DeepFRI

Otwórz wagi Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT) May 2021

Brak oszacowania

Brak wymagań sprzętowych dla tego modelu

Wagi tego modelu są OPEN, ale nie opublikowano liczby parametrów. Każda figura dotycząca MEMORY i prędkości zaczyna się od tej liczby, więc wolelibyśmy nic nie pokazywać niż wymyśloną estymację..

Na nagranie

Pełna specyfikacja

Wszystko na rekord dla tego modelu. Większość z tego opisuje, jak był trenowany, a nie jak działa — użyteczny kontekst do oceny, ile pracy włożono w to, i jak wypada w porównaniu z modelami budowanymi w innym skali..

Pochodzenie

Kto zbudował ten model, gdzie i kiedy został opublikowany.

Organizacja
Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT)
Typ organizacji
Academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia
Kraj
United States of America, Poland, New Zealand
Opublikowany
26 May 2021
Autorzy
Vladimir Gligorijević, P. Douglas Renfrew, Tomasz Kosciolek, Julia Koehler Leman, Daniel Berenberg, Tommi Vatanen, Chris Chandler, Bryn C. Taylor, Ian M. Fisk, Hera Vlamakis, Ramnik J. Xavier, Rob Knight, Kyunghyun Cho & Richard Bonneau

Co to robi

Obszary problemowe, dla których stworzono model. Model może mieć kilka z każdego.

Domena
Biology
Zadanie
Protein function prediction

Rozmiar

Jak duży jest model i na ile danych był trenowany. Parametry to liczba, która decyduje, czy mieści się na danej karcie graficznej.

Dane treningowe
tokens

30k PDB + 220k SWISS-MODEL = 250k 250k * 0.8 = 200k

Dostępność

Czy możesz zdobyć model i uruchomić go na swoim sprzęcie, co decyduje o tym, czy którakolwiek z cyfr karty graficznej na tej stronie ma zastosowanie.

Wagi
Open — downloadable
Dostęp do modelu
Open weights (unrestricted)
Kod treningowy
Open source

The source code for training the DeepFRI model, together with neural network weights are available for research and non-commercial use at https://github.com/flatironinstitute/DeepFRI (BSD-3-Clause license) and it can be cited by using https://doi.org/10.5281/zenodo.4650027. A web service of our method is available at https://beta.deepfri.flatironinstitute.org/

Jak jest klasyfikowane

Etykiety, które źródłowy zbiór danych stosuje podczas śledzenia znaczących modeli oraz jak pewny jest tego wpisu.

Zapisz pewność
Confident
Cytaty
786

Źródła

Skąd pochodzi ten rekord i kiedy był ostatnio sprawdzany.

Referencja
Structure-based protein function prediction using graph convolutional networks
Ostatnio zaktualizowane
1 January 2026

Co oznaczają liczby

Skąd to pochodzi

DeepFRI został opublikowany przez Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT), w kraju zapisanym jako United States of America, podczas May 2021. Kategoria, do której należy wydawca, to academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia.

Działa w dziedzinie Biology, i jest zapisany jako wykonujący zadanie protein function prediction.

Ponieważ jego wagi zostały udostępnione, nic w kwestii uruchamiania go nie zależy od dostępności dostawcy — należy do ciebie po pobraniu.

Odpowiedzi

DeepFRI — częste pytania

01

DeepFRI— do czego to służy?

Działa w dziedzinie Biology, i jest zarejestrowany jako realizujący zadanie protein function prediction. To są obszary, wokół których został zaprojektowany; opisują zamiar, a nie twardą granicę.

02

DeepFRI— Gdzie mogę to pobrać?

Wagi są opublikowane, chociaż nie posiadamy linku do repozytorium. Ta strona oblicza wymagania sprzętowe, a nie hostuje pliki modelu.

03

DeepFRI— Jaką GPU potrzebuję, aby ją uruchomić?

Nie możemy powiedzieć. Ma otwarte wagi, ale nie opublikowano liczby parametrów, a wszelkie obliczenia pamięci i prędkości zaczynają się od tej liczby. Wolimy nie pokazywać niczego niż fałszywą szacunkową wartość.

04

DeepFRI— czy jest open weight?

Jego wagi są opublikowane, więc można je pobrać i uruchomić na własnym sprzęcie. Zauważ, że OPEN WEIGHTS nie są tym samym co OPEN SOURCE w pełnym sensie — nie mówi nic o danych treningowych, kodzie treningowym, ani warunkach komercyjnych.

05

DeepFRI— ile ma parametrów?

Nie opublikowano liczby parametrów, dlatego na tej stronie nie pojawia się żaden wskaźnik pamięci ani prędkości.

06

DeepFRI— kto to stworzył?

Zostało opublikowane przez Flatiron Institute,University of California San Diego,Jagiellonian University,New York University (NYU),Broad Institute,University of Auckland,Massachusettes General Hospital,Harvard Medical School,Massachusetts Institute of Technology (MIT), oparty na United States of America, organizacja sklasyfikowana jako academia,Academia,Academia,Research collective,Academia,Academia,Academia.

07

DeepFRI— kiedy to zostało wydane?

Zostało opublikowane w May 2021. Możliwość na parametr znacznie się poprawiła, więc nowszy model tej samej wielkości często lepiej wykorzystuje ten sam sprzęt.

Źródło

Oryginalna publikacja

Ostatnia aktualizacja rekordu 1 January 2026

Druga strona

Patrząc na to z drugiej strony?

Ta strona zaczyna się od modelu. Jeśli już posiadasz kartę i chcesz wiedzieć, co wszystko będzie działać., Zacznij od sprzętu zamiast.