DiffBindFR

Otwórz wagi Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences April 2024

Brak oszacowania

Brak wymagań sprzętowych dla tego modelu

Wagi tego modelu są OPEN, ale nie opublikowano liczby parametrów. Każda figura dotycząca MEMORY i prędkości zaczyna się od tej liczby, więc wolelibyśmy nic nie pokazywać niż wymyśloną estymację..

Na nagranie

Pełna specyfikacja

Wszystko na rekord dla tego modelu. Większość z tego opisuje, jak był trenowany, a nie jak działa — użyteczny kontekst do oceny, ile pracy włożono w to, i jak wypada w porównaniu z modelami budowanymi w innym skali..

Pochodzenie

Kto zbudował ten model, gdzie i kiedy został opublikowany.

Organizacja
Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences
Typ organizacji
Academia,Research collective
Kraj
China
Opublikowany
9 April 2024
Autorzy
Jintao Zhu, Zhonghui Gu, Jianfeng Pei, Luhua Lai

Co to robi

Obszary problemowe, dla których stworzono model. Model może mieć kilka z każdego.

Domena
Biology
Zadanie
Protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction

Rozmiar

Jak duży jest model i na ile danych był trenowany. Parametry to liczba, która decyduje, czy mieści się na danej karcie graficznej.

Dane treningowe
tokens

Data points = 16,739 training structures Note: Epochs (1000) not counted as we only consider unique data points 16,739 = 1.674e4

Obliczenia treningowe

Arytmetyka wykonywana w celu wytrenowania modelu, mierzona w operacjach zmiennoprzecinkowych. Jest to miara kosztów przeprowadzenia treningu, a nie tego, jak szybko gotowy model odpowiada na twoje pytania.

Obliczenia treningowe
4 × 10²⁰ FLOP

1. Hardware setup: - Main model: 8× NVIDIA A800 GPUs (7.80×10¹³ FLOP/s per GPU) - MDN model: 4× NVIDIA Tesla V100-SXM2 GPUs (1.25×10¹⁴ FLOP/s per GPU) 2. Training duration (estimated from steps and step time): - Main model: 262,000 steps × 5s = 1.31×10⁶ seconds (~15 days) - MDN model: 65,000 steps × 5s = 3.25×10⁵ seconds (~3.76 days) 3. Utilization rate: 40% 4. Final calculation: Main: 8 GPUs × 7.80×10¹³ FLOP/s × 1.31×10⁶ s × 0.4 = 3.31×10²⁰ FLOPs MDN: 4 GPUs × 1.25×10¹⁴ FLOP/s × 3.25×10⁵ s ×…

Jak to zostało ustalone
Hardware

Dostępność

Czy możesz zdobyć model i uruchomić go na swoim sprzęcie, co decyduje o tym, czy którakolwiek z cyfr karty graficznej na tej stronie ma zastosowanie.

Wagi
Open — downloadable
Dostęp do modelu
Open weights (unrestricted)
Kod treningowy
Unreleased

BSD-3-Clause-Clear license https://github.com/HBioquant/DiffBindFR

Jak jest klasyfikowane

Etykiety, które źródłowy zbiór danych stosuje podczas śledzenia znaczących modeli oraz jak pewny jest tego wpisu.

Zapisz pewność
Confident
Cytaty
16

Źródła

Skąd pochodzi ten rekord i kiedy był ostatnio sprawdzany.

Referencja
DiffBindFR: an SE(3) equivariant network for flexible protein–ligand docking
Ostatnio zaktualizowane
1 December 2025

Co oznaczają liczby

Skąd to pochodzi

DiffBindFR został opublikowany przez Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences, w kraju zapisanym jako China, podczas April 2024. Kategoria, do której należy wydawca, to academia,Research collective.

Działa w dziedzinie Biology, i jest zapisany jako wykonujący zadanie protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction.

Opublikowane wagi oznaczają, że model działa na twojej maszynie, a nie na czyjejś, co sprawia, że poniższe pytanie dotyczące sprzętu jest w ogóle możliwe do odpowiedzi.

Co poszło w budowę tego

Trenowanie zajęło budżet obliczeniowy wynoszący około 4 × 10²⁰ FLOP. Ta liczba mierzy, ile kosztowało wyprodukowanie modelu i nie ma wpływu na to, jak szybko odpowiada.

Odpowiedzi

DiffBindFR — częste pytania

01

DiffBindFR— do czego to służy?

Działa w dziedzinie Biology, i jest zarejestrowany jako realizujący zadanie protein-ligand binding affinity prediction, Protein-ligand contact prediction. To są obszary, wokół których został zaprojektowany; opisują zamiar, a nie twardą granicę.

02

DiffBindFR— Gdzie mogę to pobrać?

Wagi są opublikowane, chociaż nie posiadamy linku do repozytorium. Ta strona oblicza wymagania sprzętowe, a nie hostuje pliki modelu.

03

DiffBindFR— ile mocy obliczeniowej użyto do jego trenowania?

Szkolenie zajęło około 4 × 10²⁰ FLOP. To mierzy, ile kosztowało wyprodukowanie modelu i nie mówi nic o tym, jak szybko odpowiada po wytrenowaniu — prędkość wnioskowania pochodzi z SZEROKOŚCI PASMA, a nie z budżetu treningowego.

04

DiffBindFR— Jaką GPU potrzebuję, aby ją uruchomić?

Nie możemy powiedzieć. Ma otwarte wagi, ale nie opublikowano liczby parametrów, a wszelkie obliczenia pamięci i prędkości zaczynają się od tej liczby. Wolimy nie pokazywać niczego niż fałszywą szacunkową wartość.

05

DiffBindFR— czy jest open weight?

Jego wagi są opublikowane, więc można je pobrać i uruchomić na własnym sprzęcie. Zauważ, że OPEN WEIGHTS nie są tym samym co OPEN SOURCE w pełnym sensie — nie mówi nic o danych treningowych, kodzie treningowym, ani warunkach komercyjnych.

06

DiffBindFR— ile ma parametrów?

Nie opublikowano liczby parametrów, dlatego na tej stronie nie pojawia się żaden wskaźnik pamięci ani prędkości.

07

DiffBindFR— kto to stworzył?

Zostało opublikowane przez Peking University,Tsinghua-Peiking Center for Life Sciences, oparty na China, organizacja sklasyfikowana jako academia,Research collective.

08

DiffBindFR— kiedy to zostało wydane?

Zostało opublikowane w April 2024. Możliwość na parametr znacznie się poprawiła, więc nowszy model tej samej wielkości często lepiej wykorzystuje ten sam sprzęt.

Źródło

Oryginalna publikacja

Ostatnia aktualizacja rekordu 1 December 2025

Druga strona

Patrząc na to z drugiej strony?

Ta strona zaczyna się od modelu. Jeśli już posiadasz kartę i chcesz wiedzieć, co wszystko będzie działać., Zacznij od sprzętu zamiast.