BERT-RBP kalkulator TPS
Każda karta poniżej jest oceniana w stosunku do tego modelu przy wybranej długości kontekstu i minimalnej jakości. Prędkość jest oszacowaniem dla pojedynczego żądania, obliczonym na podstawie przepustowości pamięci karty i rozmiaru modelu po skompresowaniu..
Obliczone dla tego modelu
818 Karty, które posiadamy specyfikacje dla
Najmniejsza karta, która pasuje
Tesla C1080
4 GB · Q8_0 · 335 tok/s
Najszybsza karta
B200
30,802 tok/s · 180 GB
Które GPU mogą uruchomić BERT-RBP?
Ustaw wejścia, odczytaj odpowiedź.
Dłuższa rozmowa wymaga więcej MEMORY, co może spowodować, że ten model nie zmieści się na mniejszych CARD..
Ukrywa karty, które zmieściłyby się w modelu tylko przez skompresowanie go poniżej tego punktu..
818 karty pasują
Obliczanie| potrzeby | Kwantyzacja | Pasuje | |||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
30,802
tok/s
18,481–49,283 · niska pewność |
B200 NVIDIA | 180 GB | 8,000 GB/s | Jan 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
30,802
tok/s
18,481–49,283 · niska pewność |
B300 NVIDIA | 288 GB | 8,000 GB/s | Sep 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
24,596
tok/s
14,758–39,354 · niska pewność |
Radeon Instinct MI350X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
24,596
tok/s
14,758–39,354 · niska pewność |
Radeon Instinct MI355X AMD | 288 GB | 8,190 GB/s | Jan 2025 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
19,671
tok/s
11,803–31,474 · niska pewność |
Radeon Instinct MI300 AMD | 128 GB | 6,550 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
18,828
tok/s
11,297–30,124 · niska pewność |
H200 NVL NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
18,828
tok/s
11,297–30,124 · niska pewność |
H200 SXM 141 GB NVIDIA | 141 GB | 4,890 GB/s | Nov 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
18,019
tok/s
10,812–28,831 · niska pewność |
Radeon Instinct MI325X AMD | 256 GB | 6,000 GB/s | Oct 2024 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · niska pewność |
Radeon Instinct MI300A AMD | 128 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · niska pewność |
Radeon Instinct MI300X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
15,992
tok/s
9,595–25,587 · niska pewność |
Radeon Instinct MI308X AMD | 192 GB | 5,325 GB/s | Dec 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
15,170
tok/s
9,102–24,272 · niska pewność |
H100 NVL 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,940 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · niska pewność |
H100 PCIe 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · niska pewność |
H100 SXM5 80 GB NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Oct 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · niska pewność |
H100 SXM5 94 GB NVIDIA | 94 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · niska pewność |
H100 SXM5 96 GB NVIDIA | 96 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
12,937
tok/s
7,762–20,699 · niska pewność |
H800 SXM5 NVIDIA | 80 GB | 3,360 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
9,851
tok/s
5,910–15,761 · niska pewność |
Radeon Instinct MI250 AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
9,851
tok/s
5,910–15,761 · niska pewność |
Radeon Instinct MI250X AMD | 128 GB | 3,280 GB/s | Nov 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
8,209
tok/s
4,925–13,134 · niska pewność |
Data Center GPU Max 1550 Intel | 128 GB | 3,280 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
8,034
tok/s
4,820–12,854 · niska pewność |
Data Center GPU Max Subsystem Intel | 128 GB | 3,210 GB/s | Jan 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · niska pewność |
A100 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Nov 2020 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · niska pewność |
A100X NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Jun 2021 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · niska pewność |
A800 SXM4 80 GB NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Aug 2022 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
|
7,855
tok/s
4,713–12,567 · niska pewność |
H100 CNX NVIDIA | 80 GB | 2,040 GB/s | Mar 2023 | 0.8 GB | Q8_0 | Wygodny |
Prędkości są szacunkami dla pojedynczego zapytania — jednej konwersacji na raz — obliczonymi na podstawie przepustowości pamięci, rozmiaru MODELu i kwantyzacji. Rzeczywista przepustowość różni się w zależności od czasu uruchamiania inference i jego wersji. Wartości publikowane przez dostawców sprzętu mierzą wiele jednoczesnych zapytań i są znacznie wyższe..
Na nagranie
Pełna specyfikacja
Wszystko na rekord dla tego modelu. Większość z tego opisuje, jak był trenowany, a nie jak działa — użyteczny kontekst do oceny, ile pracy włożono w to, i jak wypada w porównaniu z modelami budowanymi w innym skali..
Pochodzenie
Kto zbudował ten model, gdzie i kiedy został opublikowany.
- Organizacja
- Waseda University
- Typ organizacji
- Academia
- Kraj
- Japan
- Opublikowany
- 7 April 2022
- Autorzy
- Keisuke Yamada, Michiaki Hamada
Co to robi
Obszary problemowe, dla których stworzono model. Model może mieć kilka z każdego.
- Domena
- Biology
- Zadanie
- Proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction
- Model bazowy
- DNABERT
Rozmiar
Jak duży jest model i na ile danych był trenowany. Parametry to liczba, która decyduje, czy mieści się na danej karcie graficznej.
- parametry
- 110M
- Dane treningowe
- tokens
- Epoki
- 3
Base model is BERT base (110M parameters), pre-trained on human reference genome (DNABert: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/15/2112/6128680)
RBPs: 154 Sequences per RBP: 15,000 Total sequences = 154 × 15,000 = 2,310,000 Tokens per sequence = 34 Total tokens = 2,310,000 × 34 = 78,540,000 Final estimate: 7.8 × 10⁷ tokens
Obliczenia treningowe
Arytmetyka wykonywana w celu wytrenowania modelu, mierzona w operacjach zmiennoprzecinkowych. Jest to miara kosztów przeprowadzenia treningu, a nie tego, jak szybko gotowy model odpowiada na twoje pytania.
- Obliczenia treningowe
- 1.4 × 10²⁰ FLOP
- Jak to zostało ustalone
- Hardware
- Dostosowywanie obliczeń
- 2.2 × 10¹⁶ FLOP
See DNABert entry: "Since the pre-training of DNABERT model is resource-intensive (about 25 days on 8 NVIDIA 2080Ti GPUs)" Assuming FP16 and 30% utilization Calculation = (25 * 24 *3600) s * 2.7e13 FLOP/s per GPU * 8 GPUs * 0.3 utilization = 1.4e20 FLOP
"The models were trained on four NVIDIA Tesla V100 GPUs (128 GB memory). The training of one RBP model using 19 200 samples took <10 min." Calculation assuming FP16 and 30% utlization and NVIDIA Tesla V100 SMX2 model: 10 min * 60 sec/min * 3.1e13 FLOP/s * 4 GPU * 0.3 utilization = 2.2e16
Dostępność
Czy możesz zdobyć model i uruchomić go na swoim sprzęcie, co decyduje o tym, czy którakolwiek z cyfr karty graficznej na tej stronie ma zastosowanie.
- Wagi
- Open — downloadable
- Dostęp do modelu
- Open weights (non-commercial)
- Kod treningowy
- Open (non-commercial)
No clear license: https://github.com/kkyamada/bert-rbp train script: https://github.com/kkyamada/bert-rbp/blob/master/examples/run_finetune.py data also doesn't have a clear license: http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/RBPsuite/dataset_new.html
Jak jest klasyfikowane
Etykiety, które źródłowy zbiór danych stosuje podczas śledzenia znaczących modeli oraz jak pewny jest tego wpisu.
- Dlaczego to jest śledzone
- SOTA improvement
- Zapisz pewność
- Confident
- Cytaty
- 68
"Our model outperformed state-of-the-art prediction models using the eCLIP-seq data of 154 RBPs" [Abstract] - SOTA improvement on a very specific task "Using the eCLIP-seq data of 154 different RBPs, our model outperformed state-of-the-art methods and the baseline BERT model."
Źródła
Skąd pochodzi ten rekord i kiedy był ostatnio sprawdzany.
- Referencja
- Prediction of RNA–protein interactions using a nucleotide language model
- Ostatnio zaktualizowane
- 1 January 2026
Ekstremy
Dziesięć najszybszych GPU, które uruchamiają BERT-RBP
Uszeregowany według szacowanej liczby tokenów na sekundę, najnowsza karta na pierwszym miejscu, gdy prędkości są równe. Ponieważ generacja jest ograniczona przez pamięć, to uporządkowanie podąża za przepustowością, a nie za jakimkolwiek benchmarkiem gier..
- 01 B300 288 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 30,802 tok/s
- 02 B200 180 GB · 8,000 GB/s · Q8_0 30,802 tok/s
- 03 Radeon Instinct MI350X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 24,596 tok/s
- 04 Radeon Instinct MI355X 288 GB · 8,190 GB/s · Q8_0 24,596 tok/s
- 05 Radeon Instinct MI300 128 GB · 6,550 GB/s · Q8_0 19,671 tok/s
- 06 H200 NVL 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 18,828 tok/s
- 07 H200 SXM 141 GB 141 GB · 4,890 GB/s · Q8_0 18,828 tok/s
- 08 Radeon Instinct MI325X 256 GB · 6,000 GB/s · Q8_0 18,019 tok/s
- 09 Radeon Instinct MI300A 128 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 15,992 tok/s
- 10 Radeon Instinct MI300X 192 GB · 5,325 GB/s · Q8_0 15,992 tok/s
Najmniejsze GPU, które nadal działają BERT-RBP
Najtańsza droga do, według pojemności pamięci. Tight fit uruchamia model, ale nie zostawia nic na dłuższą rozmowę..
- 01 GeForce RTX 4010 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 370 tok/s
- 02 RTX A400 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 370 tok/s
- 03 RTX 500 Mobile Ada Generation 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 493 tok/s
- 04 GeForce RTX 3050 A Mobile 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 739 tok/s
- 05 Jetson Orin Nano 4 GB 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 131 tok/s
- 06 Radeon RX 6450M 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 384 tok/s
- 07 Radeon RX 6550M 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 432 tok/s
- 08 Radeon RX 6550S 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 384 tok/s
- 09 Arc A310 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 310 tok/s
- 10 Arc Pro A30M 4 GB · potrzeby 0.8 GB · Q8_0 · Wygodny 320 tok/s
Co oznaczają liczby
Strona sprzętowa
Minimalna karta
Tesla C1080
Pamięć potrzebna
0.8 GB
Najszybszy
30,802 tok/s
BERT-RBP osiąga liczbę parametrów równą 110M. To jest na tyle małe, że sprzęt rzadko stanowi przeszkodę, w tym na kartach sprzed kilku lat. Liczba kart, które śledzimy, które mogą go uruchomić: 818.
Na niskim końcu obsługiwane jest przez Tesla C1080, o pojemności pamięci 4 GB, uruchomienie go przy kompresji Q8_0 i produkując około 335 tokeny na sekundę
Najszybszy rezultat pochodzi z B200, generowanie w przybliżeniu 30,802 tokenów na sekundę na podstawie przepustowości pamięci 8,000 GB/s.
Co to jest model?
BERT-RBP został opublikowany przez Waseda University, w kraju zapisanym jako Japan, podczas April 2022. Wychodzi z organizacji zaklasyfikowanej jako academia.
Działa w dziedzinie Biology, i jest zapisany jako wykonujący zadanie proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction.
Jego punktem wyjścia był istniejący model podstawowy, DNABERT. Większość modeli w tej skali jest dostosowywana z istniejącej bazy, a nie tworzona od zera.
Otwarte wagi to powód, dla którego ta strona znajduje się w kalkulatorze, a nie tylko w katalogu: jest to model, który możesz faktycznie mieć.
Co decyduje o szybkości
Połowa kart, które go trzymają, osiąga więcej niż 864.9 tokenów na sekundę. Produkując tekst szybciej niż większość ludzi go czyta. 818 ich
To jest gęsty model, więc każdy parametr jest odczytywany dla każdego wyprodukowanego tokena. To sprawia, że prędkość śledzi przepustowość pamięci prawie dokładnie — karta z podwójną przepustowością generuje w przybliżeniu dwa razy szybciej.
Pamięć tutaj jest szacowana na podstawie rozmiaru, a nie obliczana z architektury, która nie jest zarejestrowana dla tego modelu — liczby są wskazujące, a nie dokładne.
Co poszło w budowę tego
Wytworzenie tego wymagało arytmetyki sumującej około 1.4 × 10²⁰ FLOP. Ta liczba mierzy, ile kosztowało wyprodukowanie modelu i nie ma wpływu na to, jak szybko odpowiada.
Jest śledzone w podstawowym zbiorze danych z jednego szczególnego powodu: sOTA improvement.
Krok po kroku
Jak wybrać GPU do BERT-RBP
Tabela powyżej oceniła już każdą kartę, dla której posiadamy specyfikacje, w stosunku do tego modelu. Dotarcie do odpowiedzi wymaga sześciu kroków..
-
01
Przeczytaj najpierw liczbę pamięci
Każda karta tutaj została sprawdzona pod kątem BERT-RBP, potrzebując około 0.8 GB przy kompresji Q8_0. Żadna ilość mocy obliczeniowej nie może zrekompensować karty, która nie może jej pomieścić.
-
02
Zdecyduj, jak długo trwają twoje rozmowy
Rozmowa zajmuje pamięć również, i rośnie w miarę trwania. Ustaw suwak na długość, której się spodziewasz, ponieważ przy długim kontekście karta, która łatwo obsługuje krótkie pytania, może zostać odrzucona przez BERT-RBP.
-
03
Zdecyduj, ile kompresji zaakceptujesz
Kompresja to to, co sprawia, że model mieści się w mniejszych KARTACH, kosztem pewnej dokładności., osiągnięcie kompresji Q8_0 na najmniejszej karcie, która się mieści. Ustalenie minimalnej jakości odrzuca karty, które tylko ją osiągają, uciskając bardziej niż byś chciał, i utrzymuje porównanie na jednym poziomie.
-
04
Sortuj według prędkości
Szybkość zamawiania jest w rzeczywistości zamawianiem według pasma pamięci, dla BERT-RBP. Nie dopasuje się do zamówienia gier, ponieważ generacja jest ograniczona przez przepustowość pamięci. Karta na szczycie listy to B200, w 30,802 tok/s
-
05
Przeczytaj kolumnę dopasowania jako ostatnią
Kolumna dopasowania oddziela karty, które ledwo dają radę, od tych, które mają zapas w przypadku BERT-RBP. Wygodne oznacza, że możesz później zwiększyć kontekst. Ta różnica ma większe znaczenie niż kilka tokenów na sekundę, więc kupuj za wygodne, jeśli tego oczekujesz.
-
06
Zobacz, co jeszcze ta karta uruchamia
Każda strona karty powtarza tę procedurę dla każdego modelu, który posiadamy, odpowiadając, do czego jeszcze sprzęt jest przydatny poza BERT-RBP.
Odpowiedzi
BERT-RBP — częste pytania
BERT-RBP— czy mogę uruchomić to na GPU trzymając 24 GB?
Tak. Karta GeForce RTX 5090 D V2, trzymanie 24 GB, uruchamia go przy kompresji Q8_0, używając około 0.8 GB i generując w przybliżeniu 5,159 tokenów na sekundę. Dopasowanie jest komfortowe.
BERT-RBP— czy jest open weight?
Jego wagi są opublikowane, więc można je pobrać i uruchomić na własnym sprzęcie. Zauważ, że OPEN WEIGHTS nie są tym samym co OPEN SOURCE w pełnym sensie — nie mówi nic o danych treningowych, kodzie treningowym, ani warunkach komercyjnych.
BERT-RBP— ile ma parametrów?
Ma liczbę parametrów równą 110M. Base model is BERT base (110M parameters), pre-trained on human reference genome (DNABert: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/15/2112/6128680). Ta liczba to całkowita, i to ona decyduje o tym, ile pamięci potrzebuje model — mniej więcej pół gigabajta na miliard przy kompresji, którą używa większość ludzi.
BERT-RBP— kto to stworzył?
Zostało opublikowane przez Waseda University, oparty na Japan, organizacja sklasyfikowana jako academia.
BERT-RBP— kiedy to zostało wydane?
Zostało opublikowane w April 2022. Możliwość na parametr znacznie się poprawiła, więc nowszy model tej samej wielkości często lepiej wykorzystuje ten sam sprzęt.
BERT-RBP— do czego to służy?
Działa w dziedzinie Biology, i jest zarejestrowany jako realizujący zadanie proteins, Protein interaction prediction, RNA-Protein interaction prediction. Model może obsługiwać kilka z każdego, więc to są obszary, dla których został zbudowany, a nie ograniczenie tego, co będzie próbował.
BERT-RBP— Gdzie mogę to pobrać?
Wagi są opublikowane, chociaż nie posiadamy linku do repozytorium. Ta strona oblicza wymagania sprzętowe, a nie hostuje pliki modelu.
BERT-RBP— ile mocy obliczeniowej użyto do jego trenowania?
Szkolenie zajęło około 1.4 × 10²⁰ FLOP. To mierzy, ile kosztowało wyprodukowanie modelu i nie mówi nic o tym, jak szybko odpowiada po wytrenowaniu — prędkość wnioskowania pochodzi z SZEROKOŚCI PASMA, a nie z budżetu treningowego.
BERT-RBP— czy mogę go uruchomić, jeśli nie mieści się w moim GPU?
Tylko przez odciążenie, co zwykle jest fałszywą oszczędnością: część trzymana w pamięci systemowej spowalnia cały proces. Każda figura tutaj zakłada, że cały model jest zainstalowany na karcie.
BERT-RBP— czy dwa GPU uruchomią to szybciej?
Druga KARTA mniej więcej podwaja dostępna PAMIĘĆ, ale nie tempo generacji. Liczba już zdolna do uruchomienia jej samodzielnie: 818. Więc druga karta rzadko jest odpowiedzią tutaj.
BERT-RBP— dlaczego kwantyzacja różni się między kartami?
Większa KARTA przechowuje dokładniejszą kopię. Liczba poziomów kompresji używanych w KARTACH, które ją uruchamiają: 1. Większe karty otrzymują dokładniejszą wersję, a minimalna jakość powyżej ustala porównanie na jednym poziomie.
BERT-RBP— Jak dokładne są te szacunki prędkości?
Są obliczane na podstawie specyfikacji, a nie mierzone, i każdy ma zakres. Jeden przykład: 18,481–49,283 tok/s na B200. Ten sam model i karta różnią się o trzydzieści do pięćdziesięciu procent w zależności od oprogramowania inferencyjnego i jego wersji.
BERT-RBP— Jaką GPU potrzebuję, aby ją uruchomić?
Najmniejsza karta w naszym katalogu, która to pomieści, to Tesla C1080, o pojemności pamięci 4 GB. Uruchamia model przy kompresji Q8_0 używając około 0.8 GB, i produkuje w przybliżeniu 335 tokenów na sekundę. Liczba kart, które mogą go uruchomić łącznie: 818.
BERT-RBP— jak szybko działa na GPU?
To zależy od karty. Najszybciej obliczamy to B200, około 30,802 tokenów na sekundę; najwolniejszy, który nadal działa, osiąga znacznie mniej. Prędkość odczytu wynosi około dziesięciu tokenów na sekundę, a liczba kart, które to osiągają: 818.
BERT-RBP— Ile VRAM-u potrzebuje?
Potrzebuje około 0.8 GB przy kompresji Q8_0, który jest najmniejszą kartą, która to uruchamia. Mniej kompresji potrzebuje więcej: liczby w kolumnie pamięci powyżej są przeliczane dla każdej karty, ponieważ każda z nich trzyma wersję o najmniejszej kompresji, jaką może.
BERT-RBP— czy mogę uruchomić to na GPU trzymając 8 GB?
Tak. Karta CMP 170HX 8 GB, trzymanie 8 GB, uruchamia go przy kompresji Q8_0, używając około 0.8 GB i generując w przybliżeniu 5,737 tokenów na sekundę. Dopasowanie jest komfortowe.
BERT-RBP— czy mogę uruchomić to na GPU trzymając 12 GB?
Tak. Karta GeForce RTX 3080 Ti, trzymanie 12 GB, uruchamia go przy kompresji Q8_0, używając około 0.8 GB i generując w przybliżeniu 3,513 tokenów na sekundę. Dopasowanie jest komfortowe.
BERT-RBP— czy mogę uruchomić to na GPU trzymając 16 GB?
Tak. Karta Tesla V100 SXM2 16 GB, trzymanie 16 GB, uruchamia go przy kompresji Q8_0, używając około 0.8 GB i generując w przybliżeniu 4,351 tokenów na sekundę. Dopasowanie jest komfortowe.
Druga strona
Patrząc na to z drugiej strony?
Ta strona zaczyna się od modelu. Jeśli już posiadasz kartę i chcesz wiedzieć, co wszystko będzie działać., Zacznij od sprzętu zamiast.