

Tesla C1080

4 GB · Q8_0 · 335 tok/s

Leggyorsabb kártya

B200

30,802 tok/s · 180 GB

Melyik GPU képes futtatni DNABERT?

Állítsa be a bemeneteket, olvassa el a választ

Egy hosszabb beszélgetés több memóriaigényt támaszt, ami kiszoríthatja ezt a modellt a kisebb kártyákról..

Elrejti azokat a GPU-kártyákat, amelyek csak a modellbe illeszkednének a compressziójuk ezen pont alá..

818 kártyák illeszkednek

Számítás
Szükséges Kvantisálás Illeszkedik
30,802 tok/s

18,481–49,283 · alacsony bizalom

B200 NVIDIA 180 GB 8,000 GB/s Jan 2024 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
30,802 tok/s

18,481–49,283 · alacsony bizalom

B300 NVIDIA 288 GB 8,000 GB/s Sep 2025 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
24,596 tok/s

14,758–39,354 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI350X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
24,596 tok/s

14,758–39,354 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI355X AMD 288 GB 8,190 GB/s Jan 2025 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
19,671 tok/s

11,803–31,474 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI300 AMD 128 GB 6,550 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
18,828 tok/s

11,297–30,124 · alacsony bizalom

H200 NVL NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
18,828 tok/s

11,297–30,124 · alacsony bizalom

H200 SXM 141 GB NVIDIA 141 GB 4,890 GB/s Nov 2024 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
18,019 tok/s

10,812–28,831 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI325X AMD 256 GB 6,000 GB/s Oct 2024 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
15,992 tok/s

9,595–25,587 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI300A AMD 128 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
15,992 tok/s

9,595–25,587 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI300X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
15,992 tok/s

9,595–25,587 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI308X AMD 192 GB 5,325 GB/s Dec 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
15,170 tok/s

9,102–24,272 · alacsony bizalom

H100 NVL 94 GB NVIDIA 94 GB 3,940 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
12,937 tok/s

7,762–20,699 · alacsony bizalom

H100 PCIe 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
12,937 tok/s

7,762–20,699 · alacsony bizalom

H100 SXM5 80 GB NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Oct 2022 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
12,937 tok/s

7,762–20,699 · alacsony bizalom

H100 SXM5 94 GB NVIDIA 94 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
12,937 tok/s

7,762–20,699 · alacsony bizalom

H100 SXM5 96 GB NVIDIA 96 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
12,937 tok/s

7,762–20,699 · alacsony bizalom

H800 SXM5 NVIDIA 80 GB 3,360 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
9,851 tok/s

5,910–15,761 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI250 AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
9,851 tok/s

5,910–15,761 · alacsony bizalom

Radeon Instinct MI250X AMD 128 GB 3,280 GB/s Nov 2021 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
8,209 tok/s

4,925–13,134 · alacsony bizalom

Data Center GPU Max 1550 Intel 128 GB 3,280 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
8,034 tok/s

4,820–12,854 · alacsony bizalom

Data Center GPU Max Subsystem Intel 128 GB 3,210 GB/s Jan 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
7,855 tok/s

4,713–12,567 · alacsony bizalom

A100 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Nov 2020 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
7,855 tok/s

4,713–12,567 · alacsony bizalom

A100X NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Jun 2021 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
7,855 tok/s

4,713–12,567 · alacsony bizalom

A800 SXM4 80 GB NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Aug 2022 0.8 GB Q8_0 Kényelmes
7,855 tok/s

4,713–12,567 · alacsony bizalom

H100 CNX NVIDIA 80 GB 2,040 GB/s Mar 2023 0.8 GB Q8_0 Kényelmes

A sebességek egyetlen kérésre - egy beszélgetés egy időben - vonatkozó becslések, amelyeket a MEMORY BANDWIDTH, a MODEL SIZE és a QUANTISATION alapján számítanak ki. A valós áteresztőképesség változik az INFERENCE RUNTIME és annak verziója szerint. A HARDWARE VENDORS által közzétett számok sok párhuzamos kérést mérnek, és sokkal magasabbak..

Nyilvántartásban

Teljes specifikáció

Minden feljegyzett ezzel a modellel kapcsolatban. A legtöbbje azt írja le, hogyan képezték ki, nem pedig azt, hogyan fut — hasznos kontextus annak megítéléséhez, hogy mennyi munka ment bele, és hogyan viszonyul a más méretben épített modellekhez..

Eredet

Ki építette ezt a modellt, hol, és mikor publikálták.

Szervezet
Northeastern University
Szervezet típusa
Academia
Ország
United States of America
Közölt
15 August 2021
Szerzők
Yanrong Ji, Zhihan Zhou, Han Liu, Ramana V Davuluri

Mit csinál

A probléma területek, amelyekre a modell készült. Egy modell több mindegyikből hordozhat.

Tartomány
Biology
Feladat
Protein or nucleotide language model (pLM/nLM)
Numerikus formátum
FP16

Méret

Mekkora a modell, és mennyi adatot használtak a betanításához. A paraméterek azok a számok, amelyek eldöntik, hogy az adott grafikus kártyára illeszkedik-e.

Paraméterek
110M

"We used the same model architecture as the BERT base, which consists of 12 Transformer layers with 768 hidden units and 12 attention heads in each layer, and the same parameter setting across all the four DNABERT models during pre-training" Known to have 110 million parameters as reported in: https://arxiv.org/pdf/1810.04805v2.pdf "We primarily report results on two model sizes: BERTBASE (L=12, H=768, A=12, Total Parameters=110M) [...]"

Képzési adatok
1,444,128,539 tokens

The human genome is around 3 billion base pairs (https://useast.ensembl.org/Homo_sapiens/Info/Annotation). The authors use both non-overlapping sampling and random sampling from a human genome, though the source is unspecified.

Epochok
4.04

Képzés számítás

A modell tanításához végrehajtott aritmetika, lebegőpontos műveletekben mérve. Ez a tanítási futás költségének mértéke, nem pedig annak, hogy mennyire gyorsan válaszol a kész modell.

Képzés számítás
1.1 × 10²⁰ FLOP

"Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)" Assuming FP16 and 30% utilization Calculation = (25 * 24 *3600) s * 2.7e13 FLOP/s per GPU * 8 GPUs * 0.3 utilization = 1.4e20 FLOP Alternatively: "DNABERT takes a sequence with a max length of 512 as input... We pre-trained DNABERT for 120k steps with a batch size of 2000" 6 * 512 * 2000 * 120k * 110M = 8.11e19 Geometric mean: 1.07e20

Hogyan jött létre
Hardware,Operation counting

A tréning futás

Ami fizikailag szükséges volt a betanításhoz: mely chipek, hány, mennyi ideig, és ez mit fogyasztott a falból.

Képzési hardver
NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 11GB
Fali óra idő
600 hours (25 days)

"Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)"

Elérhetőség

Hogy meg tudja-e szerezni a modellt és futtatni a saját hardverén, ez dönt arról, hogy alkalmazhatóak-e a lap ezen oldalán feltüntetett grafikus kártya adatok.

Súlyok
Open — downloadable
Modell hozzáférés
Open weights (unrestricted)
Képzés kód
Open source

Apache 2.0, code and weights: https://github.com/jerryji1993/DNABERT

Hogyan van besorolva

Címkék a forráshalmazra, amelyeket a figyelemre méltó modellek nyomon követésekor alkalmaznak, és hogy mennyire biztos az adatbevitelben.

Miért követik nyomon
SOTA improvement

"We show that the single pre-trained transformers model can simultaneously achieve state-of-the-art performance on prediction of promoters, splice sites and transcription factor binding sites, after easy fine-tuning using small task-specific labeled data." [Abstract] - SOTA improvement on very specific task

Nyilvántartási bizalom
Confident
Hivatkozások
958

Források

Honnan származik ez a felvétel és mikor ellenőrizték utoljára.

Referencia
DNABERT: pre-trained Bidirectional Encoder Representations from Transformers model for DNA-language in genome
Utoljára frissítve
1 January 2026

Az extremitások

Mit jelentenek a számok

Mi szükséges ehhez a modellhez való futtatáshoz

Minimális kártya

Tesla C1080

Szükséges memória

0.8 GB

Leggyorsabb

30,802 tok/s

DNABERT eléri a paraméterek számát 110M. Ez elég kicsi ahhoz, hogy a hardver ritkán legyen az akadály, beleértve a több éves kártyákat is. Azoknak a kártyáknak a száma, amelyeket nyomon követünk, és amelyek el tudják futtatni: 818.

A legkisebb kártya, ami elbírja, az Tesla C1080, memória kapacitással rendelkezik 4 GB, futtatás egy tömörítési arányon Q8_0 és körülbelül előállítva 335 tokenek másodpercenként

A legjobb kategóriájú B200, nagyjából generálás 30,802 másodpercenkénti tokenek egy memória sávszélesség erejében 8,000 GB/s.

Honnan jött

DNABERT ki lett adva által Northeastern University, az országban rögzítve mint United States of America, alatt August 2021. A kiadó kategóriája alá tartozik academia.

Működik a területen a Biology, és úgy van rögzítve, mint a feladat végrehajtása protein or nucleotide language model (pLM/nLM).

A súlyok közzétéve vannak, így letölthető és futtatható a saját hardveren határozatlan ideig, offline, felhasználói fiók nélkül.

A sebességek megértése

Minden olyan kártya esetében, amely képes futtatni, a közép tartományban ül 864.9 másodpercenkénti tokenek 818 tőlük

Minden súly részt vesz minden tokenben itt, így a sávszélesség a teljes történet: az alábbi rangsor lényegében a memória átbocsátóképességének rangsora.

Nélkül az attention elrendezés a nyilvántartásban, a memory oszlop egy közelítés. Elég közel van ahhoz, hogy hardver kiválasztását lehessen végezni, és a leghitványosabb hosszú context esetén.

Képzés és származás

A képzés futás körülbelül 1.1 × 10²⁰ FLOP, hardveren rögzítve NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 11GB. Ez a szám azt méri, hogy mennyibe került a modell előállítása, és nincs hatással arra, hogy milyen gyorsan válaszol.

A képzés körülbelül egy korpuszt fogyasztott 1,444,128,539 szöveg tokenjei

Egy különös okból nyomon követik az alapul szolgáló adatbázisban: sOTA improvement.

Lépésről lépésre

Hogyan válasszunk GPU-t a DNABERT

A fenti táblázat már értékelte az összes kártyát, amelynek specifikációi elérhetők ennek a modellen. A válaszod megszerzése hat lépést igényel..

  1. 01

    Nézd meg, mire van szüksége, mielőtt bármi mást tennél.

    Kezdj a tényleges szükségletekből, ami a követelményének a DNABERT, körülbelül szükséges 0.8 GB a tömörítésnél Q8_0. Ez a szám, nem a kártya címválaszték teljesítménye, az, ami eldönti, hogy fut-e.

  2. 02

    Állítsa be a használt CONTEXT LENGTH-et.

    A hosszabb beszélgetések memóriaigénye van a súlyok szükségletén kívül. Húzd el a csúszkát a valódi munkahosszodra, mielőtt bármelyik sort megbízhatónak tartanád. DNABERT.

  3. 03

    Állítsa be a minőségi minimumot

    A tömörítés az, ami lehetővé teszi, hogy egy modell kisebb kártyákra illeszkedjen, bizonyos költséggel a pontosság terén., elérni egy tömörítést a Q8_0 a legkisebb kártyán, ami elfér. A minimális minőség beállítása eldobja azokat a kártyákat, amelyek csak úgy tudják kezelni, hogy tovább szorítanak, mint amit szeretnél, és egy szinten tartja az összehasonlítást.

  4. 04

    Rendezés sebesség szerint

    A sebességsorrend lényegében egy sorrend a MEMÓRIA-SÁV szerint, a DNABERT. Nem fog illeszkedni egy gaming rendeléshez, mert a generálás a memória sávszélesség által kötött. A listát vezető KÁRTYA B200, at 30,802 tok/s

  5. 05

    Nézd a mozgásteret, ne csak a passzolást.

    A megfelelő oszlop elválasztja azokat a kártyákat, amelyek épp hogy elboldogulnak, azoktól, amelyeknek van szabad helyük, az esetében DNABERT. A Kényelmes azt jelenti, hogy később bővítheted a contextet. Ez a különbség fontosabb, mint néhány token másodpercenként, így kényelmeset vásárolj, ha ezt várod.

  6. 06

    Nézd meg, mit futtat még az a kártya.

    Minden kártyaoldal megismétli ezt a vizsgálatot minden modellre, amelyet birtoklunk, válaszolva arra, hogy mi másra jó a hardver, azon kívül, hogy DNABERT.

Válaszok

DNABERT — gyakori kérdések

01

DNABERT— Futtathatom, ha nem fér el a GPU-mban?

Csak a terhelés áthelyezésével, amely általában téves gazdaságosság: a rendszermemóriában tárolt rész az egészet visszahúzza. Minden ábra azt feltételezi, hogy az egész model a kártyán tartózkodik.

02

DNABERT— Futtatna-e két GPU gyorsabban?

A kapacitás kártyánként összeadódik; a teljesítmény nem. A kártyák számának már saját magukban tartva: 818. Tehát egy második KÁRTYA ritkán a megoldás itt.

03

DNABERT— miért különbözik a kvantálás a kártyák között?

Mivel a kapacitás változik, úgy az is, hogy mennyire kell összenyomni. A fenti táblázatban lévő különböző szintek száma: 1. A nagyobb kártyák a pontosabb verziót kapják, és a minőségi küszöb felett a összehasonlítást egy szinten rögzíti.

04

DNABERT— Mennyire pontosak ezek a sebességbecslések?

Minden szám a memória sávszélességből és a modell méretéből származik, nem benchmarkolták, ezért mindet tartományként tették közzé, nem pedig egyetlen számként. Egy például: 18,481–49,283 tok/s a fájlban B200. Ugyanaz a modell és kártya harminc és ötven százalék között változik a következtetési szoftvertől és annak verziójától függően.

05

DNABERT— Milyen GPU-ra van szükségem, hogy futtathassam?

A katalógusunk legkisebb kártyája, ami ezt tartja, az Tesla C1080, memória kapacitással rendelkezik 4 GB. A modell egy tömörítéssel fut. Q8_0 használva körülbelül 0.8 GB, és körülbelül 335 másodpercenkénti tokenek. A kártyák összes száma, amelyek képesek futtatni. 818.

06

DNABERT— mennyi idő alatt fut a GPU-n?

A kártyától függ. A leggyorsabb, amit számolunk, az B200, körülbelül 30,802 tokenek másodpercenként; a leglassabb, ami még fut, jelentősen kevesebbet képes kezelni. Az olvasási sebesség körülbelül tíz token másodpercenként, és a kártyák száma, amelyek ezt meg tudják tisztítani: 818.

07

DNABERT— mennyi VRAM-ra van szüksége?

Kb. 0.8 GB tömörítési arányban Q8_0, melyik az a legkisebb KÁRTYA, amelyik futtatni tudja. Kevesebb tömörítés több szükséges: a fentebbi memória oszlop számai minden KÁRTYÁRA újraszámításra kerülnek, mert mindegyik tartalmazza a legkevésbé tömörített verziót, amit csak tud.

08

DNABERT— futtathatom egy GPU-n tartva 8 GB?

Igen. A KÁRTYA CMP 170HX 8 GB, tartás 8 GB, futtatja egy tömörítési arány mellett Q8_0, használva körülbelül 0.8 GB és körülbelül generálás 5,737 másodpercenkénti tokenek. A illeszkedés kényelmes.

09

DNABERT— futtathatom egy GPU-n tartva 12 GB?

Igen. A KÁRTYA GeForce RTX 3080 Ti, tartás 12 GB, futtatja egy tömörítési arány mellett Q8_0, használva körülbelül 0.8 GB és körülbelül generálás 3,513 másodpercenkénti tokenek. A illeszkedés kényelmes.

10

DNABERT— futtathatom egy GPU-n tartva 16 GB?

Igen. A KÁRTYA Tesla V100 SXM2 16 GB, tartás 16 GB, futtatja egy tömörítési arány mellett Q8_0, használva körülbelül 0.8 GB és körülbelül generálás 4,351 másodpercenkénti tokenek. A illeszkedés kényelmes.

11

DNABERT— futtathatom egy GPU-n tartva 24 GB?

Igen. A KÁRTYA GeForce RTX 5090 D V2, tartás 24 GB, futtatja egy tömörítési arány mellett Q8_0, használva körülbelül 0.8 GB és körülbelül generálás 5,159 másodpercenkénti tokenek. A illeszkedés kényelmes.

12

DNABERT— Nyílt forráskódú?

Súlyai közzétételre kerültek, így letölthető és futtatható a saját hardvereden. Ne feledd, hogy az open weight nem azonos az open source teljes értelmében — nem mond semmit a tanulási adatokkal, a tanulási kóddal vagy a kereskedelmi feltételekkel kapcsolatban.

13

DNABERT— Hány paramétere van?

Paraméterszáma 110M. "We used the same model architecture as the BERT base, which consists of 12 Transformer layers with 768 hidden units and 12 attention heads in each layer, and the same parameter setting across all the four DNABERT models during pre-training" Known to have 110 million parameters as reported in: https://arxiv.org/pdf/1810.04805v2.pdf "We primarily report results on two model sizes: BERTBASE (L=12, H=768, A=12, Total Parameters=110M) [...]". Ez a szám a teljes összeg, és ez határozza meg, hogy mennyi VRAM-ra van szüksége a modelleknek — körülbelül fél gigabájt milliárdonként a legtöbb ember által használt tömörítési módban.

14

DNABERT— Ki készítette ezt?

Kiadta Northeastern University, alapján United States of America, egy szervezet, amelyet kategorizáltak mint academia.

15

DNABERT— Mikor adták ki?

Kibocsátották a August 2021. A paraméterenkénti képesség lényegesen javult azóta, így egy újabb, azonos méretű modell gyakran jobb felhasználása a same hardvernek.

16

DNABERT— Mire használják?

Működik a területen a Biology, és rögzítve van, hogy kezeli a feladatot protein or nucleotide language model (pLM/nLM). Ezek azok a területek, amelyek köré tervezték; ezek a szándékot írják le, nem pedig egy szigorú határt.

17

DNABERT— Hol tudom letölteni?

A súlyok közzététele megtörtént, bár nem rendelkezünk tárolólinkkel erre. Ez az oldal a hardverkövetelményeket számítja ki, nem pedig modellfájlokat tárol.

18

DNABERT— mennyi számítási kapacitást használtak annak a betanításához?

A képzés körülbelül elfogyasztott 1.1 × 10²⁰ FLOP, hardveren rögzítve NVIDIA GeForce RTX 2080 Ti 11GB. Ez azt méri, hogy mennyibe került a modell előállítása, és semmit nem mond arról, hogy milyen gyorsan válaszol, miután betanult — a következtetési sebesség a memória sávszélességéből származik, nem az edzési költségvetésből.

Forrás

Eredeti kiadvány

Az utolsó frissítés időpontja 1 January 2026

A másik irány

Másik oldalról nézve?

Ez az oldal a modellel kezdődik. Ha már van kártyád, és szeretnéd tudni, hogy mindent futtat-e, Kezdj a hardverből..